More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2263 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2263  HflC protein  100 
 
 		 310 aa  629  1e-179  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00649366  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0185  HflC protein  51.69 
 
 		 334 aa  305  6e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3523  HflC protein  47.1 
 
 		 313 aa  301  1e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3614  HflC protein  48.29 
 
 		 313 aa  290  2e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3679  HflC protein  48.44 
 
 		 313 aa  290  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2797  HflC protein  44.41 
 
 		 332 aa  262  6e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0546  HflC protein  41.72 
 
 		 329 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000495565  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1333  hflC protein, putative  38.98 
 
 		 354 aa  247  2e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.792666  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0314  hflC protein, putative  43.24 
 
 		 320 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2947  HflC protein  37.25 
 
 		 282 aa  215  8e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0487  HflC protein  38.11 
 
 		 283 aa  203  2e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.426626 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1574  HflC protein  37.01 
 
 		 300 aa  199  5e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000132487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2280  HflC protein  35.91 
 
 		 283 aa  194  2e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0867  HflC protein  37.63 
 
 		 282 aa  191  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00264104  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2675  HflC protein  34.31 
 
 		 284 aa  187  2e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0148023 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0002  HflC protein  37.99 
 
 		 281 aa  187  2e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1663  HflC protein  32.48 
 
 		 300 aa  186  6e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.107349 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0206  HflC protein  36.51 
 
 		 323 aa  184  1.0000000000000001e-45  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1091  HflC protein  35.58 
 
 		 284 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3382  HflC protein  35.43 
 
 		 293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2459  HflC protein  33.89 
 
 		 290 aa  181  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118766 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2977  hypothetical protein  33.77 
 
 		 295 aa  181  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4126  HflC protein  36.71 
 
 		 320 aa  179  7e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1108  HflC protein  34.3 
 
 		 283 aa  176  3e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0998  HflC protein  34.3 
 
 		 283 aa  176  3e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00652  Membrane protease, stomatin/prohibitin family protein  31.86 
 
 		 293 aa  176  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2039  HflC protein  33.01 
 
 		 318 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.826229 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1320  HflC protein  34.92 
 
 		 286 aa  174  1.9999999999999998e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.422043  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0444  HflC protein  32.9 
 
 		 292 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.653206  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1562  HflC protein  32.34 
 
 		 290 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000166482 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3202  HflC protein  33.33 
 
 		 298 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11004  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1887  hflC protein  32.34 
 
 		 290 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0578137  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0605  HflC protein  34.48 
 
 		 312 aa  172  9e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0249897 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3235  HflC protein  31.94 
 
 		 288 aa  171  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000478035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0264  HflC protein  35.39 
 
 		 282 aa  171  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3537  HflC protein  32.58 
 
 		 292 aa  169  4e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000127879  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2023  HflC protein  34.19 
 
 		 292 aa  169  4e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.634094  normal  0.555139 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0844  hypothetical protein  30.29 
 
 		 290 aa  169  5e-41  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3022  hflC protein  34.53 
 
 		 308 aa  169  5e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000029647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4004  HflC protein  32.67 
 
 		 308 aa  169  7e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781168  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3261  HflC protein  31.05 
 
 		 300 aa  168  9e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.103141  normal  0.242798 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0900  HflC protein  34.27 
 
 		 289 aa  168  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.219855  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0703  HflC protein  32.03 
 
 		 281 aa  167  2e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00091  serine protease  33.02 
 
 		 326 aa  167  2.9999999999999998e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0561  HflC protein  32.92 
 
 		 297 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000351984  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3707  HflC protein  32.92 
 
 		 297 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3764  HflC protein  32.92 
 
 		 297 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000648597  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3890  HflC protein  32.92 
 
 		 297 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000138111  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0328  HflC protein  33.33 
 
 		 295 aa  165  6.9999999999999995e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.791365  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0629  HflC protein  33.33 
 
 		 283 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3172  HflC protein  33.01 
 
 		 300 aa  165  8e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0696  FtsH protease regulator HflC  34.94 
 
 		 334 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2761  hflC protein  32.91 
 
