243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0185 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0185  HflC protein  100 
 
 		 334 aa  683    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2263  HflC protein  49.04 
 
 		 310 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00649366  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3523  HflC protein  49.23 
 
 		 313 aa  299  4e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3679  HflC protein  50.67 
 
 		 313 aa  290  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3614  HflC protein  50.67 
 
 		 313 aa  288  6e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2797  HflC protein  44.98 
 
 		 332 aa  262  6e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0546  HflC protein  44.1 
 
 		 329 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000495565  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0314  hflC protein, putative  44.07 
 
 		 320 aa  242  6e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1333  hflC protein, putative  38.59 
 
 		 354 aa  212  7e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.792666  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2947  HflC protein  36.42 
 
 		 282 aa  194  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1663  HflC protein  34.41 
 
 		 300 aa  192  9e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.107349 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1574  HflC protein  36.79 
 
 		 300 aa  185  1.0000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000132487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2675  HflC protein  36.25 
 
 		 284 aa  182  7e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0148023 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2280  HflC protein  34.6 
 
 		 283 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0002  HflC protein  36.11 
 
 		 281 aa  177  3e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0487  HflC protein  37.07 
 
 		 283 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.426626 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2977  hypothetical protein  33.13 
 
 		 295 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1108  HflC protein  32.05 
 
 		 283 aa  169  7e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0998  HflC protein  32.05 
 
 		 283 aa  169  7e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2459  HflC protein  33.86 
 
 		 290 aa  168  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118766 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2039  HflC protein  32.19 
 
 		 318 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.826229 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1731  HflC protein  33.11 
 
 		 295 aa  165  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000316611 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0444  HflC protein  33.23 
 
 		 292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.653206  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0206  HflC protein  33.55 
 
 		 323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4004  HflC protein  31.45 
 
 		 308 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781168  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1088  HflC protein  29.9 
 
 		 328 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2023  HflC protein  33.54 
 
 		 292 aa  162  7e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.634094  normal  0.555139 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2348  hypothetical protein  31.15 
 
 		 298 aa  162  8.000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3351  HflC protein  32.48 
 
 		 311 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.713706  normal  0.149829 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3261  HflC protein  32.15 
 
 		 300 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.103141  normal  0.242798 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0629  HflC protein  33.22 
 
 		 283 aa  160  3e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2727  HflC protein  30.84 
 
 		 299 aa  160  4e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772067  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2657  HflC protein  30.38 
 
 		 316 aa  159  5e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.267381 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3382  HflC protein  31.87 
 
 		 293 aa  159  8e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2884  HflC protein  30.38 
 
 		 313 aa  158  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0867  HflC protein  33.33 
 
 		 282 aa  157  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00264104  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6096  protease activity modulator HflK  32.57 
 
 		 311 aa  156  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0703  HflC protein  31.61 
 
 		 281 aa  154  1e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1887  hflC protein  31.86 
 
 		 290 aa  154  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0578137  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1562  HflC protein  31.86 
 
 		 290 aa  154  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000166482 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2779  HflC protein  29.94 
 
 		 320 aa  153  4e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4528  HflC protein  29.94 
 
 		 325 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.788095 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0264  HflC protein  33.44 
 
 		 282 aa  150  3e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2202  hypothetical protein  35.22 
 
 		 293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0604  hypothetical protein  32.29 
 
 		 293 aa  147  3e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.256149 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1586  HflC protein  31.46 
 
 		 294 aa  147  3e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.258127  unclonable  0.000000224598 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0702  HflC protein  28.52 
 
 		 310 aa  146  5e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.999552  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4126  HflC protein  34.24 
 
 		 320 aa  146  6e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0605  HflC protein  28.72 
 
 		 312 aa  145  9e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0249897 
 
 
-
 
NC_002978  WD0832  hflC protein  32.79 
 
 		 290 aa  144  2e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.379816  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0900  HflC protein  30.77 
 
 		 289 aa  144  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.219855  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1223  putative serine protease transmembrane protein  29.56 
 
