More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0448 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0448  band 7 protein  100 
 
 		 295 aa  599  1e-170  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3581  band 7 protein  99.66 
 
 		 295 aa  598  1e-170  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0444  band 7 protein  98.31 
 
 		 295 aa  590  1e-167  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0445  hflC protein, putative  96.61 
 
 		 296 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4033  band 7 protein  93.9 
 
 		 295 aa  541  1e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0423  band 7 protein  93.9 
 
 		 295 aa  541  1e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3398  band 7 protein  94.58 
 
 		 295 aa  541  1e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3910  band 7 protein  93.9 
 
 		 295 aa  541  1e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3837  band 7 protein  93.9 
 
 		 295 aa  541  1e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.712498 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1062  band 7 protein  87.06 
 
 		 299 aa  521  1e-147  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3042  band 7 protein  82.31 
 
 		 295 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3650  band 7 protein  50.34 
 
 		 305 aa  315  5e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0210038  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3076  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  55.02 
 
 		 302 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561985 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2636  SPFH/band 7 family protein  48.43 
 
 		 308 aa  278  7e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000156489  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2721  band 7 protein  48.43 
 
 		 308 aa  278  7e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000149129  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1572  SPFH/band 7 family protein  48.43 
 
 		 295 aa  277  1e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.915425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4057  band 7 protein  51.54 
 
 		 287 aa  258  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3236  band 7 protein  30.14 
 
 		 295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3629  band 7 protein  30.38 
 
 		 298 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00841169  hitchhiker  0.00129487 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0978  band 7 protein  28.83 
 
 		 312 aa  136  4e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2373  band 7 protein  29.37 
 
 		 304 aa  112  6e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1108  HflC protein  29.46 
 
 		 283 aa  95.5  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0998  HflC protein  29.46 
 
 		 283 aa  95.5  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2924  band 7 protein  26.85 
 
 		 318 aa  86.3  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.839077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0815  band 7 protein  27.34 
 
 		 278 aa  86.3  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000157152  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0825  band 7 protein  30.57 
 
 		 287 aa  85.9  7e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0292375 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3604  band 7 protein  28.78 
 
 		 312 aa  84.3  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10521 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2811  band 7 protein  27.53 
 
 		 276 aa  84.7  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.103679  hitchhiker  0.00246808 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0525  membrane protease subunit HflC  27.91 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2987  band 7 protein  26.8 
 
 		 315 aa  79.7  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  hitchhiker  0.00027326 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1813  band 7 protein  24.1 
 
 		 263 aa  78.6  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2852  band 7 protein  24.55 
 
 		 284 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2498  band 7 protein  24.48 
 
 		 316 aa  76.3  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0703  HflC protein  27.14 
 
 		 281 aa  76.3  0.0000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0549  membrane protease subunit HflC  26.74 
 
 		 304 aa  75.5  0.0000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4939  hflC protein  26.44 
 
 		 289 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.744013  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07570  membrane bound protease regulator HflC  27.13 
 
 		 287 aa  74.3  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4464  band 7 protein  25.18 
 
 		 268 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0054233  normal  0.226289 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0629  HflC protein  28.4 
 
 		 283 aa  72.8  0.000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0575  hypothetical protein  25.67 
 
 		 289 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1320  HflC protein  25.87 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.422043  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0666  HflC protein  27.02 
 
 		 289 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0487  HflC protein  28.23 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.426626 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0867  HflC protein  29.87 
 
 		 282 aa  70.5  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00264104  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1405  conserved hypothetical transmembrane protein (SPFH domain / Band 7 family)  23.12 
 
 		 356 aa  70.1  0.00000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2280  HflC protein  26.88 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4401  band 7 protein  24.47 
 
 		 268 aa  69.7  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5029  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  23.97 
 
 		 267 aa  69.7  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.290689  normal  0.430447 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0253  band 7 protein  24.91 
 
