More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5011 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5011  HflC protein  100 
 
 		 296 aa  600  1e-170  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.315968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1178  HflC protein  87.29 
 
 		 301 aa  530  1e-149  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.7077 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0072  HflC protein  85.08 
 
 		 302 aa  521  1e-147  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.055112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1098  HflC protein  87.29 
 
 		 301 aa  517  1e-146  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2299  HflC protein  82.59 
 
 		 299 aa  507  1e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0783703  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1432  HflC protein  86.39 
 
 		 299 aa  505  9.999999999999999e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.200171  normal  0.890554 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2600  HflC protein  81.36 
 
 		 300 aa  481  1e-135  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.558304  normal  0.617958 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1880  HflC protein  85.39 
 
 		 299 aa  473  1e-132  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.476846  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2195  HflC protein  81.57 
 
 		 301 aa  467  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2860  HflC protein  60.88 
 
 		 295 aa  367  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1988  putative serine protease transmembrane protein  58.78 
 
 		 296 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0922969  normal  0.083656 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1223  putative serine protease transmembrane protein  53.72 
 
 		 304 aa  327  1.0000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00070103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2098  HflC protein  52.38 
 
 		 300 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1067  HflC protein  55.41 
 
 		 304 aa  316  4e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2078  hypothetical protein  52.6 
 
 		 303 aa  315  5e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1159  HflC protein  55.22 
 
 		 304 aa  315  5e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.712281 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2977  hypothetical protein  53.77 
 
 		 295 aa  306  4.0000000000000004e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3382  HflC protein  53.98 
 
 		 293 aa  305  8.000000000000001e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0674  HflC protein  52.65 
 
 		 289 aa  304  1.0000000000000001e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1283  HflC protein  53.43 
 
 		 289 aa  300  3e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.368114  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0444  HflC protein  48.47 
 
 		 292 aa  281  1e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.653206  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0604  hypothetical protein  50 
 
 		 293 aa  279  5e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.256149 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1586  HflC protein  49.82 
 
 		 294 aa  265  8e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.258127  unclonable  0.000000224598 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1091  HflC protein  45.55 
 
 		 284 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2587  HflC-like protein  44.44 
 
 		 304 aa  223  3e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0635076  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0900  HflC protein  39.65 
 
 		 289 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.219855  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0576  HflC protein  39.52 
 
 		 298 aa  206  4e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  hitchhiker  0.000000000249888 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5105  membrane protein, HflC  38.62 
 
 		 299 aa  203  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.173706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1941  HflC protein  38.01 
 
 		 294 aa  202  5e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0569  HflC protein  39.06 
 
 		 292 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000254764  normal  0.126336 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3202  HflC protein  39.22 
 
 		 298 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11004  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07570  membrane bound protease regulator HflC  42.11 
 
 		 287 aa  199  5e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1804  HflC protein  37.93 
 
 		 299 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266909  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6275  HflC protein  37.93 
 
 		 299 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.364844  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3707  HflC protein  39.2 
 
 		 297 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0561  HflC protein  39.2 
 
 		 297 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000351984  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3764  HflC protein  39.2 
 
 		 297 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000648597  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3890  HflC protein  39.2 
 
 		 297 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000138111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1828  HflC protein  37.93 
 
 		 300 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540549  normal  0.180131 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1742  HflC protein  37.93 
 
 		 299 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0663  HflC protein  36.33 
 
 		 302 aa  197  1.0000000000000001e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0721748  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0800  HflC protein  38.94 
 
 		 292 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00875081  hitchhiker  0.00773647 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1715  HflC protein  37.93 
 
 		 299 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.90323  normal  0.244778 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0601  HflC protein  39.53 
 
 		 297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974479  hitchhiker  0.00702769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3429  HflC protein  39.53 
 
 		 297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00841397  normal  0.0439963 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4167  HflC protein  39.73 
 
 		 292 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000744211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3537  HflC protein  38.94 
 
 		 292 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000127879  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0600  HflC protein  38.87 
 
 		 297 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00172359  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1412  band 7 protein  39.21 
 
 		 304 aa  194  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.667221  hitchhiker  0.0000177218 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1980  hflC protein  41.16 
 
