More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0072 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0072  HflC protein  100 
 
 
302 aa  613  1e-175  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.055112  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2299  HflC protein  87.46 
 
 
299 aa  531  1e-150  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0783703  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1178  HflC protein  85.62 
 
 
301 aa  529  1e-149  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.7077 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1098  HflC protein  85.95 
 
 
301 aa  520  1e-146  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5011  HflC protein  85.08 
 
 
296 aa  501  1e-141  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.315968  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1432  HflC protein  85.14 
 
 
299 aa  501  1e-141  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.200171  normal  0.890554 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2600  HflC protein  80.4 
 
 
300 aa  483  1e-135  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.558304  normal  0.617958 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2195  HflC protein  82.12 
 
 
301 aa  479  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1880  HflC protein  83.74 
 
 
299 aa  471  1e-132  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.476846  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2860  HflC protein  60.26 
 
 
295 aa  364  1e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1988  putative serine protease transmembrane protein  59.59 
 
 
296 aa  361  9e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0922969  normal  0.083656 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1223  putative serine protease transmembrane protein  54.83 
 
 
304 aa  328  5.0000000000000004e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00070103  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2078  hypothetical protein  53.5 
 
 
303 aa  318  6e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2098  HflC protein  51.97 
 
 
300 aa  318  9e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1159  HflC protein  53.8 
 
 
304 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.712281 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1067  HflC protein  53.44 
 
 
304 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277873  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2977  hypothetical protein  53.79 
 
 
295 aa  302  3.0000000000000004e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3382  HflC protein  52.38 
 
 
293 aa  299  4e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0674  HflC protein  51.39 
 
 
289 aa  299  5e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1283  HflC protein  52.08 
 
 
289 aa  296  2e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.368114  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0604  hypothetical protein  49.32 
 
 
293 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.256149 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0444  HflC protein  51.08 
 
 
292 aa  270  2e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.653206  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1586  HflC protein  49.26 
 
 
294 aa  258  6e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.258127  unclonable  0.000000224598 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1091  HflC protein  45.23 
 
 
284 aa  236  4e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2587  HflC-like protein  43.82 
 
 
304 aa  215  5.9999999999999996e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0635076  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5105  membrane protein, HflC  42.51 
 
 
299 aa  209  5e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.173706  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0900  HflC protein  38.6 
 
 
289 aa  207  1e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.219855  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1804  HflC protein  42.16 
 
 
299 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266909  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6275  HflC protein  42.16 
 
 
299 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.364844  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1828  HflC protein  42.16 
 
 
300 aa  205  6e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540549  normal  0.180131 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0576  HflC protein  41.36 
 
 
298 aa  204  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  hitchhiker  0.000000000249888 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1742  HflC protein  41.32 
 
 
299 aa  202  7e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1715  HflC protein  41.32 
 
 
299 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.90323  normal  0.244778 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0663  HflC protein  37.89 
 
 
302 aa  195  7e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0721748  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1941  HflC protein  36.59 
 
 
294 aa  194  2e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1412  band 7 protein  40 
 
 
304 aa  194  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.667221  hitchhiker  0.0000177218 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2774  HflC protein  39.58 
 
 
294 aa  194  2e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2766  HflC protein  37.76 
 
 
291 aa  193  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.147962  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1471  band 7 protein  39.27 
 
 
299 aa  193  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0967739  normal  0.234957 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07570  membrane bound protease regulator HflC  40.07 
 
 
287 aa  192  7e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2242  HflC protein  41.03 
 
 
299 aa  189  7e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.564384  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4939  hflC protein  39.66 
 
 
289 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.744013  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0575  hypothetical protein  39.66 
 
 
289 aa  186  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0526  hypothetical protein  40.15 
 
 
289 aa  185  6e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0925485  normal  0.267523 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1980  hflC protein  41.11 
 
 
287 aa  185  7e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2533  band 7 protein  40.07 
 
 
300 aa  185  8e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00510027  hitchhiker  0.0000246325 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0569  HflC protein  38.36 
 
