More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_2219 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A0070  ftsH protease activity modulator HflC  100 
 
 
299 aa  587  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.216158  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2181  HflC protein  100 
 
 
299 aa  587  1e-167  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1337  ftsH protease activity modulator HflC  100 
 
 
299 aa  587  1e-167  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.127713  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2219  HflC protein  100 
 
 
299 aa  587  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2346  HflC protein  100 
 
 
299 aa  587  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1826  ftsH protease activity modulator HflC  100 
 
 
299 aa  587  1e-167  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2242  HflC protein  91.97 
 
 
299 aa  482  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.564384  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5105  membrane protein, HflC  71.18 
 
 
299 aa  394  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.173706  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1828  HflC protein  71.53 
 
 
300 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540549  normal  0.180131 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6275  HflC protein  71.53 
 
 
299 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.364844  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1804  HflC protein  71.53 
 
 
299 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266909  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1742  HflC protein  71.88 
 
 
299 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1715  HflC protein  71.53 
 
 
299 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.90323  normal  0.244778 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1471  band 7 protein  69.9 
 
 
299 aa  375  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0967739  normal  0.234957 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1412  band 7 protein  60 
 
 
304 aa  308  8e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.667221  hitchhiker  0.0000177218 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1602  FtsH protease activity modulator HflC  61 
 
 
300 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155202  normal  0.359083 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2533  band 7 protein  61.36 
 
 
300 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00510027  hitchhiker  0.0000246325 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2098  HflC protein  44.07 
 
 
300 aa  249  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2860  HflC protein  44.07 
 
 
295 aa  242  7e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1223  putative serine protease transmembrane protein  44.08 
 
 
304 aa  240  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00070103  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2078  hypothetical protein  43.16 
 
 
303 aa  239  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1283  HflC protein  43.11 
 
 
289 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.368114  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0674  HflC protein  42.4 
 
 
289 aa  232  5e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1159  HflC protein  44.3 
 
 
304 aa  230  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.712281 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1067  HflC protein  43.96 
 
 
304 aa  229  3e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277873  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1988  putative serine protease transmembrane protein  41.02 
 
 
296 aa  228  7e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0922969  normal  0.083656 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2977  hypothetical protein  42.36 
 
 
295 aa  227  2e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0444  HflC protein  41.9 
 
 
292 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.653206  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2600  HflC protein  42.62 
 
 
300 aa  219  3e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.558304  normal  0.617958 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1178  HflC protein  41.08 
 
 
301 aa  217  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.7077 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3382  HflC protein  41.03 
 
 
293 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2299  HflC protein  41.67 
 
 
299 aa  216  5e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0783703  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1098  HflC protein  41.41 
 
 
301 aa  215  7e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0604  hypothetical protein  41.87 
 
 
293 aa  215  9e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.256149 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0072  HflC protein  41.2 
 
 
302 aa  209  4e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.055112  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1432  HflC protein  41.45 
 
 
299 aa  207  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.200171  normal  0.890554 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5011  HflC protein  39.06 
 
 
296 aa  200  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.315968  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2195  HflC protein  40.73 
 
 
301 aa  199  6e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1586  HflC protein  41.44 
 
 
294 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.258127  unclonable  0.000000224598 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1880  HflC protein  39.85 
 
 
299 aa  194  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.476846  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1091  HflC protein  39.43 
 
 
284 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3537  HflC protein  38.64 
 
 
292 aa  186  3e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000127879  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0800  HflC protein  35.93 
 
 
292 aa  185  9e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00875081  hitchhiker  0.00773647 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0600  HflC protein  37.46 
 
 
297 aa  183  3e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00172359  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0601  HflC protein  37.46 
 
 
297 aa  182  6e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974479  hitchhiker  0.00702769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3429  HflC protein  37.46 
 
 
297 aa  182  6e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00841397  normal  0.0439963 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4167  HflC protein  36.18 
 
 
292 aa  182  7e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000744211  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0663  HflC protein  37.63 
 
 
302 aa  181  2e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0721748  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0900  HflC protein  38.28 
 
 
289 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.219855  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0606  hflC protein  37.2 
 
