276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0546 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0546  HflC protein  100 
 
 		 329 aa  664    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000495565  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3523  HflC protein  43.61 
 
 		 313 aa  272  6e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3679  HflC protein  44.52 
 
 		 313 aa  263  4e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3614  HflC protein  43.85 
 
 		 313 aa  258  8e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0314  hflC protein, putative  45.36 
 
 		 320 aa  255  7e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2263  HflC protein  41.72 
 
 		 310 aa  255  7e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00649366  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0185  HflC protein  44.26 
 
 		 334 aa  253  3e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2797  HflC protein  40.85 
 
 		 332 aa  238  9e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1333  hflC protein, putative  38.01 
 
 		 354 aa  203  3e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.792666  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0206  HflC protein  35.42 
 
 		 323 aa  168  2e-40  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00091  serine protease  31.87 
 
 		 326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2761  hflC protein  30.49 
 
 		 326 aa  159  8e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0386111  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4642  FtsH protease regulator HflC  30.77 
 
 		 334 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4725  FtsH protease regulator HflC  30.77 
 
 		 334 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4761  FtsH protease regulator HflC  30.77 
 
 		 334 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4782  FtsH protease regulator HflC  30.77 
 
 		 334 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220935  normal  0.242 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4632  FtsH protease regulator HflC  30.77 
 
 		 334 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0434  FtsH protease regulator HflC  29.63 
 
 		 335 aa  154  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.476328  unclonable  0.0000000374568 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04042  modulator for HflB protease specific for phage lambda cII repressor  30.45 
 
 		 334 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.040502  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3818  HflC protein  30.45 
 
 		 334 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.557877  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4706  FtsH protease regulator HflC  30.45 
 
 		 334 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3838  FtsH protease regulator HflC  30.45 
 
 		 334 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5691  FtsH protease regulator HflC  30.45 
 
 		 334 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.187921  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04004  hypothetical protein  30.45 
 
 		 334 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.054912  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4733  FtsH protease regulator HflC  30.45 
 
 		 334 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4646  FtsH protease regulator HflC  30.45 
 
 		 334 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.175793 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4417  FtsH protease regulator HflC  30.45 
 
 		 334 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002262  HflC protein  30 
 
 		 326 aa  153  5e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00114995  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2977  hypothetical protein  33.02 
 
 		 295 aa  152  7e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1091  HflC protein  32.51 
 
 		 284 aa  152  8e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2774  HflC protein  30.7 
 
 		 294 aa  151  1e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2947  HflC protein  29.41 
 
 		 282 aa  149  5e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0600  HflC protein  31.56 
 
 		 297 aa  149  6e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00172359  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0800  HflC protein  29.94 
 
 		 292 aa  149  7e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00875081  hitchhiker  0.00773647 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3022  hflC protein  30.77 
 
 		 308 aa  149  7e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000029647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0358  FtsH protease regulator HflC  29.97 
 
 		 334 aa  147  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.470776  hitchhiker  0.00397927 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0601  HflC protein  31.56 
 
 		 297 aa  147  3e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974479  hitchhiker  0.00702769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3429  HflC protein  31.56 
 
 		 297 aa  147  3e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00841397  normal  0.0439963 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0576  HflC protein  32.91 
 
 		 298 aa  147  3e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  hitchhiker  0.000000000249888 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3916  FtsH protease regulator HflC  29.75 
 
 		 331 aa  146  5e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.32908  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3650  FtsH protease regulator HflC  30.65 
 
 		 334 aa  146  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0696  FtsH protease regulator HflC  30.65 
 
 		 334 aa  146  5e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3382  HflC protein  33.12 
 
 		 293 aa  146  5e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3795  FtsH protease regulator HflC  30.65 
 
 		 334 aa  146  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0002  HflC protein  34.01 
 
 		 281 aa  146  5e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3202  HflC protein  30.09 
 
 		 298 aa  146  6e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11004  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00652  Membrane protease, stomatin/prohibitin family protein  31.46 
 
 		 293 aa  145  7.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1586  HflC protein  33.11 
 
