More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I2242 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I2242  HflC protein  100 
 
 
299 aa  587  1e-167  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.564384  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1826  ftsH protease activity modulator HflC  91.97 
 
 
299 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1337  ftsH protease activity modulator HflC  91.97 
 
 
299 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.127713  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2346  HflC protein  91.97 
 
 
299 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2181  HflC protein  91.97 
 
 
299 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2219  HflC protein  91.97 
 
 
299 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0070  ftsH protease activity modulator HflC  91.97 
 
 
299 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.216158  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1828  HflC protein  71.53 
 
 
300 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540549  normal  0.180131 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6275  HflC protein  70.57 
 
 
299 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.364844  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1742  HflC protein  70.57 
 
 
299 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1804  HflC protein  70.57 
 
 
299 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266909  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1715  HflC protein  70.23 
 
 
299 aa  391  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.90323  normal  0.244778 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5105  membrane protein, HflC  69.57 
 
 
299 aa  393  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.173706  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1471  band 7 protein  69.23 
 
 
299 aa  373  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0967739  normal  0.234957 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1412  band 7 protein  62.37 
 
 
304 aa  319  3e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.667221  hitchhiker  0.0000177218 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2533  band 7 protein  61.87 
 
 
300 aa  308  8e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00510027  hitchhiker  0.0000246325 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1602  FtsH protease activity modulator HflC  62.03 
 
 
300 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155202  normal  0.359083 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2860  HflC protein  45.76 
 
 
295 aa  249  5e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2098  HflC protein  43.39 
 
 
300 aa  249  5e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1223  putative serine protease transmembrane protein  44.08 
 
 
304 aa  242  3.9999999999999997e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00070103  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2078  hypothetical protein  43.16 
 
 
303 aa  241  7.999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1988  putative serine protease transmembrane protein  42.71 
 
 
296 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0922969  normal  0.083656 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2977  hypothetical protein  42.86 
 
 
295 aa  231  2e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1159  HflC protein  43.62 
 
 
304 aa  230  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.712281 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1067  HflC protein  42.33 
 
 
304 aa  229  4e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277873  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1283  HflC protein  42.4 
 
 
289 aa  229  5e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.368114  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0674  HflC protein  41.7 
 
 
289 aa  227  2e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0444  HflC protein  42.61 
 
 
292 aa  226  3e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.653206  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2600  HflC protein  44.63 
 
 
300 aa  226  4e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.558304  normal  0.617958 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1178  HflC protein  41.75 
 
 
301 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.7077 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1098  HflC protein  42.09 
 
 
301 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0604  hypothetical protein  41.87 
 
 
293 aa  214  9.999999999999999e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.256149 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2299  HflC protein  42.67 
 
 
299 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0783703  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0072  HflC protein  42.52 
 
 
302 aa  213  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.055112  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3382  HflC protein  41.84 
 
 
293 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1432  HflC protein  42.47 
 
 
299 aa  209  6e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.200171  normal  0.890554 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2195  HflC protein  41.81 
 
 
301 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1586  HflC protein  42.57 
 
 
294 aa  198  9e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.258127  unclonable  0.000000224598 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5011  HflC protein  39.06 
 
 
296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.315968  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1880  HflC protein  40.62 
 
 
299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.476846  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1091  HflC protein  38.71 
 
 
284 aa  192  6e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3537  HflC protein  39.39 
 
 
292 aa  188  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000127879  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0601  HflC protein  36.91 
 
 
297 aa  186  4e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974479  hitchhiker  0.00702769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3429  HflC protein  36.91 
 
 
297 aa  186  4e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00841397  normal  0.0439963 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4167  HflC protein  36.64 
 
 
292 aa  186  6e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000744211  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0663  HflC protein  39.02 
 
 
302 aa  185  6e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0721748  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0600  HflC protein  36.91 
 
 
297 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00172359  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0606  hflC protein  37.85 
 
 
297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0800  HflC protein  35.59 
 
 
292 aa  182  6e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00875081  hitchhiker  0.00773647 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0900  HflC protein  38.06 
 
 
289 aa  181  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.219855  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3981  HflC protein  36.82 
 
 
294 aa  181  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.515796  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3277  HflC protein  40.32 
 
