More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0923 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0923  putative HflC protein  100 
 
 
290 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1396  hflC protein  45.55 
 
 
300 aa  242  3.9999999999999997e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.685975  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1352  HflC protein  45.55 
 
 
300 aa  242  3.9999999999999997e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1795  HflC protein  46.52 
 
 
300 aa  233  3e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2816  HFLC protein  46.83 
 
 
305 aa  226  4e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.273715  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2017  HflC protein  45.89 
 
 
310 aa  221  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2799  HflC protein  42.12 
 
 
321 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.565333 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1748  HflC protein  47.95 
 
 
328 aa  209  3e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.224393  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2540  HflC protein  43.07 
 
 
319 aa  208  8e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.713322  normal  0.756997 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2459  HflC protein  35.74 
 
 
290 aa  167  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.118766 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1663  HflC protein  36.43 
 
 
300 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.107349 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4528  HflC protein  37.76 
 
 
325 aa  166  5e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.788095 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0605  HflC protein  36.86 
 
 
312 aa  159  4e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0249897 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2202  hypothetical protein  37 
 
 
293 aa  159  4e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1955  HflC protein  35.44 
 
 
294 aa  159  4e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.905613  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2657  HflC protein  38.41 
 
 
316 aa  159  5e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.267381 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4004  HflC protein  37.41 
 
 
308 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781168  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2884  HflC protein  38.41 
 
 
313 aa  159  5e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6096  protease activity modulator HflK  38.52 
 
 
311 aa  159  5e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3261  HflC protein  37.72 
 
 
300 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.103141  normal  0.242798 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0604  hypothetical protein  35.11 
 
 
293 aa  157  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.256149 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1088  HflC protein  36.49 
 
 
328 aa  156  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3351  HflC protein  37.59 
 
 
311 aa  155  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.713706  normal  0.149829 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2779  HflC protein  36.69 
 
 
320 aa  155  6e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2039  HflC protein  37.23 
 
 
318 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.826229 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0444  HflC protein  32.16 
 
 
292 aa  154  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.653206  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2348  hypothetical protein  36.67 
 
 
298 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2977  hypothetical protein  33.8 
 
 
295 aa  152  4e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3172  HflC protein  35.69 
 
 
300 aa  152  7e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0844  hypothetical protein  31.94 
 
 
290 aa  151  8.999999999999999e-36  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2098  HflC protein  34.15 
 
 
300 aa  151  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3718  FtsH protease regulator HflC  31.48 
 
 
331 aa  150  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0820553  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1320  HflC protein  33.08 
 
 
286 aa  150  3e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.422043  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1586  HflC protein  34.59 
 
 
294 aa  150  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.258127  unclonable  0.000000224598 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2078  hypothetical protein  34.75 
 
 
303 aa  149  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1108  HflC protein  30.14 
 
 
283 aa  149  4e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0998  HflC protein  30.14 
 
 
283 aa  149  4e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3916  FtsH protease regulator HflC  31.17 
 
 
331 aa  149  8e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.32908  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2727  HflC protein  36.67 
 
 
299 aa  148  9e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772067  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1731  HflC protein  35.06 
 
 
295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000316611 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1091  HflC protein  34.15 
 
 
284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0629  HflC protein  32.82 
 
 
283 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3382  HflC protein  32.06 
 
 
293 aa  145  8.000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0702  HflC protein  36.53 
 
 
310 aa  145  9e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.999552  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02635  HflC protein  33.33 
 
 
282 aa  145  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1280  HflC protein  32.17 
 
 
297 aa  144  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.393692  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1051  hflC protein  32.16 
 
 
289 aa  143  4e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0434  FtsH protease regulator HflC  30.65 
 
 
335 aa  143  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.476328  unclonable  0.0000000374568 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2587  HflC-like protein  32.32 
 
 
304 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0635076  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2664  protease subunit HflC  30.93 
 
 
291 aa  140  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2766  HflC protein  32.62 
 
