More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0328 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0328  HflC protein  100 
 
 		 295 aa  596  1e-169  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.791365  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00652  Membrane protease, stomatin/prohibitin family protein  65.85 
 
 		 293 aa  411  1e-114  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3202  HflC protein  65.29 
 
 		 298 aa  387  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11004  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3890  HflC protein  62.54 
 
 		 297 aa  378  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000138111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3707  HflC protein  62.54 
 
 		 297 aa  378  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3764  HflC protein  62.54 
 
 		 297 aa  378  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000648597  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0601  HflC protein  61.95 
 
 		 297 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974479  hitchhiker  0.00702769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3429  HflC protein  61.95 
 
 		 297 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00841397  normal  0.0439963 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0561  HflC protein  62.54 
 
 		 297 aa  378  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000351984  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0606  hflC protein  62.2 
 
 		 297 aa  376  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3981  HflC protein  60.21 
 
 		 294 aa  374  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.515796  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3308  HflC protein  65.58 
 
 		 292 aa  371  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0600  HflC protein  60.94 
 
 		 297 aa  372  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00172359  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3537  HflC protein  60.55 
 
 		 292 aa  368  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000127879  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4167  HflC protein  60.63 
 
 		 292 aa  364  1e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000744211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0800  HflC protein  60.84 
 
 		 292 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00875081  hitchhiker  0.00773647 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3277  HflC protein  61.28 
 
 		 297 aa  361  8e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000125944  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3235  HflC protein  59.58 
 
 		 288 aa  360  1e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000478035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3022  hflC protein  60.63 
 
 		 308 aa  352  5e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000029647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0569  HflC protein  57.44 
 
 		 292 aa  351  1e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000254764  normal  0.126336 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0488  HflC protein  56.7 
 
 		 295 aa  328  5.0000000000000004e-89  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0434  FtsH protease regulator HflC  51.79 
 
 		 335 aa  322  4e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.476328  unclonable  0.0000000374568 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3795  FtsH protease regulator HflC  50.45 
 
 		 334 aa  320  1.9999999999999998e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0696  FtsH protease regulator HflC  50.45 
 
 		 334 aa  320  1.9999999999999998e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3650  FtsH protease regulator HflC  50.45 
 
 		 334 aa  320  1.9999999999999998e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04042  modulator for HflB protease specific for phage lambda cII repressor  53.55 
 
 		 334 aa  315  4e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.040502  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3818  HflC protein  53.55 
 
 		 334 aa  315  4e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.557877  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4733  FtsH protease regulator HflC  53.55 
 
 		 334 aa  315  4e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3838  FtsH protease regulator HflC  53.55 
 
 		 334 aa  315  4e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5691  FtsH protease regulator HflC  53.55 
 
 		 334 aa  315  4e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.187921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4706  FtsH protease regulator HflC  53.55 
 
 		 334 aa  315  4e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4417  FtsH protease regulator HflC  53.55 
 
 		 334 aa  315  4e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04004  hypothetical protein  53.55 
 
 		 334 aa  315  4e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.054912  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4646  FtsH protease regulator HflC  53.55 
 
 		 334 aa  315  4e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.175793 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0578  FtsH protease regulator HflC  49.24 
 
 		 333 aa  312  3.9999999999999997e-84  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002262  HflC protein  50.94 
 
 		 326 aa  312  4.999999999999999e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00114995  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2761  hflC protein  50.47 
 
 		 326 aa  310  1e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0386111  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00091  serine protease  49.85 
 
 		 326 aa  310  2.9999999999999997e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4725  FtsH protease regulator HflC  52.08 
 
 		 334 aa  309  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0538  FtsH protease regulator HflC  49.85 
 
 		 331 aa  309  4e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.255691  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4642  FtsH protease regulator HflC  52.08 
 
 		 334 aa  309  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4632  FtsH protease regulator HflC  52.08 
 
 		 334 aa  309  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4782  FtsH protease regulator HflC  52.08 
 
 		 334 aa  309  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220935  normal  0.242 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4761  FtsH protease regulator HflC  52.08 
 
 		 334 aa  309  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0358  FtsH protease regulator HflC  51.45 
 
 		 334 aa  306  2.0000000000000002e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.470776  hitchhiker  0.00397927 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2774  HflC protein  50.69 
 
 		 294 aa  305  5.0000000000000004e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3718  FtsH protease regulator HflC  48.76 
 