 		 326 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0386111  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3650  FtsH protease regulator HflC  34.94 
 
 		 334 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1051  hflC protein  30.84 
 
 		 289 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3795  FtsH protease regulator HflC  34.94 
 
 		 334 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3351  HflC protein  31.02 
 
 		 311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.713706  normal  0.149829 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0434  FtsH protease regulator HflC  33.75 
 
 		 335 aa  163  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.476328  unclonable  0.0000000374568 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0600  HflC protein  31.73 
 
 		 297 aa  163  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00172359  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2727  HflC protein  31.25 
 
 		 299 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772067  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002262  HflC protein  32.12 
 
 		 326 aa  162  7e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00114995  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0800  HflC protein  31.15 
 
 		 292 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00875081  hitchhiker  0.00773647 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2098  HflC protein  33.02 
 
 		 300 aa  162  8.000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0601  HflC protein  32.05 
 
 		 297 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974479  hitchhiker  0.00702769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3429  HflC protein  32.05 
 
 		 297 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00841397  normal  0.0439963 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1223  putative serine protease transmembrane protein  32.8 
 
 		 304 aa  160  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00070103  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4939  hflC protein  32.67 
 
 		 289 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.744013  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0604  hypothetical protein  33.22 
 
 		 293 aa  160  2e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.256149 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1088  HflC protein  32.13 
 
 		 328 aa  161  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0578  FtsH protease regulator HflC  31.42 
 
 		 333 aa  161  2e-38  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07570  membrane bound protease regulator HflC  32.76 
 
 		 287 aa  160  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3981  HflC protein  32.48 
 
 		 294 aa  160  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.515796  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3308  HflC protein  33.11 
 
 		 292 aa  160  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0606  hflC protein  31.73 
 
 		 297 aa  159  4e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6096  protease activity modulator HflK  32.64 
 
 		 311 aa  160  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1586  HflC protein  32.99 
 
 		 294 aa  159  4e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.258127  unclonable  0.000000224598 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0575  hypothetical protein  32.34 
 
 		 289 aa  159  6e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0526  hypothetical protein  32.65 
 
 		 289 aa  159  7e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0925485  normal  0.267523 
 
 
-
 
NC_002978  WD0832  hflC protein  32.31 
 
 		 290 aa  158  9e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.379816  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3345  HflC protein  31.29 
 
 		 281 aa  158  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4167  HflC protein  31.15 
 
 		 292 aa  158  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000744211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2348  hypothetical protein  30.56 
 
 		 298 aa  158  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2779  HflC protein  31.86 
 
 		 320 aa  158  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1731  HflC protein  31.85 
 
 		 295 aa  158  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000316611 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2202  hypothetical protein  35.28 
 
 		 293 aa  158  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2657  HflC protein  32.79 
 
 		 316 aa  157  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.267381 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3916  FtsH protease regulator HflC  32.72 
 
 		 331 aa  157  3e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.32908  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0663  HflC protein  30.29 
 
 		 302 aa  157  3e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0721748  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2884  HflC protein  32.79 
 
 		 313 aa  156  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3718  FtsH protease regulator HflC  33.03 
 
 		 331 aa  156  4e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0820553  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0886  HflC protein  32.8 
 
 		 340 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.340526 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04042  modulator for HflB protease specific for phage lambda cII repressor  33.02 
 
 		 334 aa  155  6e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.040502  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3818  HflC protein  33.02 
 
 		 334 aa  155  6e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.557877  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4646  FtsH protease regulator HflC  33.02 
 
 		 334 aa  155  6e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.175793 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4733  FtsH protease regulator HflC  33.02 
 
 		 334 aa  155  6e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3838  FtsH protease regulator HflC  33.02 
 
 		 334 aa  155  6e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04004  hypothetical protein  33.02 
 
 		 334 aa  155  6e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.054912  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4706  FtsH protease regulator HflC  33.02 
 
 		 334 aa  155  6e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4417  FtsH protease regulator HflC  33.02 
 
 		 334 aa  155  6e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5691  FtsH protease regulator HflC  33.02 
 
 		 334 aa  155  6e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.187921  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>