More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3385 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3385  HflC protein  100 
 
 		 306 aa  606  9.999999999999999e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.279165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2202  hypothetical protein  48.8 
 
 		 293 aa  253  3e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1663  HflC protein  46.13 
 
 		 300 aa  251  9.000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.107349 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4004  HflC protein  42.91 
 
 		 308 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781168  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2039  HflC protein  42.55 
 
 		 318 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.826229 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2727  HflC protein  41.22 
 
 		 299 aa  238  8e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772067  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3261  HflC protein  39.8 
 
 		 300 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.103141  normal  0.242798 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2348  hypothetical protein  41.67 
 
 		 298 aa  235  6e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3351  HflC protein  41.82 
 
 		 311 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.713706  normal  0.149829 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6096  protease activity modulator HflK  42.75 
 
 		 311 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2657  HflC protein  40.38 
 
 		 316 aa  231  8.000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.267381 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2884  HflC protein  42.55 
 
 		 313 aa  230  3e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4528  HflC protein  38.71 
 
 		 325 aa  229  6e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.788095 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1088  HflC protein  41.37 
 
 		 328 aa  228  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0605  HflC protein  41.94 
 
 		 312 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0249897 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0702  HflC protein  42.53 
 
 		 310 aa  225  6e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.999552  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2459  HflC protein  41.43 
 
 		 290 aa  223  3e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118766 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2779  HflC protein  38.19 
 
 		 320 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1731  HflC protein  43.63 
 
 		 295 aa  219  6e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000316611 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2977  hypothetical protein  39.36 
 
 		 295 aa  216  5e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0844  hypothetical protein  35.71 
 
 		 290 aa  214  9.999999999999999e-55  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1051  hflC protein  35.71 
 
 		 289 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1574  HflC protein  37.69 
 
 		 300 aa  213  3.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000132487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0487  HflC protein  39.47 
 
 		 283 aa  204  2e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.426626 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1586  HflC protein  39.08 
 
 		 294 aa  203  3e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.258127  unclonable  0.000000224598 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2280  HflC protein  37.41 
 
 		 283 aa  202  4e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0444  HflC protein  37.68 
 
 		 292 aa  202  5e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.653206  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3382  HflC protein  38.06 
 
 		 293 aa  199  6e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2675  HflC protein  36.5 
 
 		 284 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0148023 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0663  HflC protein  37.59 
 
 		 302 aa  195  7e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0721748  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2947  HflC protein  36.36 
 
 		 282 aa  194  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1955  HflC protein  40.15 
 
 		 294 aa  194  1e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.905613  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_002978  WD0832  hflC protein  35.19 
 
 		 290 aa  193  3e-48  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.379816  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0165  HflC protein  37.37 
 
 		 286 aa  193  3e-48  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00225021  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0604  hypothetical protein  38.79 
 
 		 293 aa  192  4e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.256149 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2098  HflC protein  36.46 
 
 		 300 aa  192  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0900  HflC protein  36.59 
 
 		 289 aa  192  5e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.219855  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2000  HflC protein  37.2 
 
 		 340 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.491743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0356  HflC protein  37.2 
 
 		 340 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.534146  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0867  HflC protein  39.52 
 
 		 282 aa  191  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00264104  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2023  HflC protein  38.19 
 
 		 292 aa  191  2e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.634094  normal  0.555139 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0886  HflC protein  37.11 
 
 		 340 aa  189  5e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.340526 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2078  hypothetical protein  37.27 
 
 		 303 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3345  HflC protein  36.62 
 
 		 281 aa  188  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1091  HflC protein  36.43 
 
 		 284 aa  187  2e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3202  HflC protein  36.9 
 
 		 298 aa  187  2e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11004  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2735  protein hflC  36.71 
 
 		 297 aa  186  4e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0491808  normal  0.0307139 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0800  HflC protein  36.46 
 
 		 292 aa  185  8e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00875081  hitchhiker  0.00773647 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0576  HflC protein  38.46 
 
