More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0314 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0314  hflC protein, putative  100 
 
 		 320 aa  645    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2797  HflC protein  58.6 
 
 		 332 aa  379  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3523  HflC protein  49.03 
 
 		 313 aa  293  2e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3679  HflC protein  48.98 
 
 		 313 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3614  HflC protein  48.98 
 
 		 313 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0546  HflC protein  44.65 
 
 		 329 aa  265  1e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000495565  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0185  HflC protein  44.48 
 
 		 334 aa  248  9e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2263  HflC protein  42.77 
 
 		 310 aa  246  4e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00649366  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1333  hflC protein, putative  37.78 
 
 		 354 aa  189  4e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.792666  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1574  HflC protein  37.23 
 
 		 300 aa  188  1e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000132487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2947  HflC protein  36.3 
 
 		 282 aa  183  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2280  HflC protein  36 
 
 		 283 aa  177  3e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2459  HflC protein  36.88 
 
 		 290 aa  173  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118766 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2675  HflC protein  36.54 
 
 		 284 aa  172  5e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0148023 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0487  HflC protein  35.4 
 
 		 283 aa  166  6.9999999999999995e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.426626 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2977  hypothetical protein  33.55 
 
 		 295 aa  160  3e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0264  HflC protein  36.09 
 
 		 282 aa  160  4e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3382  HflC protein  35.35 
 
 		 293 aa  159  5e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0002  HflC protein  33.68 
 
 		 281 aa  157  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0867  HflC protein  33.22 
 
 		 282 aa  157  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00264104  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1091  HflC protein  33.66 
 
 		 284 aa  157  3e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0444  HflC protein  33.12 
 
 		 292 aa  156  6e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.653206  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1941  HflC protein  35.33 
 
 		 294 aa  155  1e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4126  HflC protein  34.25 
 
 		 320 aa  154  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0703  HflC protein  32.01 
 
 		 281 aa  152  5e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00652  Membrane protease, stomatin/prohibitin family protein  32.48 
 
 		 293 aa  152  7e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0900  HflC protein  34.32 
 
 		 289 aa  152  8.999999999999999e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.219855  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0800  HflC protein  29.94 
 
 		 292 aa  151  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00875081  hitchhiker  0.00773647 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1108  HflC protein  31.82 
 
 		 283 aa  150  4e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0998  HflC protein  31.82 
 
 		 283 aa  150  4e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2023  HflC protein  33.88 
 
 		 292 aa  149  6e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.634094  normal  0.555139 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2779  HflC protein  32.91 
 
 		 320 aa  149  7e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2657  HflC protein  32.91 
 
 		 316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.267381 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4004  HflC protein  32.26 
 
 		 308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781168  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0629  HflC protein  32.29 
 
 		 283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2884  HflC protein  32.49 
 
 		 313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1663  HflC protein  30.46 
 
 		 300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.107349 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4167  HflC protein  29.81 
 
 		 292 aa  147  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000744211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1586  HflC protein  32.99 
 
 		 294 aa  147  3e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.258127  unclonable  0.000000224598 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1223  putative serine protease transmembrane protein  33.01 
 
 		 304 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00070103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3235  HflC protein  29.52 
 
 		 288 aa  145  7.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000478035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0605  HflC protein  30 
 
 		 312 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0249897 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3981  HflC protein  33.33 
 
 		 294 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.515796  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4528  HflC protein  32.27 
 
 		 325 aa  145  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.788095 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1088  HflC protein  30.19 
 
 		 328 aa  144  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2202  hypothetical protein  33.44 
 
 		 293 aa  143  4e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2039  HflC protein  32.01 
 
 		 318 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.826229 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3202  HflC protein  29.69 
 
 		 298 aa  143  4e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11004  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0206  HflC protein  31.07 
 
 		 323 aa  142  5e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0600  HflC protein  29.25 
 
 		 297 aa  142  6e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00172359  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1320  HflC protein  30.52 
 
 		 286 aa  142  9e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.422043  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0569  HflC protein  28.66 
 
 		 292 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000254764  normal  0.126336 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2348  hypothetical protein  32.43 
 
 		 298 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3022  hflC protein  30.65 
 
 		 308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000029647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2078  hypothetical protein  31.6 
 
 		 303 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00091  serine protease  31.45 
 
 		 326 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2727  HflC protein  31.65 
 
 		 299 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772067  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0604  hypothetical protein  34.09 
 
 		 293 aa  140  3e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.256149 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1159  HflC protein  32.69 
 
 		 304 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.712281 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3261  HflC protein  31.49 
 
 		 300 aa  139  6e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.103141  normal  0.242798 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2098  HflC protein  30.87 
 
 		 300 aa  139  7e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1067  HflC protein  32.37 
 
 		 304 aa  139  7e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0601  HflC protein  28.62 
 
 		 297 aa  138  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974479  hitchhiker  0.00702769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3429  HflC protein  28.62 
 
 		 297 aa  138  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00841397  normal  0.0439963 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3351  HflC protein  30.62 
 
 		 311 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.713706  normal  0.149829 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1562  HflC protein  30.54 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000166482 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1887  hflC protein  30.54 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0578137  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1051  hflC protein  29.51 
 
 		 289 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0488  HflC protein  31.6 
 
 		 295 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3308  HflC protein  30.33 
 
 		 292 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0606  hflC protein  29.87 
 
 		 297 aa  136  4e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07570  membrane bound protease regulator HflC  33.56 
 
 		 287 aa  136  5e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002262  HflC protein  31.03 
 
 		 326 aa  135  7.000000000000001e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00114995  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0674  HflC protein  29.87 
 
 		 289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0696  FtsH protease regulator HflC  28.88 
 
 		 334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3537  HflC protein  28.34 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000127879  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3650  FtsH protease regulator HflC  28.88 
 
 		 334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3795  FtsH protease regulator HflC  28.88 
 
 		 334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0561  HflC protein  29.25 
 
 		 297 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000351984  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3707  HflC protein  29.25 
 
 		 297 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3890  HflC protein  29.25 
 
 		 297 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000138111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3764  HflC protein  29.25 
 
 		 297 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000648597  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0434  FtsH protease regulator HflC  30.36 
 
 		 335 aa  134  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.476328  unclonable  0.0000000374568 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0328  HflC protein  30.1 
 
 		 295 aa  132  6e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.791365  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1283  HflC protein  30.32 
 
 		 289 aa  132  6e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.368114  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6096  protease activity modulator HflK  31.48 
 
 		 311 aa  132  6.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2761  hflC protein  29.58 
 
 		 326 aa  132  7.999999999999999e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0386111  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2860  HflC protein  30.16 
 
 		 295 aa  132  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3277  HflC protein  29.3 
 
 		 297 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000125944  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1955  HflC protein  34.53 
 
 		 294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.905613  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0702  HflC protein  30.69 
 
 		 310 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.999552  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4761  FtsH protease regulator HflC  29.94 
 
 		 334 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3916  FtsH protease regulator HflC  30.49 
 
 		 331 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.32908  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4782  FtsH protease regulator HflC  29.94 
 
 		 334 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220935  normal  0.242 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4642  FtsH protease regulator HflC  29.94 
 
 		 334 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4632  FtsH protease regulator HflC  29.94 
 
 		 334 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4725  FtsH protease regulator HflC  29.94 
 
 		 334 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3345  HflC protein  32.48 
 
 		 281 aa  130  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2587  HflC-like protein  30.38 
 
 		 304 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0635076  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2766  HflC protein  30.97 
 
 		 291 aa  129  5.0000000000000004e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.147962  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>