More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0703 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0703  HflC protein  100 
 
 		 281 aa  552  1e-156  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0629  HflC protein  58.12 
 
 		 283 aa  304  9.000000000000001e-82  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1108  HflC protein  54.95 
 
 		 283 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0998  HflC protein  54.95 
 
 		 283 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1320  HflC protein  47.41 
 
 		 286 aa  266  2.9999999999999995e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.422043  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0002  HflC protein  44.14 
 
 		 281 aa  224  2e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2947  HflC protein  38.87 
 
 		 282 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2459  HflC protein  37.94 
 
 		 290 aa  213  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118766 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3382  HflC protein  36.86 
 
 		 293 aa  211  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0487  HflC protein  42.05 
 
 		 283 aa  210  2e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.426626 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2977  hypothetical protein  39.64 
 
 		 295 aa  210  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2280  HflC protein  36.92 
 
 		 283 aa  202  5e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1091  HflC protein  38.91 
 
 		 284 aa  201  9.999999999999999e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0900  HflC protein  36.1 
 
 		 289 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.219855  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2023  HflC protein  37.28 
 
 		 292 aa  201  1.9999999999999998e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.634094  normal  0.555139 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1574  HflC protein  40.08 
 
 		 300 aa  200  3e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000132487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2039  HflC protein  37.32 
 
 		 318 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.826229 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1941  HflC protein  38.93 
 
 		 294 aa  198  9e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0666  HflC protein  40.65 
 
 		 289 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3351  HflC protein  36.96 
 
 		 311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.713706  normal  0.149829 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0867  HflC protein  40.32 
 
 		 282 aa  195  6e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00264104  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3821  band 7 protein  35.9 
 
 		 301 aa  195  6e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.153561  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2202  hypothetical protein  35.71 
 
 		 293 aa  194  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3261  HflC protein  38.22 
 
 		 300 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.103141  normal  0.242798 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2675  HflC protein  35.61 
 
 		 284 aa  194  2e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0148023 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1586  HflC protein  38.85 
 
 		 294 aa  194  2e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.258127  unclonable  0.000000224598 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1663  HflC protein  36.23 
 
 		 300 aa  191  8e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.107349 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4004  HflC protein  38.28 
 
 		 308 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781168  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6096  protease activity modulator HflK  37.64 
 
 		 311 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0576  HflC protein  36.97 
 
 		 298 aa  189  5e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  hitchhiker  0.000000000249888 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4528  HflC protein  35.13 
 
 		 325 aa  186  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.788095 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2348  hypothetical protein  35.74 
 
 		 298 aa  186  3e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0165  HflC protein  40.23 
 
 		 286 aa  186  4e-46  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00225021  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1955  HflC protein  37.05 
 
 		 294 aa  186  4e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.905613  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0663  HflC protein  34.19 
 
 		 302 aa  186  5e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0721748  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1223  putative serine protease transmembrane protein  35.77 
 
 		 304 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00070103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1280  HflC protein  32.53 
 
 		 297 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.393692  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2727  HflC protein  36.12 
 
 		 299 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772067  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2779  HflC protein  34.38 
 
 		 320 aa  183  3e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1088  HflC protein  32.52 
 
 		 328 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2657  HflC protein  34.03 
 
 		 316 aa  181  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.267381 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0444  HflC protein  35.21 
 
 		 292 aa  181  1e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.653206  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1051  hflC protein  36.4 
 
 		 289 aa  181  1e-44  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1067  HflC protein  34.98 
 
 		 304 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2884  HflC protein  34.03 
 
 		 313 aa  180  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1159  HflC protein  34.63 
 
 		 304 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.712281 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0844  hypothetical protein  35.84 
 
 		 290 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1283  HflC protein  36.24 
 
 		 289 aa  179  2.9999999999999997e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.368114  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3981  HflC protein  36.27 
 
 		 294 aa  179  4e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.515796  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4126  HflC protein  35.21 
 
 		 320 aa  179  5.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3202  HflC protein  35.89 
 
