More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3679 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3679  HflC protein  100 
 
 
313 aa  625  1e-178  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3614  HflC protein  98.4 
 
 
313 aa  617  1e-175  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3523  HflC protein  92.33 
 
 
313 aa  589  1e-167  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2797  HflC protein  47.9 
 
 
332 aa  293  3e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2263  HflC protein  45.48 
 
 
310 aa  292  5e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00649366  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0185  HflC protein  50.67 
 
 
334 aa  290  3e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0314  hflC protein, putative  48.97 
 
 
320 aa  280  2e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0546  HflC protein  42.37 
 
 
329 aa  269  4e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000495565  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2947  HflC protein  34.42 
 
 
282 aa  207  1e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0487  HflC protein  39.86 
 
 
283 aa  207  2e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.426626 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1333  hflC protein, putative  36.45 
 
 
354 aa  201  1.9999999999999998e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.792666  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1574  HflC protein  38.25 
 
 
300 aa  199  5e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000132487  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2023  HflC protein  38.24 
 
 
292 aa  191  9e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.634094  normal  0.555139 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1663  HflC protein  34.32 
 
 
300 aa  185  8e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.107349 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2280  HflC protein  34.63 
 
 
283 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0703  HflC protein  33.98 
 
 
281 aa  182  6e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0002  HflC protein  37.05 
 
 
281 aa  182  8.000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2039  HflC protein  33.66 
 
 
318 aa  179  7e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.826229 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2459  HflC protein  35.74 
 
 
290 aa  177  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.118766 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0900  HflC protein  35.41 
 
 
289 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.219855  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2675  HflC protein  33.33 
 
 
284 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0148023 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2977  hypothetical protein  33.66 
 
 
295 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4004  HflC protein  32.69 
 
 
308 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781168  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3382  HflC protein  34.41 
 
 
293 aa  172  7.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3351  HflC protein  33.44 
 
 
311 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.713706  normal  0.149829 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1108  HflC protein  33.33 
 
 
283 aa  171  2e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0998  HflC protein  33.33 
 
 
283 aa  171  2e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0444  HflC protein  33.22 
 
 
292 aa  169  4e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.653206  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0605  HflC protein  35.03 
 
 
312 aa  168  1e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0249897 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0264  HflC protein  33.9 
 
 
282 aa  167  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0206  HflC protein  32.35 
 
 
323 aa  166  4e-40  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6096  protease activity modulator HflK  33.68 
 
 
311 aa  166  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0800  HflC protein  31.41 
 
 
292 aa  165  8e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00875081  hitchhiker  0.00773647 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3261  HflC protein  31.49 
 
 
300 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.103141  normal  0.242798 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1731  HflC protein  35.4 
 
 
295 aa  163  3e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000316611 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2348  hypothetical protein  32.64 
 
 
298 aa  162  8.000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2202  hypothetical protein  33.77 
 
 
293 aa  162  9e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4167  HflC protein  31.41 
 
 
292 aa  162  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000744211  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1887  hflC protein  31.37 
 
 
290 aa  160  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0578137  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1562  HflC protein  31.37 
 
 
290 aa  160  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000166482 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1586  HflC protein  32.18 
 
 
294 aa  160  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.258127  unclonable  0.000000224598 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2727  HflC protein  31.94 
 
 
299 aa  160  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772067  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1088  HflC protein  31.61 
 
 
328 aa  159  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3022  hflC protein  31.25 
 
 
308 aa  159  7e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000029647  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0629  HflC protein  31.94 
 
 
283 aa  159  8e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00091  serine protease  31.33 
 
 
326 aa  158  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4528  HflC protein  32.48 
 
 
325 aa  158  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.788095 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0867  HflC protein  30.71 
 
 
282 aa  158  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00264104  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0702  HflC protein  32.18 
 
 
310 aa  157  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.999552  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1280  HflC protein  34.73 
 
 
297 aa  157  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.393692  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2098  HflC protein  33.98 
 
 
300 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1941  HflC protein  35.52 
 
 
294 aa  155  7e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4126  HflC protein  32.53 
 
 
320 aa  155  7e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1091  HflC protein  31.15 
 
 
284 aa  155  8e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2657  HflC protein  32.17 
 
 
316 aa  155  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.267381 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2884  HflC protein  32.17 
 
 
313 aa  154  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1955  HflC protein  33.76 
 
 
294 aa  154  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.905613  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002262  HflC protein  32.17 
 
 
326 aa  154  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00114995  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1283  HflC protein  33.23 
 
 
289 aa  153  2.9999999999999998e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.368114  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0600  HflC protein  30.35 
 
 
297 aa  153  4e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00172359  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3537  HflC protein  30.97 
 
 
292 aa  153  5e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000127879  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0165  HflC protein  30.69 
 
 
286 aa  152  5e-36  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00225021  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2779  HflC protein  31.53 
 
 
320 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0606  hflC protein  30.48 
 
 
297 aa  150  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3385  HflC protein  34.04 
 
 
306 aa  150  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.279165  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0674  HflC protein  32.33 
 
 
289 aa  150  4e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2761  hflC protein  29.97 
 
 
326 aa  149  5e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0386111  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00652  Membrane protease, stomatin/prohibitin family protein  28.99 
 
 
293 aa  149  5e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0356  HflC protein  31.09 
 
 
340 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.534146  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2000  HflC protein  31.09 
 
 
340 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.491743  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0601  HflC protein  30.03 
 
 
297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974479  hitchhiker  0.00702769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3429  HflC protein  30.03 
 
 
297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00841397  normal  0.0439963 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0576  HflC protein  34.73 
 
 
298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  hitchhiker  0.000000000249888 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0886  HflC protein  30.77 
 
 
340 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.340526 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2078  hypothetical protein  32.36 
 
 
303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2664  protease subunit HflC  35.28 
 
 
291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3202  HflC protein  30.03 
 
 
298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11004  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0604  hypothetical protein  32.17 
 
 
293 aa  147  3e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.256149 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2766  HflC protein  31.09 
 
 
291 aa  146  4.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.147962  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1988  putative serine protease transmembrane protein  31.21 
 
 
296 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0922969  normal  0.083656 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0663  HflC protein  31.07 
 
 
302 aa  146  5e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0721748  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2860  HflC protein  34.81 
 
 
295 aa  146  5e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0569  HflC protein  29.58 
 
 
292 aa  146  5e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000254764  normal  0.126336 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3277  HflC protein  31.63 
 
 
297 aa  145  6e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000125944  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2774  HflC protein  28.94 
 
 
294 aa  145  8.000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1051  hflC protein  27.85 
 
 
289 aa  144  1e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2629  HflC protein  32.67 
 
 
293 aa  145  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000539146 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0488  HflC protein  30.65 
 
 
295 aa  145  1e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2587  HflC-like protein  31.49 
 
 
304 aa  144  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0635076  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0832  hflC protein  30.45 
 
 
290 aa  142  7e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.379816  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3345  HflC protein  29.18 
 
 
281 aa  142  7e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3707  HflC protein  29.21 
 
 
297 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572982  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3764  HflC protein  29.21 
 
 
297 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000648597  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0561  HflC protein  29.21 
 
 
297 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000351984  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3890  HflC protein  29.21 
 
 
297 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000138111  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1223  putative serine protease transmembrane protein  31.61 
 
 
304 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00070103  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3795  FtsH protease regulator HflC  30 
 
 
334 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3650  FtsH protease regulator HflC  30 
 
 
334 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1178  HflC protein  31.31 
 
 
301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.7077 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0696  FtsH protease regulator HflC  30 
 
 
334 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>