More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0495 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0495  FtsH protease regulator HflC  100 
 
 
331 aa  671    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0538  FtsH protease regulator HflC  91.24 
 
 
331 aa  597  1e-169  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.255691  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3718  FtsH protease regulator HflC  87.92 
 
 
331 aa  579  1e-164  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0820553  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3916  FtsH protease regulator HflC  87.61 
 
 
331 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.32908  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0434  FtsH protease regulator HflC  82.18 
 
 
335 aa  541  1e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.476328  unclonable  0.0000000374568 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0696  FtsH protease regulator HflC  80.66 
 
 
334 aa  525  1e-148  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3795  FtsH protease regulator HflC  80.66 
 
 
334 aa  525  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3650  FtsH protease regulator HflC  80.66 
 
 
334 aa  525  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4761  FtsH protease regulator HflC  76.79 
 
 
334 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4642  FtsH protease regulator HflC  76.79 
 
 
334 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4725  FtsH protease regulator HflC  76.79 
 
 
334 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4782  FtsH protease regulator HflC  76.79 
 
 
334 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220935  normal  0.242 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4632  FtsH protease regulator HflC  76.79 
 
 
334 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04042  modulator for HflB protease specific for phage lambda cII repressor  79.09 
 
 
334 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.040502  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3818  HflC protein  79.09 
 
 
334 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.557877  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3838  FtsH protease regulator HflC  79.09 
 
 
334 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0358  FtsH protease regulator HflC  79.09 
 
 
334 aa  507  9.999999999999999e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.470776  hitchhiker  0.00397927 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5691  FtsH protease regulator HflC  79.09 
 
 
334 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.187921  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4417  FtsH protease regulator HflC  79.09 
 
 
334 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4706  FtsH protease regulator HflC  79.09 
 
 
334 aa  506  9.999999999999999e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04004  hypothetical protein  79.09 
 
 
334 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.054912  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0578  FtsH protease regulator HflC  75.68 
 
 
333 aa  506  9.999999999999999e-143  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4733  FtsH protease regulator HflC  79.09 
 
 
334 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4646  FtsH protease regulator HflC  79.09 
 
 
334 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.175793 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0488  HflC protein  52.45 
 
 
295 aa  347  1e-94  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002262  HflC protein  51.37 
 
 
326 aa  331  1e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00114995  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2761  hflC protein  50.31 
 
 
326 aa  326  3e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0386111  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00091  serine protease  51.23 
 
 
326 aa  323  3e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00652  Membrane protease, stomatin/prohibitin family protein  52.98 
 
 
293 aa  320  9.999999999999999e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2774  HflC protein  48.77 
 
 
294 aa  318  7e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3537  HflC protein  51.39 
 
 
292 aa  318  1e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000127879  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4167  HflC protein  49.54 
 
 
292 aa  311  6.999999999999999e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000744211  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3764  HflC protein  50.3 
 
 
297 aa  310  2e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000648597  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3707  HflC protein  50.3 
 
 
297 aa  310  2e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572982  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3890  HflC protein  50.3 
 
 
297 aa  310  2e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000138111  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0561  HflC protein  50.3 
 
 
297 aa  310  2e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000351984  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0600  HflC protein  49.39 
 
 
297 aa  310  2e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00172359  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0606  hflC protein  49.53 
 
 
297 aa  309  4e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3202  HflC protein  50.78 
 
 
298 aa  306  3e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11004  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0800  HflC protein  48.31 
 
 
292 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00875081  hitchhiker  0.00773647 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0569  HflC protein  49.22 
 
 
292 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000254764  normal  0.126336 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3981  HflC protein  49.07 
 
 
294 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.515796  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0601  HflC protein  48.77 
 
 
297 aa  301  8.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974479  hitchhiker  0.00702769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3429  HflC protein  48.77 
 
 
297 aa  301  8.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00841397  normal  0.0439963 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3277  HflC protein  49.69 
 
 
297 aa  301  9e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000125944  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3235  HflC protein  47.35 
 
 
288 aa  300  3e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000478035  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0328  HflC protein  51.96 
 