 
297 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3981  HflC protein  36.77 
 
 
294 aa  177  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.515796  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3277  HflC protein  40.82 
 
 
297 aa  176  4e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000125944  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3202  HflC protein  36.95 
 
 
298 aa  175  8e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11004  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3707  HflC protein  35.81 
 
 
297 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572982  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0561  HflC protein  35.81 
 
 
297 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000351984  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3890  HflC protein  35.81 
 
 
297 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000138111  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3308  HflC protein  37.86 
 
 
292 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3764  HflC protein  35.81 
 
 
297 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000648597  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0488  HflC protein  36.33 
 
 
295 aa  172  5.999999999999999e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1280  HflC protein  35.14 
 
 
297 aa  172  6.999999999999999e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.393692  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3795  FtsH protease regulator HflC  34.68 
 
 
334 aa  171  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0569  HflC protein  35.76 
 
 
292 aa  171  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000254764  normal  0.126336 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0696  FtsH protease regulator HflC  34.68 
 
 
334 aa  171  1e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3650  FtsH protease regulator HflC  34.68 
 
 
334 aa  171  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2587  HflC-like protein  36.26 
 
 
304 aa  170  2e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0635076  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00652  Membrane protease, stomatin/prohibitin family protein  35.05 
 
 
293 aa  170  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2459  HflC protein  33.68 
 
 
290 aa  169  7e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.118766 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07570  membrane bound protease regulator HflC  41.67 
 
 
287 aa  168  8e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0328  HflC protein  38.74 
 
 
295 aa  167  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.791365  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0358  FtsH protease regulator HflC  34.93 
 
 
334 aa  166  4e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.470776  hitchhiker  0.00397927 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2629  HflC protein  37.54 
 
 
293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000539146 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0576  HflC protein  36 
 
 
298 aa  165  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  hitchhiker  0.000000000249888 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0434  FtsH protease regulator HflC  33.23 
 
 
335 aa  165  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.476328  unclonable  0.0000000374568 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04042  modulator for HflB protease specific for phage lambda cII repressor  36.18 
 
 
334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.040502  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3818  HflC protein  36.18 
 
 
334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.557877  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4417  FtsH protease regulator HflC  36.18 
 
 
334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3838  FtsH protease regulator HflC  36.18 
 
 
334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4646  FtsH protease regulator HflC  36.18 
 
 
334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.175793 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4706  FtsH protease regulator HflC  36.18 
 
 
334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5691  FtsH protease regulator HflC  36.18 
 
 
334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.187921  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4733  FtsH protease regulator HflC  36.18 
 
 
334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04004  hypothetical protein  36.18 
 
 
334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.054912  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3022  hflC protein  36.08 
 
 
308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000029647  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0575  hypothetical protein  38.3 
 
 
289 aa  163  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1574  HflC protein  37.6 
 
 
300 aa  163  3e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000132487  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1731  HflC protein  38.37 
 
 
295 aa  162  4.0000000000000004e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000316611 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0549  membrane protease subunit HflC  36.12 
 
 
304 aa  162  5.0000000000000005e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1941  HflC protein  36.14 
 
 
294 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0578  FtsH protease regulator HflC  34.04 
 
 
333 aa  162  6e-39  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4939  hflC protein  37.94 
 
 
289 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.744013  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1980  hflC protein  38.68 
 
 
287 aa  161  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3916  FtsH protease regulator HflC  31.76 
 
 
331 aa  161  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.32908  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4725  FtsH protease regulator HflC  34.13 
 
 
334 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4632  FtsH protease regulator HflC  34.13 
 
 
334 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4782  FtsH protease regulator HflC  34.13 
 
 
334 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220935  normal  0.242 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4761  FtsH protease regulator HflC  34.13 
 
 
334 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4642  FtsH protease regulator HflC  34.13 
 
 
334 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3235  HflC protein  31.96 
 
 
288 aa  160  3e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000478035  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3718  FtsH protease regulator HflC  31.76 
 
 
331 aa  160  4e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0820553  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1887  hflC protein  35.17 
 
 
290 aa  159  5e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0578137  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>