 
297 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000125944  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3202  HflC protein  37.33 
 
 
298 aa  178  8e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11004  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3764  HflC protein  35.59 
 
 
297 aa  176  3e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000648597  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3890  HflC protein  35.59 
 
 
297 aa  176  3e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000138111  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0561  HflC protein  35.59 
 
 
297 aa  176  3e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000351984  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3707  HflC protein  35.59 
 
 
297 aa  176  3e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572982  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00652  Membrane protease, stomatin/prohibitin family protein  35.74 
 
 
293 aa  175  7e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3308  HflC protein  37.91 
 
 
292 aa  175  8e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0328  HflC protein  40.08 
 
 
295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.791365  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3795  FtsH protease regulator HflC  33.24 
 
 
334 aa  173  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0696  FtsH protease regulator HflC  33.24 
 
 
334 aa  173  2.9999999999999996e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3650  FtsH protease regulator HflC  33.24 
 
 
334 aa  173  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0488  HflC protein  36.68 
 
 
295 aa  172  5e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2587  HflC-like protein  37.41 
 
 
304 aa  172  7.999999999999999e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0635076  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0434  FtsH protease regulator HflC  33.43 
 
 
335 aa  170  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.476328  unclonable  0.0000000374568 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1941  HflC protein  37.75 
 
 
294 aa  169  4e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07570  membrane bound protease regulator HflC  40.42 
 
 
287 aa  169  6e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0569  HflC protein  35.19 
 
 
292 aa  169  7e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000254764  normal  0.126336 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04042  modulator for HflB protease specific for phage lambda cII repressor  34.81 
 
 
334 aa  167  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.040502  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3818  HflC protein  34.81 
 
 
334 aa  167  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.557877  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2629  HflC protein  37.88 
 
 
293 aa  168  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000539146 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4733  FtsH protease regulator HflC  34.81 
 
 
334 aa  167  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0358  FtsH protease regulator HflC  34.93 
 
 
334 aa  168  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.470776  hitchhiker  0.00397927 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4706  FtsH protease regulator HflC  34.81 
 
 
334 aa  167  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04004  hypothetical protein  34.81 
 
 
334 aa  167  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.054912  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4646  FtsH protease regulator HflC  34.81 
 
 
334 aa  167  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.175793 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3022  hflC protein  37.02 
 
 
308 aa  168  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000029647  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0578  FtsH protease regulator HflC  33.13 
 
 
333 aa  168  1e-40  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4417  FtsH protease regulator HflC  34.81 
 
 
334 aa  167  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5691  FtsH protease regulator HflC  34.81 
 
 
334 aa  167  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.187921  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3838  FtsH protease regulator HflC  34.81 
 
 
334 aa  167  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2774  HflC protein  33.22 
 
 
294 aa  167  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1980  hflC protein  39.51 
 
 
287 aa  166  4e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1280  HflC protein  34.8 
 
 
297 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.393692  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2459  HflC protein  34.25 
 
 
290 aa  166  5.9999999999999996e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.118766 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0575  hypothetical protein  38.65 
 
 
289 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4939  hflC protein  38.3 
 
 
289 aa  165  8e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.744013  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0576  HflC protein  36.67 
 
 
298 aa  165  8e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  hitchhiker  0.000000000249888 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0538  FtsH protease regulator HflC  32.73 
 
 
331 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.255691  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3916  FtsH protease regulator HflC  31.72 
 
 
331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.32908  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3235  HflC protein  31.96 
 
 
288 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000478035  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1574  HflC protein  36.43 
 
 
300 aa  164  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000132487  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3718  FtsH protease regulator HflC  31.72 
 
 
331 aa  162  6e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0820553  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0638  HflC protein  38.3 
 
 
289 aa  162  7e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0112821 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4632  FtsH protease regulator HflC  34.13 
 
 
334 aa  162  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0549  membrane protease subunit HflC  35.74 
 
 
304 aa  162  8.000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4782  FtsH protease regulator HflC  34.13 
 
 
334 aa  162  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220935  normal  0.242 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4642  FtsH protease regulator HflC  34.13 
 
 
334 aa  162  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4761  FtsH protease regulator HflC  34.13 
 
 
334 aa  162  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>