 
292 aa  185  9e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000254764  normal  0.126336 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4167  HflC protein  38.36 
 
 
292 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000744211  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1663  HflC protein  37.54 
 
 
300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.107349 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1602  FtsH protease activity modulator HflC  39.46 
 
 
300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155202  normal  0.359083 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0601  HflC protein  36.3 
 
 
297 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974479  hitchhiker  0.00702769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3429  HflC protein  36.3 
 
 
297 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00841397  normal  0.0439963 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002262  HflC protein  38.41 
 
 
326 aa  182  6e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00114995  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0328  HflC protein  38.85 
 
 
295 aa  181  9.000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.791365  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0800  HflC protein  38.01 
 
 
292 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00875081  hitchhiker  0.00773647 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0600  HflC protein  35.97 
 
 
297 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00172359  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3202  HflC protein  36.82 
 
 
298 aa  181  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11004  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1826  ftsH protease activity modulator HflC  40.91 
 
 
299 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1337  ftsH protease activity modulator HflC  40.91 
 
 
299 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.127713  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2219  HflC protein  40.91 
 
 
299 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3890  HflC protein  36.96 
 
 
297 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000138111  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3707  HflC protein  36.96 
 
 
297 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572982  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2346  HflC protein  40.91 
 
 
299 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0070  ftsH protease activity modulator HflC  40.91 
 
 
299 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.216158  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2181  HflC protein  40.91 
 
 
299 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2675  HflC protein  38.25 
 
 
284 aa  181  2e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0148023 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3764  HflC protein  36.96 
 
 
297 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000648597  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0561  HflC protein  36.96 
 
 
297 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000351984  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2459  HflC protein  37.33 
 
 
290 aa  179  4.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.118766 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1574  HflC protein  36.96 
 
 
300 aa  178  8e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000132487  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4682  HflC protein  39.34 
 
 
289 aa  179  8e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3537  HflC protein  37.33 
 
 
292 aa  178  1e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000127879  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2761  hflC protein  37.42 
 
 
326 aa  177  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0386111  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00652  Membrane protease, stomatin/prohibitin family protein  36.11 
 
 
293 aa  177  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0488  HflC protein  34.47 
 
 
295 aa  177  2e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00091  serine protease  36.5 
 
 
326 aa  177  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0606  hflC protein  35.43 
 
 
297 aa  176  4e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1887  hflC protein  39.08 
 
 
290 aa  176  5e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0578137  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1562  HflC protein  39.08 
 
 
290 aa  176  5e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000166482 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0638  HflC protein  41.72 
 
 
289 aa  175  7e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0112821 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3981  HflC protein  35.92 
 
 
294 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.515796  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2202  hypothetical protein  38.05 
 
 
293 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02635  HflC protein  37.91 
 
 
282 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1051  hflC protein  33.57 
 
 
289 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3277  HflC protein  39.36 
 
 
297 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000125944  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3261  HflC protein  35.88 
 
 
300 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.103141  normal  0.242798 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3022  hflC protein  36.03 
 
 
308 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000029647  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65270  protease subunit HflC  40.22 
 
 
289 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3235  HflC protein  35.27 
 
 
288 aa  172  7.999999999999999e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000478035  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2629  HflC protein  36.64 
 
 
293 aa  172  9e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000539146 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5670  protease subunit HflC  40.22 
 
 
289 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1088  HflC protein  36.39 
 
 
328 aa  170  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4004  HflC protein  36.14 
 
 
308 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781168  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2039  HflC protein  35.23 
 
 
318 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.826229 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3345  HflC protein  36.84 
 
 
281 aa  170  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2947  HflC protein  35.79 
 
 
282 aa  170  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4528  HflC protein  35.18 
 
 
325 aa  170  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.788095 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6096  protease activity modulator HflK  36.06 
 
 
311 aa  169  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1280  HflC protein  34.13 
 
 
297 aa  169  6e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.393692  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4943  HflC protein  39.66 
 
 
289 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00429597 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>