 		 287 aa  193  3e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2766  HflC protein  37.32 
 
 		 291 aa  193  3e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.147962  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0606  hflC protein  37.5 
 
 		 297 aa  192  5e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0526  hypothetical protein  41.79 
 
 		 289 aa  191  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0925485  normal  0.267523 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4939  hflC protein  40.21 
 
 		 289 aa  189  4e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.744013  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2774  HflC protein  38.26 
 
 		 294 aa  188  7e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0575  hypothetical protein  40.21 
 
 		 289 aa  188  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3277  HflC protein  39.46 
 
 		 297 aa  187  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000125944  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3308  HflC protein  40.49 
 
 		 292 aa  187  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2533  band 7 protein  38.49 
 
 		 300 aa  186  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00510027  hitchhiker  0.0000246325 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0328  HflC protein  38.54 
 
 		 295 aa  184  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.791365  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1602  FtsH protease activity modulator HflC  37.5 
 
 		 300 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155202  normal  0.359083 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3022  hflC protein  38.14 
 
 		 308 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000029647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1471  band 7 protein  35.14 
 
 		 299 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0967739  normal  0.234957 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1574  HflC protein  37.96 
 
 		 300 aa  183  3e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000132487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1887  hflC protein  39.66 
 
 		 290 aa  183  3e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0578137  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1562  HflC protein  39.66 
 
 		 290 aa  183  3e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000166482 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2242  HflC protein  39.46 
 
 		 299 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.564384  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2459  HflC protein  37.54 
 
 		 290 aa  182  8.000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118766 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002262  HflC protein  38.1 
 
 		 326 aa  181  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00114995  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3795  FtsH protease regulator HflC  35.42 
 
 		 334 aa  181  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0070  ftsH protease activity modulator HflC  39.31 
 
 		 299 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.216158  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1337  ftsH protease activity modulator HflC  39.31 
 
 		 299 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.127713  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4682  HflC protein  40.6 
 
 		 289 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2346  HflC protein  39.31 
 
 		 299 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1826  ftsH protease activity modulator HflC  39.31 
 
 		 299 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2219  HflC protein  39.31 
 
 		 299 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3650  FtsH protease regulator HflC  35.42 
 
 		 334 aa  181  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2181  HflC protein  39.31 
 
 		 299 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0696  FtsH protease regulator HflC  35.42 
 
 		 334 aa  181  1e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3235  HflC protein  36.65 
 
 		 288 aa  181  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000478035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3981  HflC protein  34.93 
 
 		 294 aa  180  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.515796  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2664  protease subunit HflC  37.46 
 
 		 291 aa  180  2.9999999999999997e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0488  HflC protein  35.07 
 
 		 295 aa  179  7e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00652  Membrane protease, stomatin/prohibitin family protein  34.38 
 
 		 293 aa  178  9e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2629  HflC protein  37.76 
 
 		 293 aa  178  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000539146 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2675  HflC protein  38.73 
 
 		 284 aa  177  2e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0148023 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2947  HflC protein  38.3 
 
 		 282 aa  177  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1663  HflC protein  35.97 
 
 		 300 aa  177  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.107349 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00091  serine protease  35.65 
 
 		 326 aa  177  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5670  protease subunit HflC  40.93 
 
 		 289 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65270  protease subunit HflC  40.93 
 
 		 289 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0638  HflC protein  40.71 
 
 		 289 aa  177  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0112821 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1786  integral membrane proteinase  37.46 
 
 		 287 aa  176  5e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1280  HflC protein  35.03 
 
 		 297 aa  175  6e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.393692  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1721  HflC protein  36.99 
 
 		 287 aa  175  8e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02635  HflC protein  37.54 
 
 		 282 aa  174  9.999999999999999e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2202  hypothetical protein  36.99 
 
 		 293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3718  FtsH protease regulator HflC  34.64 
 
 		 331 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0820553  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3916  FtsH protease regulator HflC  34.64 
 
 		 331 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.32908  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0434  FtsH protease regulator HflC  34.94 
 
 		 335 aa  172  5e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.476328  unclonable  0.0000000374568 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>