 
295 aa  299  5e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.791365  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3308  HflC protein  50.16 
 
 
292 aa  298  6e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3022  hflC protein  48.55 
 
 
308 aa  293  3e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000029647  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0549  membrane protease subunit HflC  39.34 
 
 
304 aa  234  1.0000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0525  membrane protease subunit HflC  39.34 
 
 
304 aa  232  6e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1280  HflC protein  39.18 
 
 
297 aa  228  7e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.393692  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2664  protease subunit HflC  39.82 
 
 
291 aa  228  8e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1091  HflC protein  38.01 
 
 
284 aa  227  2e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0663  HflC protein  38.65 
 
 
302 aa  223  4e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0721748  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2977  hypothetical protein  39.87 
 
 
295 aa  221  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0576  HflC protein  39.51 
 
 
298 aa  219  5e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  hitchhiker  0.000000000249888 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07570  membrane bound protease regulator HflC  39.22 
 
 
287 aa  212  7e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2629  HflC protein  38.24 
 
 
293 aa  211  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000539146 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2766  HflC protein  35.67 
 
 
291 aa  208  1e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.147962  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1586  HflC protein  37.22 
 
 
294 aa  205  7e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.258127  unclonable  0.000000224598 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0444  HflC protein  36.25 
 
 
292 aa  204  1e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.653206  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0604  hypothetical protein  36.92 
 
 
293 aa  202  7e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.256149 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3382  HflC protein  38.73 
 
 
293 aa  202  8e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2098  HflC protein  35.67 
 
 
300 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4939  hflC protein  38.36 
 
 
289 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.744013  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0526  hypothetical protein  39.09 
 
 
289 aa  200  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0925485  normal  0.267523 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0575  hypothetical protein  37.74 
 
 
289 aa  199  7e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2587  HflC-like protein  36.3 
 
 
304 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0635076  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0638  HflC protein  40.38 
 
 
289 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0112821 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1980  hflC protein  37.5 
 
 
287 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0900  HflC protein  37.3 
 
 
289 aa  194  1e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.219855  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1721  HflC protein  36.31 
 
 
287 aa  193  4e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4682  HflC protein  37.91 
 
 
289 aa  193  4e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1786  integral membrane proteinase  35.89 
 
 
287 aa  193  4e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2078  hypothetical protein  35.53 
 
 
303 aa  192  6e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0487  HflC protein  36.18 
 
 
283 aa  192  6e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.426626 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4943  HflC protein  38.94 
 
 
289 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00429597 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5670  protease subunit HflC  38.51 
 
 
289 aa  192  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65270  protease subunit HflC  38.51 
 
 
289 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4891  HflC protein  39.25 
 
 
289 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.191561  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4767  HflC protein  39.25 
 
 
289 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02635  HflC protein  35.85 
 
 
282 aa  189  5e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1663  HflC protein  36.68 
 
 
300 aa  187  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.107349 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4004  HflC protein  34.98 
 
 
308 aa  186  6e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781168  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2459  HflC protein  34.92 
 
 
290 aa  185  8e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.118766 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2348  hypothetical protein  36.39 
 
 
298 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2039  HflC protein  34.36 
 
 
318 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.826229 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2727  HflC protein  35.58 
 
 
299 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772067  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3015  HflC protein  34.46 
 
 
287 aa  183  3e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.698845  normal  0.140863 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3261  HflC protein  33.72 
 
 
300 aa  182  7e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.103141  normal  0.242798 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2947  HflC protein  34.06 
 
 
282 aa  181  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3172  HflC protein  34.46 
 
 
300 aa  181  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1223  putative serine protease transmembrane protein  34.67 
 
 
304 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00070103  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2010  HflC protein  36.39 
 
 
293 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0721507  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2202  hypothetical protein  36.5 
 
 
293 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2675  HflC protein  34.59 
 
 
284 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0148023 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3351  HflC protein  33.43 
 
 
311 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.713706  normal  0.149829 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0605  HflC protein  35.83 
 
 
312 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0249897 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1562  HflC protein  33.64 
 
 
290 aa  179  8e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000166482 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>