 		 298 aa  185  9e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  hitchhiker  0.000000000249888 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0264  HflC protein  38.04 
 
 		 282 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0601  HflC protein  35.47 
 
 		 297 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974479  hitchhiker  0.00702769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3429  HflC protein  35.47 
 
 		 297 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00841397  normal  0.0439963 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1941  HflC protein  35.9 
 
 		 294 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0606  hflC protein  36.56 
 
 		 297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0002  HflC protein  37.07 
 
 		 281 aa  183  3e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0600  HflC protein  35.14 
 
 		 297 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00172359  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4167  HflC protein  34.64 
 
 		 292 aa  182  6e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000744211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3671  HflC protein  36.27 
 
 		 369 aa  182  8.000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.150506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2766  HflC protein  34.39 
 
 		 291 aa  180  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.147962  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2587  HflC-like protein  36.96 
 
 		 304 aa  179  4e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0635076  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1223  putative serine protease transmembrane protein  35.82 
 
 		 304 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00070103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0569  HflC protein  35.79 
 
 		 292 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000254764  normal  0.126336 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3235  HflC protein  33.94 
 
 		 288 aa  178  9e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000478035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3707  HflC protein  34.95 
 
 		 297 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0561  HflC protein  34.95 
 
 		 297 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000351984  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3764  HflC protein  34.95 
 
 		 297 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000648597  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3172  HflC protein  37.67 
 
 		 300 aa  178  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2664  protease subunit HflC  38.83 
 
 		 291 aa  178  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3890  HflC protein  34.95 
 
 		 297 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000138111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3277  HflC protein  35.81 
 
 		 297 aa  177  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000125944  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00652  Membrane protease, stomatin/prohibitin family protein  33.1 
 
 		 293 aa  177  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0998  HflC protein  34.28 
 
 		 283 aa  177  3e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1108  HflC protein  34.28 
 
 		 283 aa  177  3e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3981  HflC protein  33.1 
 
 		 294 aa  176  4e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.515796  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1320  HflC protein  34.81 
 
 		 286 aa  174  1.9999999999999998e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.422043  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3537  HflC protein  35.51 
 
 		 292 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000127879  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1280  HflC protein  34.8 
 
 		 297 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.393692  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07570  membrane bound protease regulator HflC  35.47 
 
 		 287 aa  172  5.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0328  HflC protein  33.93 
 
 		 295 aa  172  9e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.791365  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3308  HflC protein  35.29 
 
 		 292 aa  171  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1980  hflC protein  36.5 
 
 		 287 aa  170  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0674  HflC protein  33.81 
 
 		 289 aa  167  2e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4891  HflC protein  35.54 
 
 		 289 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.191561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4767  HflC protein  35.54 
 
 		 289 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4943  HflC protein  35.54 
 
 		 289 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00429597 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3022  hflC protein  34.62 
 
 		 308 aa  166  4e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000029647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1283  HflC protein  33.93 
 
 		 289 aa  165  8e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.368114  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1159  HflC protein  34.77 
 
 		 304 aa  165  8e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.712281 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2860  HflC protein  32.65 
 
 		 295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3650  FtsH protease regulator HflC  31.56 
 
 		 334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0696  FtsH protease regulator HflC  31.56 
 
 		 334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1067  HflC protein  32.97 
 
 		 304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3795  FtsH protease regulator HflC  31.56 
 
 		 334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3818  HflC protein  31.02 
 
 		 334 aa  163  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.557877  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5691  FtsH protease regulator HflC  31.02 
 
 		 334 aa  163  3e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.187921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3838  FtsH protease regulator HflC  31.02 
 
 		 334 aa  163  3e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0575  hypothetical protein  32.75 
 
 		 289 aa  163  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4706  FtsH protease regulator HflC  31.02 
 
 		 334 aa  163  3e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2629  HflC protein  34.02 
 
 		 293 aa  163  3e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000539146 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4733  FtsH protease regulator HflC  31.02 
 
 		 334 aa  163  3e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>