 		 310 aa  69.7  0.00000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4943  HflC protein  27.12 
 
 		 289 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00429597 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4891  HflC protein  27.12 
 
 		 289 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.191561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0696  FtsH protease regulator HflC  23.41 
 
 		 334 aa  68.6  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3650  FtsH protease regulator HflC  23.41 
 
 		 334 aa  68.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3795  FtsH protease regulator HflC  23.41 
 
 		 334 aa  68.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0526  hypothetical protein  25.67 
 
 		 289 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0925485  normal  0.267523 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4767  HflC protein  27.12 
 
 		 289 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2675  HflC protein  27.05 
 
 		 284 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0148023 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3100  band 7 protein  22.97 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2947  HflC protein  27.42 
 
 		 282 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2039  HflC protein  27.5 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.826229 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1955  HflC protein  25.77 
 
 		 294 aa  67.4  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.905613  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1574  HflC protein  26.11 
 
 		 300 aa  67.4  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000132487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4167  HflC protein  23.17 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000744211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2766  HflC protein  26.49 
 
 		 291 aa  67  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.147962  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65270  protease subunit HflC  26.03 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2767  HflK protein  38.64 
 
 		 394 aa  66.6  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.397323  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5670  protease subunit HflC  26.03 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4682  HflC protein  26.72 
 
 		 289 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3537  HflC protein  24.25 
 
 		 292 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000127879  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3351  HflC protein  27.27 
 
 		 311 aa  65.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.713706  normal  0.149829 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2410  band 7 protein  27.32 
 
 		 287 aa  64.3  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1708  SPFH domain-containing protein  22.5 
 
 		 362 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2774  HflC protein  25.7 
 
 		 294 aa  64.7  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2167  hypothetical protein  23.77 
 
 		 282 aa  63.5  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.772353  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0051  hypothetical protein  44.87 
 
 		 276 aa  63.5  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.10901e-82  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00652  Membrane protease, stomatin/prohibitin family protein  24.33 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0402  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.02 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.674809  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0434  FtsH protease regulator HflC  21.93 
 
 		 335 aa  63.2  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.476328  unclonable  0.0000000374568 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0800  HflC protein  24.42 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00875081  hitchhiker  0.00773647 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4004  HflC protein  27.08 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781168  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1620  band 7 protein  27.95 
 
 		 284 aa  62.8  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000904409  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3261  HflC protein  24.91 
 
 		 300 aa  62.4  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.103141  normal  0.242798 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3202  HflC protein  22.05 
 
 		 298 aa  62.4  0.000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11004  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0638  HflC protein  25.68 
 
 		 289 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0112821 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2761  hflC protein  23.76 
 
 		 326 aa  61.2  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0386111  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0444  HflC protein  25.3 
 
 		 292 aa  61.6  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.653206  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0578  FtsH protease regulator HflC  21.38 
 
 		 333 aa  61.2  0.00000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0728  band 7 protein  24.42 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1024  band 7 protein  24.54 
 
 		 274 aa  60.8  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0565  band 7 protein  23.73 
 
 		 357 aa  60.1  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3916  FtsH protease regulator HflC  21.69 
 
 		 331 aa  60.1  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.32908  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0165  HflC protein  25.84 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00225021  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0569  HflC protein  23.2 
 
 		 292 aa  59.7  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000254764  normal  0.126336 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3718  FtsH protease regulator HflC  21.69 
 
 		 331 aa  59.7  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0820553  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0359  band 7 protein  24.6 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.741854  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2911  band 7 protein  22.54 
 
 		 376 aa  59.3  0.00000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.484171  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1330  band 7 protein  25.43 
 
 		 304 aa  59.3  0.00000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.373996  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0290  band 7 protein  23.39 
 
 		 268 aa  59.3  0.00000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0917443  normal  0.201175 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0557  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  23.39 
 
 		 268 aa  59.3  0.00000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0039  band 7 protein  24.23 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>