 
291 aa  140  3.9999999999999997e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.147962  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0666  HflC protein  31.63 
 
 
289 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3671  HflC protein  35.61 
 
 
369 aa  139  4.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.150506  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0703  HflC protein  29.24 
 
 
281 aa  139  7.999999999999999e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1223  putative serine protease transmembrane protein  32.75 
 
 
304 aa  139  7.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00070103  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1178  HflC protein  35.17 
 
 
301 aa  138  8.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.7077 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2735  protein hflC  34.16 
 
 
297 aa  138  8.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0491808  normal  0.0307139 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07570  membrane bound protease regulator HflC  33.71 
 
 
287 aa  138  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0538  FtsH protease regulator HflC  29.69 
 
 
331 aa  138  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.255691  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1283  HflC protein  33.69 
 
 
289 aa  138  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.368114  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0900  HflC protein  35.23 
 
 
289 aa  138  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.219855  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0696  FtsH protease regulator HflC  31.63 
 
 
334 aa  137  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1988  putative serine protease transmembrane protein  32.75 
 
 
296 aa  137  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0922969  normal  0.083656 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3650  FtsH protease regulator HflC  31.63 
 
 
334 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3795  FtsH protease regulator HflC  31.63 
 
 
334 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2774  HflC protein  29.86 
 
 
294 aa  137  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65270  protease subunit HflC  33.58 
 
 
289 aa  136  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2947  HflC protein  31.65 
 
 
282 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5670  protease subunit HflC  32.97 
 
 
289 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2023  HflC protein  33.1 
 
 
292 aa  135  8e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.634094  normal  0.555139 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3015  HflC protein  31.32 
 
 
287 aa  134  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.698845  normal  0.140863 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2299  HflC protein  31.82 
 
 
299 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0783703  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1098  HflC protein  35.52 
 
 
301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0002  HflC protein  32.16 
 
 
281 aa  133  3e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2860  HflC protein  31.36 
 
 
295 aa  133  3.9999999999999996e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0576  HflC protein  33.09 
 
 
298 aa  133  3.9999999999999996e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  hitchhiker  0.000000000249888 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1721  HflC protein  31.85 
 
 
287 aa  132  5e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4891  HflC protein  32.75 
 
 
289 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.191561  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4767  HflC protein  32.75 
 
 
289 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0674  HflC protein  32.26 
 
 
289 aa  132  6e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1574  HflC protein  31.92 
 
 
300 aa  132  6e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000132487  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1980  hflC protein  33.58 
 
 
287 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0886  HflC protein  33.45 
 
 
340 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.340526 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1786  integral membrane proteinase  31.91 
 
 
287 aa  132  9e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0495  FtsH protease regulator HflC  29.07 
 
 
331 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0072  HflC protein  31.96 
 
 
302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.055112  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1067  HflC protein  33.21 
 
 
304 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277873  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4682  HflC protein  33.33 
 
 
289 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4943  HflC protein  32.75 
 
 
289 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00429597 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2675  HflC protein  29.47 
 
 
284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0148023 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3818  HflC protein  30.89 
 
 
334 aa  130  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.557877  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4761  FtsH protease regulator HflC  30.82 
 
 
334 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4417  FtsH protease regulator HflC  30.89 
 
 
334 aa  130  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4725  FtsH protease regulator HflC  30.82 
 
 
334 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4782  FtsH protease regulator HflC  30.82 
 
 
334 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220935  normal  0.242 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5691  FtsH protease regulator HflC  30.89 
 
 
334 aa  130  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.187921  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4632  FtsH protease regulator HflC  30.82 
 
 
334 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4646  FtsH protease regulator HflC  30.89 
 
 
334 aa  130  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.175793 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3838  FtsH protease regulator HflC  30.89 
 
 
334 aa  130  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00652  Membrane protease, stomatin/prohibitin family protein  30.03 
 
 
293 aa  130  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>