259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A1572 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A1572  SPFH/band 7 family protein  100 
 
 
295 aa  600  1.0000000000000001e-171  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.915425  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2721  band 7 protein  99.66 
 
 
308 aa  600  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000149129  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2636  SPFH/band 7 family protein  99.66 
 
 
308 aa  600  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000156489  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3076  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  51.93 
 
 
302 aa  301  7.000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00561985 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1062  band 7 protein  48.6 
 
 
299 aa  285  5e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3042  band 7 protein  48.58 
 
 
295 aa  278  1e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0444  band 7 protein  48.43 
 
 
295 aa  278  1e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4033  band 7 protein  50.73 
 
 
295 aa  276  2e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3910  band 7 protein  50.73 
 
 
295 aa  276  2e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3837  band 7 protein  50.73 
 
 
295 aa  276  2e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.712498 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0423  band 7 protein  50.73 
 
 
295 aa  276  2e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3398  band 7 protein  50 
 
 
295 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0445  hflC protein, putative  47.39 
 
 
296 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0448  band 7 protein  48.74 
 
 
295 aa  270  1e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3581  band 7 protein  48.74 
 
 
295 aa  270  1e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3650  band 7 protein  44.01 
 
 
305 aa  263  3e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0210038  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4057  band 7 protein  37.73 
 
 
287 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0978  band 7 protein  30.28 
 
 
312 aa  140  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3236  band 7 protein  28.52 
 
 
295 aa  136  5e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3629  band 7 protein  28.99 
 
 
298 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00841169  hitchhiker  0.00129487 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2373  band 7 protein  26.99 
 
 
304 aa  97.8  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0815  band 7 protein  25.52 
 
 
278 aa  82.8  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000157152  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2811  band 7 protein  26.95 
 
 
276 aa  80.5  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.103679  hitchhiker  0.00246808 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1813  band 7 protein  22.79 
 
 
263 aa  77.8  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3604  band 7 protein  24.54 
 
 
312 aa  75.5  0.0000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10521 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2924  band 7 protein  24.05 
 
 
318 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.839077  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1108  HflC protein  26.47 
 
 
283 aa  75.5  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0998  HflC protein  26.47 
 
 
283 aa  75.5  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2167  hypothetical protein  25.56 
 
 
282 aa  75.1  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.772353  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0253  band 7 protein  24.41 
 
 
310 aa  73.6  0.000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0728  band 7 protein  24.63 
 
 
276 aa  73.6  0.000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2987  band 7 protein  23.43 
 
 
315 aa  72.8  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  hitchhiker  0.00027326 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5029  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  22.73 
 
 
267 aa  71.2  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.290689  normal  0.430447 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0051  hypothetical protein  41.76 
 
 
276 aa  71.2  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.10901e-82  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0825  band 7 protein  25.28 
 
 
287 aa  67.8  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0292375 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2852  band 7 protein  20.55 
 
 
284 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4464  band 7 protein  22.38 
 
 
268 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0054233  normal  0.226289 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4401  band 7 protein  23.08 
 
 
268 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3822  HflK protein  27.11 
 
 
311 aa  64.3  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0972078  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0565  band 7 protein  23.18 
 
 
357 aa  63.5  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1663  HflC protein  22.81 
 
 
300 aa  62.8  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.107349 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0600  HflC protein  22.7 
 
 
297 aa  60.5  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00172359  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4167  HflC protein  21.77 
 
 
292 aa  60.8  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000744211  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3235  HflC protein  22.7 
 
 
288 aa  60.1  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000478035  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3537  HflC protein  24.73 
 
 
292 aa  59.3  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000127879  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3821  band 7 protein  24.34 
 
 
301 aa  59.3  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.153561  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1352  HflC protein  23.97 
 
 
300 aa  58.9  0.00000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1396  hflC protein  23.97 
 
 
300 aa  58.9  0.00000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.685975  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3202  HflC protein  22.91 
 