 		 304 aa  143  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00070103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2860  HflC protein  29.56 
 
 		 295 aa  142  7e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0576  HflC protein  32.49 
 
 		 298 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  hitchhiker  0.000000000249888 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3235  HflC protein  27.69 
 
 		 288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000478035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3022  hflC protein  30.52 
 
 		 308 aa  140  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000029647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1320  HflC protein  30.95 
 
 		 286 aa  140  3.9999999999999997e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.422043  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4939  hflC protein  31.97 
 
 		 289 aa  139  7e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.744013  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4167  HflC protein  30.6 
 
 		 292 aa  139  7e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000744211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0663  HflC protein  29.78 
 
 		 302 aa  139  7e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0721748  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1091  HflC protein  28.3 
 
 		 284 aa  137  2e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1159  HflC protein  29.5 
 
 		 304 aa  138  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.712281 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00091  serine protease  28.75 
 
 		 326 aa  137  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1988  putative serine protease transmembrane protein  29.06 
 
 		 296 aa  137  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0922969  normal  0.083656 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1067  HflC protein  29.19 
 
 		 304 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1178  HflC protein  31.07 
 
 		 301 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.7077 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0606  hflC protein  30.37 
 
 		 297 aa  137  4e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0600  HflC protein  29.63 
 
 		 297 aa  136  5e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00172359  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00652  Membrane protease, stomatin/prohibitin family protein  29.21 
 
 		 293 aa  136  6.0000000000000005e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0072  HflC protein  30.46 
 
 		 302 aa  136  6.0000000000000005e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.055112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3795  FtsH protease regulator HflC  29.48 
 
 		 334 aa  135  9e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3650  FtsH protease regulator HflC  29.48 
 
 		 334 aa  135  9e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0696  FtsH protease regulator HflC  29.48 
 
 		 334 aa  135  9e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0575  hypothetical protein  31.03 
 
 		 289 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0666  HflC protein  27.07 
 
 		 289 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0800  HflC protein  28.08 
 
 		 292 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00875081  hitchhiker  0.00773647 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3345  HflC protein  27.36 
 
 		 281 aa  134  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1098  HflC protein  31.54 
 
 		 301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2299  HflC protein  28.43 
 
 		 299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0783703  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002262  HflC protein  28.08 
 
 		 326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00114995  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2761  hflC protein  26.65 
 
 		 326 aa  133  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0386111  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2774  HflC protein  28.79 
 
 		 294 aa  133  3.9999999999999996e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2098  HflC protein  26.73 
 
 		 300 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0434  FtsH protease regulator HflC  29.39 
 
 		 335 aa  132  6e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.476328  unclonable  0.0000000374568 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0844  hypothetical protein  28.62 
 
 		 290 aa  132  6.999999999999999e-30  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1051  hflC protein  28.95 
 
 		 289 aa  132  6.999999999999999e-30  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3202  HflC protein  29.06 
 
 		 298 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11004  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3385  HflC protein  28.43 
 
 		 306 aa  132  7.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.279165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1280  HflC protein  28.79 
 
 		 297 aa  132  9e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.393692  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0165  HflC protein  27.42 
 
 		 286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00225021  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02635  HflC protein  31.53 
 
 		 282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0601  HflC protein  29.32 
 
 		 297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974479  hitchhiker  0.00702769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3429  HflC protein  29.32 
 
 		 297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00841397  normal  0.0439963 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1941  HflC protein  30.67 
 
 		 294 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0526  hypothetical protein  33.11 
 
 		 289 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0925485  normal  0.267523 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65270  protease subunit HflC  32.09 
 
 		 289 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1283  HflC protein  31.41 
 
 		 289 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.368114  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2078  hypothetical protein  27.97 
 
 		 303 aa  130  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0638  HflC protein  33.12 
 
 		 289 aa  130  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0112821 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0674  HflC protein  32.03 
 
 		 289 aa  130  4.0000000000000003e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>