 		 294 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.258127  unclonable  0.000000224598 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0606  hflC protein  30.68 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3718  FtsH protease regulator HflC  29.5 
 
 		 331 aa  144  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0820553  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0488  HflC protein  29.02 
 
 		 295 aa  144  2e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1663  HflC protein  27.76 
 
 		 300 aa  144  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.107349 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0538  FtsH protease regulator HflC  28.75 
 
 		 331 aa  144  3e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.255691  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0264  HflC protein  30.87 
 
 		 282 aa  144  3e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0629  HflC protein  30.33 
 
 		 283 aa  143  4e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4167  HflC protein  29.47 
 
 		 292 aa  142  6e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000744211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0578  FtsH protease regulator HflC  28.7 
 
 		 333 aa  141  9.999999999999999e-33  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0487  HflC protein  28.57 
 
 		 283 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.426626 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1223  putative serine protease transmembrane protein  29.81 
 
 		 304 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00070103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1562  HflC protein  29.1 
 
 		 290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000166482 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1887  hflC protein  29.1 
 
 		 290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0578137  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0569  HflC protein  28.97 
 
 		 292 aa  140  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000254764  normal  0.126336 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2023  HflC protein  27.9 
 
 		 292 aa  139  6e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.634094  normal  0.555139 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1108  HflC protein  28.79 
 
 		 283 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0998  HflC protein  28.79 
 
 		 283 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3308  HflC protein  33.12 
 
 		 292 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1574  HflC protein  27.06 
 
 		 300 aa  139  8.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000132487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0561  HflC protein  29.59 
 
 		 297 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000351984  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3235  HflC protein  28.7 
 
 		 288 aa  138  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000478035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3890  HflC protein  29.59 
 
 		 297 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000138111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3764  HflC protein  29.59 
 
 		 297 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000648597  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3537  HflC protein  28.22 
 
 		 292 aa  138  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000127879  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3707  HflC protein  29.59 
 
 		 297 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3981  HflC protein  27.24 
 
 		 294 aa  138  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.515796  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0328  HflC protein  28.43 
 
 		 295 aa  137  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.791365  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0605  HflC protein  27.74 
 
 		 312 aa  137  4e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0249897 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0604  hypothetical protein  31.6 
 
 		 293 aa  137  4e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.256149 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2459  HflC protein  29.22 
 
 		 290 aa  137  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118766 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2280  HflC protein  28.04 
 
 		 283 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3277  HflC protein  30.18 
 
 		 297 aa  135  9e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000125944  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1159  HflC protein  30.38 
 
 		 304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.712281 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0663  HflC protein  28.34 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0721748  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2202  hypothetical protein  28.75 
 
 		 293 aa  134  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1067  HflC protein  30.38 
 
 		 304 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277873  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0495  FtsH protease regulator HflC  28.57 
 
 		 331 aa  133  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6096  protease activity modulator HflK  28.48 
 
 		 311 aa  133  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0666  HflC protein  28.75 
 
 		 289 aa  132  6e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0703  HflC protein  29.19 
 
 		 281 aa  132  6e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2039  HflC protein  28.22 
 
 		 318 aa  132  6e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.826229 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0900  HflC protein  29.47 
 
 		 289 aa  132  9e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.219855  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4004  HflC protein  28.39 
 
 		 308 aa  132  9e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781168  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1731  HflC protein  28.01 
 
 		 295 aa  131  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000316611 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3261  HflC protein  28.4 
 
 		 300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.103141  normal  0.242798 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1283  HflC protein  29.6 
 
 		 289 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.368114  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2675  HflC protein  26.3 
 
 		 284 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0148023 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1051  hflC protein  27.3 
 
 		 289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2664  protease subunit HflC  28.83 
 
 		 291 aa  131  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3351  HflC protein  27.08 
 
 		 311 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.713706  normal  0.149829 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0886  HflC protein  29.19 
 
 		 340 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.340526 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3172  HflC protein  30.84 
 
 		 300 aa  130  3e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>