More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2195 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2195  HflC protein  100 
 
 		 301 aa  609  1e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0072  HflC protein  82.12 
 
 		 302 aa  507  1e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.055112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1178  HflC protein  81.79 
 
 		 301 aa  507  1e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.7077 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1098  HflC protein  82.45 
 
 		 301 aa  497  1e-140  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2299  HflC protein  80 
 
 		 299 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0783703  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2600  HflC protein  81.06 
 
 		 300 aa  484  1e-136  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.558304  normal  0.617958 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5011  HflC protein  81.57 
 
 		 296 aa  480  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.315968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1880  HflC protein  84.21 
 
 		 299 aa  473  1e-132  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.476846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1432  HflC protein  81.27 
 
 		 299 aa  473  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.200171  normal  0.890554 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1988  putative serine protease transmembrane protein  60.47 
 
 		 296 aa  372  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0922969  normal  0.083656 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2860  HflC protein  60.74 
 
 		 295 aa  369  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2098  HflC protein  53.51 
 
 		 300 aa  331  8e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1223  putative serine protease transmembrane protein  52.17 
 
 		 304 aa  326  2.0000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00070103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2078  hypothetical protein  53.82 
 
 		 303 aa  324  1e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1067  HflC protein  53.18 
 
 		 304 aa  317  1e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277873  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1159  HflC protein  53.18 
 
 		 304 aa  314  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.712281 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1283  HflC protein  52.76 
 
 		 289 aa  313  1.9999999999999998e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.368114  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2977  hypothetical protein  52.94 
 
 		 295 aa  312  3.9999999999999997e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0674  HflC protein  52.41 
 
 		 289 aa  310  2e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3382  HflC protein  51.53 
 
 		 293 aa  308  6.999999999999999e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0444  HflC protein  48.62 
 
 		 292 aa  285  5e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.653206  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0604  hypothetical protein  51.05 
 
 		 293 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.256149 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1586  HflC protein  51.31 
 
 		 294 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.258127  unclonable  0.000000224598 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1091  HflC protein  44.29 
 
 		 284 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5105  membrane protein, HflC  41.41 
 
 		 299 aa  219  5e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.173706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2587  HflC-like protein  40.69 
 
 		 304 aa  216  2e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0635076  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1828  HflC protein  40.54 
 
 		 300 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540549  normal  0.180131 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6275  HflC protein  40.88 
 
 		 299 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.364844  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1804  HflC protein  40.88 
 
 		 299 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266909  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0900  HflC protein  38.93 
 
 		 289 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.219855  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0576  HflC protein  42.96 
 
 		 298 aa  212  7e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  hitchhiker  0.000000000249888 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1715  HflC protein  39.86 
 
 		 299 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.90323  normal  0.244778 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1742  HflC protein  39.86 
 
 		 299 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1471  band 7 protein  38.46 
 
 		 299 aa  206  5e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0967739  normal  0.234957 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0663  HflC protein  39.35 
 
 		 302 aa  202  7e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0721748  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4939  hflC protein  42.14 
 
 		 289 aa  199  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.744013  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1941  HflC protein  37.05 
 
 		 294 aa  200  3e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0575  hypothetical protein  42.14 
 
 		 289 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2533  band 7 protein  41.64 
 
 		 300 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00510027  hitchhiker  0.0000246325 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1602  FtsH protease activity modulator HflC  40.46 
 
 		 300 aa  198  7e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155202  normal  0.359083 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0526  hypothetical protein  42.65 
 
 		 289 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0925485  normal  0.267523 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2242  HflC protein  41.87 
 
 		 299 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.564384  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2766  HflC protein  36.99 
 
 		 291 aa  196  3e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.147962  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07570  membrane bound protease regulator HflC  40.07 
 
 		 287 aa  195  6e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2459  HflC protein  38.33 
 
 		 290 aa  196  6e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118766 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1412  band 7 protein  39.5 
 
 		 304 aa  193  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.667221  hitchhiker  0.0000177218 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0488  HflC protein  36.43 
 
 		 295 aa  192  7e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2774  HflC protein  36.84 
 
