58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_1663 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_1663  hypothetical protein  100 
 
 
341 aa  702    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0672559  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1945  bacteriophage/transposase fusion protein  99.09 
 
 
462 aa  670    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1017  bacteriophage/transposase fusion protein  93.7 
 
 
270 aa  523  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0310816  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0534  bacteriophage/transposase fusion protein  99.22 
 
 
399 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0051  hypothetical protein  36.65 
 
 
276 aa  183  4.0000000000000006e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.10901e-82  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0145  putative transmembrane protein  33.09 
 
 
302 aa  139  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.943019  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0044  band 7 protein  32.2 
 
 
302 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.179688 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0038  band 7 protein  32.32 
 
 
302 aa  129  6e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5610  band 7 protein  31.15 
 
 
265 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.606547  normal  0.386273 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5185  band 7 protein  27.38 
 
 
277 aa  100  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.133466 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3100  band 7 protein  24.65 
 
 
318 aa  89  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0253  band 7 protein  31.87 
 
 
310 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2467  band 7 protein  26.24 
 
 
318 aa  70.5  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0849083 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3629  band 7 protein  24.82 
 
 
298 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00841169  hitchhiker  0.00129487 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3236  band 7 protein  24.55 
 
 
295 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1813  band 7 protein  23.79 
 
 
263 aa  67  0.0000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2032  band 7 protein  27.95 
 
 
303 aa  65.9  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.953686 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0825  band 7 protein  25.65 
 
 
287 aa  62.4  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0292375 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2498  band 7 protein  26.91 
 
 
316 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1185  membrane protease  24.82 
 
 
316 aa  60.5  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3837  band 7 protein  23.29 
 
 
295 aa  59.7  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.712498 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2811  band 7 protein  28.57 
 
 
276 aa  60.1  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.103679  hitchhiker  0.00246808 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4033  band 7 protein  23.29 
 
 
295 aa  59.7  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3910  band 7 protein  23.29 
 
 
295 aa  59.7  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0423  band 7 protein  23.29 
 
 
295 aa  59.7  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4917  band 7 protein  23.9 
 
 
301 aa  60.1  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.149772  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2924  band 7 protein  27.27 
 
 
318 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.839077  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3398  band 7 protein  23.17 
 
 
295 aa  57  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2636  SPFH/band 7 family protein  30.14 
 
 
308 aa  56.6  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000156489  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2721  band 7 protein  30.14 
 
 
308 aa  56.6  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000149129  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1572  SPFH/band 7 family protein  30.14 
 
 
295 aa  56.6  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.915425  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0362  band 7 protein  24.88 
 
 
321 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0728  band 7 protein  25.11 
 
 
276 aa  55.5  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3604  band 7 protein  26.57 
 
 
312 aa  55.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10521 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2167  hypothetical protein  25 
 
 
282 aa  55.1  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.772353  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4360  band 7 protein  23.29 
 
 
307 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2987  band 7 protein  27.27 
 
 
315 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  hitchhiker  0.00027326 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4422  band 7 protein  22.4 
 
 
307 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0850578 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0444  band 7 protein  23.28 
 
 
295 aa  53.1  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1062  band 7 protein  22.68 
 
 
299 aa  52.8  0.000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0445  hflC protein, putative  22.92 
 
 
296 aa  52.8  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0978  band 7 protein  22.95 
 
 
312 aa  52.4  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3042  band 7 protein  22.05 
 
 
295 aa  51.2  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3581  band 7 protein  22.76 
 
 
295 aa  51.2  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0448  band 7 protein  22.76 
 
 
295 aa  51.2  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1830  band 7 protein  24.38 
 
 
303 aa  50.4  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4464  band 7 protein  23.4 
 
 
268 aa  49.3  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0054233  normal  0.226289 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4401  band 7 protein  23.4 
 
 
268 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0815  band 7 protein  24.46 
 
 
278 aa  47.4  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000157152  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2852  band 7 protein  25.68 
 
 
284 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3076  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.94 
 
 
302 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00561985 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3569  membrane protease subunit  22.18 
 
 
258 aa  46.2  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5029  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.29 
 
 
267 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.290689  normal  0.430447 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1730  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.88 
 
 
437 aa  44.3  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04831  Band 7 protein  25.59 
 
 
267 aa  43.5  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.297877  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0605  hflK protein  23.95 
 
 
381 aa  42.7  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3980  HflK protein  28.8 
 
 
382 aa  42.7  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.758687  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0599  HflK protein  24.71 
 
 
381 aa  42.7  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0263631  hitchhiker  0.00000131875 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>