More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2797 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2797  HflC protein  100 
 
 		 332 aa  674    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0314  hflC protein, putative  59.67 
 
 		 320 aa  370  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3523  HflC protein  48.87 
 
 		 313 aa  296  5e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3679  HflC protein  49.16 
 
 		 313 aa  288  1e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3614  HflC protein  49.33 
 
 		 313 aa  288  1e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2263  HflC protein  44.41 
 
 		 310 aa  262  6.999999999999999e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00649366  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0185  HflC protein  45.79 
 
 		 334 aa  259  6e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0546  HflC protein  40.55 
 
 		 329 aa  236  4e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000495565  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2947  HflC protein  33.77 
 
 		 282 aa  182  9.000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1333  hflC protein, putative  35.85 
 
 		 354 aa  177  2e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.792666  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0002  HflC protein  35.79 
 
 		 281 aa  165  9e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2675  HflC protein  32.18 
 
 		 284 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0148023 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1574  HflC protein  33.78 
 
 		 300 aa  164  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000132487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2280  HflC protein  32.57 
 
 		 283 aa  162  9e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1887  hflC protein  30.7 
 
 		 290 aa  160  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0578137  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1562  HflC protein  30.7 
 
 		 290 aa  160  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000166482 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2459  HflC protein  32.91 
 
 		 290 aa  158  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118766 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0444  HflC protein  32.1 
 
 		 292 aa  154  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.653206  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0487  HflC protein  30.64 
 
 		 283 aa  152  1e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.426626 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2977  hypothetical protein  29.81 
 
 		 295 aa  150  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3382  HflC protein  31.35 
 
 		 293 aa  149  8e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0867  HflC protein  30.69 
 
 		 282 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00264104  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2023  HflC protein  31.55 
 
 		 292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.634094  normal  0.555139 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1108  HflC protein  31.01 
 
 		 283 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0998  HflC protein  31.01 
 
 		 283 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4126  HflC protein  32.67 
 
 		 320 aa  145  8.000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0206  HflC protein  32.69 
 
 		 323 aa  145  9e-34  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0900  HflC protein  32.25 
 
 		 289 aa  145  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.219855  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0264  HflC protein  33.01 
 
 		 282 aa  144  3e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0703  HflC protein  29.55 
 
 		 281 aa  141  1.9999999999999998e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2657  HflC protein  31.56 
 
 		 316 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.267381 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2884  HflC protein  31.56 
 
 		 313 aa  140  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2039  HflC protein  30.28 
 
 		 318 aa  139  7e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.826229 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1941  HflC protein  32.36 
 
 		 294 aa  139  7.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0629  HflC protein  29.73 
 
 		 283 aa  138  1e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4004  HflC protein  29.34 
 
 		 308 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781168  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1223  putative serine protease transmembrane protein  29.72 
 
 		 304 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00070103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2779  HflC protein  30.94 
 
 		 320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1663  HflC protein  27.99 
 
 		 300 aa  137  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.107349 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2860  HflC protein  29.43 
 
 		 295 aa  135  9e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3351  HflC protein  29.22 
 
 		 311 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.713706  normal  0.149829 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3795  FtsH protease regulator HflC  30.18 
 
 		 334 aa  133  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0696  FtsH protease regulator HflC  30.18 
 
 		 334 aa  133  3.9999999999999996e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3650  FtsH protease regulator HflC  30.18 
 
 		 334 aa  133  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4528  HflC protein  30.09 
 
 		 325 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.788095 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1088  HflC protein  28.66 
 
 		 328 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2348  hypothetical protein  29.43 
 
 		 298 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2664  protease subunit HflC  30.75 
 
 		 291 aa  131  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0663  HflC protein  30.72 
 
 		 302 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0721748  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6096  protease activity modulator HflK  28.62 
 
 		 311 aa  130  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0604  hypothetical protein  31 
 
 		 293 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.256149 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1051  hflC protein  29.28 
 
 		 289 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1586  HflC protein  29.69 
 
 		 294 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.258127  unclonable  0.000000224598 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3202  HflC protein  28.88 
 
 		 298 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11004  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2098  HflC protein  27.86 
 
 		 300 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1955  HflC protein  30.97 
 
 		 294 aa  129  7.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.905613  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3235  HflC protein  29.07 
 
 		 288 aa  129  8.000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000478035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4167  HflC protein  28.53 
 
 		 292 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000744211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0800  HflC protein  27.48 
 
 		 292 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00875081  hitchhiker  0.00773647 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0600  HflC protein  28.75 
 
 		 297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00172359  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2727  HflC protein  29.1 
 
 		 299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772067  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1283  HflC protein  28.62 
 
 		 289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.368114  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0434  FtsH protease regulator HflC  28.74 
 
 		 335 aa  127  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.476328  unclonable  0.0000000374568 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3916  FtsH protease regulator HflC  28.53 
 
 		 331 aa  127  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.32908  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3537  HflC protein  29.11 
 
 		 292 aa  127  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000127879  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0605  HflC protein  27.22 
 
 		 312 aa  127  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0249897 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0844  hypothetical protein  28.57 
 
 		 290 aa  127  3e-28  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1091  HflC protein  28.66 
 
 		 284 aa  127  3e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3718  FtsH protease regulator HflC  28.23 
 
 		 331 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0820553  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3261  HflC protein  28.39 
 
 		 300 aa  126  7e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.103141  normal  0.242798 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2202  hypothetical protein  31.78 
 
 		 293 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3277  HflC protein  29.69 
 
 		 297 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000125944  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0606  hflC protein  28.44 
 
 		 297 aa  125  9e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1320  HflC protein  27.22 
 
 		 286 aa  125  1e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.422043  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1159  HflC protein  28.61 
 
 		 304 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.712281 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0578  FtsH protease regulator HflC  28.4 
 
 		 333 aa  125  1e-27  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0674  HflC protein  27.53 
 
 		 289 aa  124  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0569  HflC protein  27.53 
 
 		 292 aa  124  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000254764  normal  0.126336 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00652  Membrane protease, stomatin/prohibitin family protein  29.75 
 
 		 293 aa  124  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2587  HflC-like protein  29.25 
 
 		 304 aa  124  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0635076  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1067  HflC protein  28.31 
 
 		 304 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0601  HflC protein  28.75 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974479  hitchhiker  0.00702769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3429  HflC protein  28.75 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00841397  normal  0.0439963 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3308  HflC protein  29.84 
 
 		 292 aa  124  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1988  putative serine protease transmembrane protein  28.48 
 
 		 296 aa  124  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0922969  normal  0.083656 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2078  hypothetical protein  27.92 
 
 		 303 aa  124  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3981  HflC protein  30.65 
 
 		 294 aa  124  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.515796  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0702  HflC protein  29.19 
 
 		 310 aa  123  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.999552  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07570  membrane bound protease regulator HflC  30.33 
 
 		 287 aa  122  8e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00091  serine protease  28.57 
 
 		 326 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4939  hflC protein  30.74 
 
 		 289 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.744013  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4632  FtsH protease regulator HflC  29.81 
 
 		 334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4642  FtsH protease regulator HflC  29.81 
 
 		 334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3172  HflC protein  28.39 
 
 		 300 aa  121  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002262  HflC protein  27.9 
 
 		 326 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00114995  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4761  FtsH protease regulator HflC  29.81 
 
 		 334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4725  FtsH protease regulator HflC  29.81 
 
 		 334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4782  FtsH protease regulator HflC  29.81 
 
 		 334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220935  normal  0.242 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3764  HflC protein  28.44 
 
 		 297 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000648597  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0561  HflC protein  28.44 
 
 		 297 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000351984  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>