 		 294 aa  191  9e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2181  HflC protein  40.83 
 
 		 299 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1337  ftsH protease activity modulator HflC  40.83 
 
 		 299 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.127713  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2346  HflC protein  40.83 
 
 		 299 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2219  HflC protein  40.83 
 
 		 299 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1826  ftsH protease activity modulator HflC  40.83 
 
 		 299 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0070  ftsH protease activity modulator HflC  40.83 
 
 		 299 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.216158  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1887  hflC protein  39.79 
 
 		 290 aa  191  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0578137  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1562  HflC protein  39.79 
 
 		 290 aa  191  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000166482 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1980  hflC protein  40.88 
 
 		 287 aa  189  4e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0800  HflC protein  36.03 
 
 		 292 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00875081  hitchhiker  0.00773647 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4167  HflC protein  36.49 
 
 		 292 aa  188  9e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000744211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2629  HflC protein  39.79 
 
 		 293 aa  188  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000539146 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4682  HflC protein  40.44 
 
 		 289 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0569  HflC protein  36.15 
 
 		 292 aa  186  4e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000254764  normal  0.126336 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3202  HflC protein  37.01 
 
 		 298 aa  186  4e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11004  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1051  hflC protein  34.64 
 
 		 289 aa  185  7e-46  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3537  HflC protein  36.99 
 
 		 292 aa  185  9e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000127879  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0328  HflC protein  37.86 
 
 		 295 aa  184  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.791365  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00652  Membrane protease, stomatin/prohibitin family protein  37.33 
 
 		 293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1663  HflC protein  37.98 
 
 		 300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.107349 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0600  HflC protein  37.87 
 
 		 297 aa  183  3e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00172359  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0601  HflC protein  38.21 
 
 		 297 aa  183  3e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974479  hitchhiker  0.00702769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3429  HflC protein  38.21 
 
 		 297 aa  183  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00841397  normal  0.0439963 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0606  hflC protein  38.05 
 
 		 297 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3235  HflC protein  35.21 
 
 		 288 aa  182  5.0000000000000004e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000478035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3981  HflC protein  35.27 
 
 		 294 aa  182  7e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.515796  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3764  HflC protein  37.21 
 
 		 297 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000648597  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2202  hypothetical protein  38.54 
 
 		 293 aa  181  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3707  HflC protein  37.21 
 
 		 297 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0561  HflC protein  37.21 
 
 		 297 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000351984  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3890  HflC protein  37.21 
 
 		 297 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000138111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1574  HflC protein  37.36 
 
 		 300 aa  180  2e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000132487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65270  protease subunit HflC  40.71 
 
 		 289 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5670  protease subunit HflC  40.71 
 
 		 289 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0844  hypothetical protein  32.86 
 
 		 290 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0638  HflC protein  40.07 
 
 		 289 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0112821 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3345  HflC protein  37.89 
 
 		 281 aa  179  5.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02635  HflC protein  37.93 
 
 		 282 aa  179  7e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002262  HflC protein  36.08 
 
 		 326 aa  178  8e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00114995  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4891  HflC protein  39.37 
 
 		 289 aa  178  9e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.191561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4767  HflC protein  39.37 
 
 		 289 aa  178  9e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3022  hflC protein  37.41 
 
 		 308 aa  178  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000029647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2675  HflC protein  37.23 
 
 		 284 aa  177  2e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0148023 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3308  HflC protein  37.05 
 
 		 292 aa  177  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2761  hflC protein  35.8 
 
 		 326 aa  176  4e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0386111  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4943  HflC protein  38.68 
 
 		 289 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00429597 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3277  HflC protein  40.32 
 
 		 297 aa  175  8e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000125944  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1721  HflC protein  37.72 
 
 		 287 aa  174  9.999999999999999e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1786  integral membrane proteinase  37.72 
 
 		 287 aa  174  9.999999999999999e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2664  protease subunit HflC  35.09 
 
 		 291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1088  HflC protein  35.83 
 
 		 328 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3718  FtsH protease regulator HflC  34.65 
 
 		 331 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0820553  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>