 		 298 aa  178  9e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11004  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2098  HflC protein  33.33 
 
 		 300 aa  178  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0800  HflC protein  36.49 
 
 		 292 aa  177  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00875081  hitchhiker  0.00773647 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3523  HflC protein  32.69 
 
 		 313 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0264  HflC protein  39.13 
 
 		 282 aa  176  4e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0832  hflC protein  36.84 
 
 		 290 aa  176  5e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.379816  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0702  HflC protein  34.1 
 
 		 310 aa  175  6e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.999552  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3537  HflC protein  35.79 
 
 		 292 aa  175  6e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000127879  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00652  Membrane protease, stomatin/prohibitin family protein  31.6 
 
 		 293 aa  175  7e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0674  HflC protein  37.5 
 
 		 289 aa  174  9.999999999999999e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2860  HflC protein  36.33 
 
 		 295 aa  174  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2587  HflC-like protein  34.62 
 
 		 304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0635076  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2766  HflC protein  31.82 
 
 		 291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.147962  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02635  HflC protein  34.17 
 
 		 282 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0575  hypothetical protein  35.31 
 
 		 289 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3890  HflC protein  35.64 
 
 		 297 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000138111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0561  HflC protein  35.64 
 
 		 297 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000351984  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3764  HflC protein  35.64 
 
 		 297 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000648597  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3707  HflC protein  35.64 
 
 		 297 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0600  HflC protein  35.66 
 
 		 297 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00172359  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4939  hflC protein  34.97 
 
 		 289 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.744013  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0606  hflC protein  35.09 
 
 		 297 aa  170  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0356  HflC protein  32.87 
 
 		 340 aa  170  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.534146  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3679  HflC protein  34.49 
 
 		 313 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2000  HflC protein  32.87 
 
 		 340 aa  170  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.491743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3614  HflC protein  34.49 
 
 		 313 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1562  HflC protein  33.33 
 
 		 290 aa  169  3e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000166482 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07570  membrane bound protease regulator HflC  36.36 
 
 		 287 aa  169  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1887  hflC protein  33.33 
 
 		 290 aa  169  3e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0578137  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0601  HflC protein  35.66 
 
 		 297 aa  169  3e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974479  hitchhiker  0.00702769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3429  HflC protein  35.66 
 
 		 297 aa  169  3e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00841397  normal  0.0439963 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3022  hflC protein  35.07 
 
 		 308 aa  169  3e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000029647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3172  HflC protein  34.53 
 
 		 300 aa  169  5e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1988  putative serine protease transmembrane protein  34.09 
 
 		 296 aa  169  5e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0922969  normal  0.083656 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2078  hypothetical protein  32.13 
 
 		 303 aa  169  6e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3308  HflC protein  36.06 
 
 		 292 aa  169  7e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4167  HflC protein  35.44 
 
 		 292 aa  168  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000744211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3671  HflC protein  34.48 
 
 		 369 aa  168  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.150506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2263  HflC protein  32.03 
 
 		 310 aa  167  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00649366  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0488  HflC protein  32.41 
 
 		 295 aa  167  2e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0328  HflC protein  32.59 
 
 		 295 aa  167  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.791365  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2629  HflC protein  34.41 
 
 		 293 aa  166  4e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000539146 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3277  HflC protein  36.7 
 
 		 297 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000125944  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0604  hypothetical protein  34.05 
 
 		 293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.256149 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0886  HflC protein  32.52 
 
 		 340 aa  163  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.340526 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3235  HflC protein  30.14 
 
 		 288 aa  163  3e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000478035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0696  FtsH protease regulator HflC  30.84 
 
 		 334 aa  162  5.0000000000000005e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3795  FtsH protease regulator HflC  30.84 
 
 		 334 aa  162  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3650  FtsH protease regulator HflC  30.84 
 
 		 334 aa  162  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0526  hypothetical protein  35.25 
 
 		 289 aa  162  6e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0925485  normal  0.267523 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>