 		 331 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0820553  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3916  FtsH protease regulator HflC  48.45 
 
 		 331 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.32908  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0495  FtsH protease regulator HflC  50.98 
 
 		 331 aa  296  3e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1091  HflC protein  48.08 
 
 		 284 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3382  HflC protein  48.6 
 
 		 293 aa  276  4e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2977  hypothetical protein  44.6 
 
 		 295 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0525  membrane protease subunit HflC  46.83 
 
 		 304 aa  270  2e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0444  HflC protein  47.96 
 
 		 292 aa  270  2e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.653206  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0549  membrane protease subunit HflC  46.48 
 
 		 304 aa  268  7e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0663  HflC protein  44.14 
 
 		 302 aa  262  4e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0721748  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07570  membrane bound protease regulator HflC  47.29 
 
 		 287 aa  261  1e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1280  HflC protein  42.95 
 
 		 297 aa  261  1e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.393692  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1586  HflC protein  51.24 
 
 		 294 aa  256  3e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.258127  unclonable  0.000000224598 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0576  HflC protein  46.02 
 
 		 298 aa  253  3e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  hitchhiker  0.000000000249888 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2766  HflC protein  45.58 
 
 		 291 aa  252  6e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.147962  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2587  HflC-like protein  44.89 
 
 		 304 aa  250  2e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0635076  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2664  protease subunit HflC  45.26 
 
 		 291 aa  249  3e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4939  hflC protein  45.67 
 
 		 289 aa  249  4e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.744013  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0575  hypothetical protein  44.98 
 
 		 289 aa  249  4e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4682  HflC protein  46.86 
 
 		 289 aa  249  5e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0900  HflC protein  44.68 
 
 		 289 aa  247  1e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.219855  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0526  hypothetical protein  45.96 
 
 		 289 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0925485  normal  0.267523 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2629  HflC protein  46.02 
 
 		 293 aa  243  3.9999999999999997e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000539146 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4891  HflC protein  47.22 
 
 		 289 aa  242  5e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.191561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4767  HflC protein  47.22 
 
 		 289 aa  242  5e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4943  HflC protein  46.85 
 
 		 289 aa  241  9e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00429597 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0604  hypothetical protein  43.9 
 
 		 293 aa  238  8e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.256149 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2098  HflC protein  42.11 
 
 		 300 aa  235  7e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2078  hypothetical protein  42.25 
 
 		 303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1223  putative serine protease transmembrane protein  41.44 
 
 		 304 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00070103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65270  protease subunit HflC  46.91 
 
 		 289 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5670  protease subunit HflC  46.55 
 
 		 289 aa  231  9e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1980  hflC protein  45.42 
 
 		 287 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1283  HflC protein  42.61 
 
 		 289 aa  225  7e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.368114  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1067  HflC protein  40.41 
 
 		 304 aa  225  8e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0674  HflC protein  42.25 
 
 		 289 aa  224  2e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1159  HflC protein  40.07 
 
 		 304 aa  223  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.712281 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1941  HflC protein  42.01 
 
 		 294 aa  223  3e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0638  HflC protein  45.17 
 
 		 289 aa  221  8e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0112821 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02635  HflC protein  39.16 
 
 		 282 aa  216  5e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2860  HflC protein  38.64 
 
 		 295 aa  216  5e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2459  HflC protein  38.81 
 
 		 290 aa  213  2.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118766 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3015  HflC protein  37.85 
 
 		 287 aa  211  1e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.698845  normal  0.140863 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1721  HflC protein  38.36 
 
 		 287 aa  207  2e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1178  HflC protein  41.08 
 
 		 301 aa  207  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.7077 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1786  integral membrane proteinase  38.36 
 
 		 287 aa  205  8e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1988  putative serine protease transmembrane protein  40.14 
 
 		 296 aa  204  1e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0922969  normal  0.083656 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4528  HflC protein  37.59 
 
 		 325 aa  202  4e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.788095 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0605  HflC protein  39.05 
 
 		 312 aa  202  4e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0249897 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3261  HflC protein  37.5 
 
 		 300 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.103141  normal  0.242798 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2039  HflC protein  37.5 
 
 		 318 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.826229 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1098  HflC protein  41.41 
 
 		 301 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2947  HflC protein  39.21 
 
 		 282 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2010  HflC protein  38.33 
 
 		 293 aa  199  5e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0721507  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>