 
298 aa  58.9  0.00000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11004  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0601  HflC protein  23.55 
 
 
297 aa  58.9  0.00000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974479  hitchhiker  0.00702769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3429  HflC protein  23.55 
 
 
297 aa  58.9  0.00000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00841397  normal  0.0439963 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0606  hflC protein  23.91 
 
 
297 aa  58.5  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0800  HflC protein  22.26 
 
 
292 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00875081  hitchhiker  0.00773647 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2816  HFLC protein  23.02 
 
 
305 aa  57.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.273715  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2039  HflC protein  25.48 
 
 
318 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.826229 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4599  band 7 protein  21.13 
 
 
315 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.235432  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3022  hflC protein  23.08 
 
 
308 aa  57  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000029647  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1663  hypothetical protein  30.14 
 
 
341 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0672559  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1727  band 7 protein  26.98 
 
 
472 aa  56.6  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000752152  normal  0.0958573 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2774  HflC protein  25.74 
 
 
294 aa  56.2  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0487  HflC protein  25.1 
 
 
283 aa  55.8  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.426626 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2498  band 7 protein  22.3 
 
 
316 aa  55.8  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0167  band 7 protein  22.86 
 
 
312 aa  55.8  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1873  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  22.51 
 
 
280 aa  55.5  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0154028  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1017  bacteriophage/transposase fusion protein  30.2 
 
 
270 aa  55.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0310816  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0165  HflC protein  27.59 
 
 
286 aa  55.5  0.000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00225021  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3855  band 7 protein  21.58 
 
 
366 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00173128  unclonable  0.00000981253 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6096  protease activity modulator HflK  25 
 
 
311 aa  55.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0666  HflC protein  25.91 
 
 
289 aa  55.1  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0569  HflC protein  23.76 
 
 
292 aa  55.1  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000254764  normal  0.126336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0496  band 7 protein  20.43 
 
 
282 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1938  band 7 protein  25.09 
 
 
381 aa  54.7  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2675  HflC protein  24.52 
 
 
284 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0148023 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3351  HflC protein  25.48 
 
 
311 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.713706  normal  0.149829 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04831  Band 7 protein  21.03 
 
 
267 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.297877  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11517  hypothetical protein  24.4 
 
 
381 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.18068 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3100  band 7 protein  21 
 
 
318 aa  55.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0512  band 7 protein  20.43 
 
 
282 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000338316 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00652  Membrane protease, stomatin/prohibitin family protein  25.36 
 
 
293 aa  53.9  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0629  HflC protein  24.21 
 
 
283 aa  53.9  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3890  HflC protein  22.91 
 
 
297 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000138111  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3707  HflC protein  22.91 
 
 
297 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572982  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1572  band 7 protein  24.61 
 
 
307 aa  54.3  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3397  band 7 protein  22.41 
 
 
279 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.149189 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3764  HflC protein  22.91 
 
 
297 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000648597  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0561  HflC protein  22.91 
 
 
297 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000351984  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0264  HflC protein  28.49 
 
 
282 aa  53.5  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2629  HflC protein  24.48 
 
 
293 aa  53.5  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000539146 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0549  membrane protease subunit HflC  20.93 
 
 
304 aa  53.1  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1795  HflC protein  23.68 
 
 
300 aa  52.8  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0900  HflC protein  22.71 
 
 
289 aa  52.8  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.219855  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1405  conserved hypothetical transmembrane protein (SPFH domain / Band 7 family)  23.32 
 
 
356 aa  52.4  0.000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2728  hypothetical protein  25.45 
 
 
293 aa  52.4  0.000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000677949 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4004  HflC protein  23.97 
 
 
308 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781168  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0525  membrane protease subunit HflC  22.13 
 
 
304 aa  51.6  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0488  HflC protein  22.83 
 
 
295 aa  51.6  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1574  HflC protein  22.53 
 
 
300 aa  51.6  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000132487  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0568  HflK protein  35.38 
 
 
380 aa  51.6  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0118849  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2127  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.58 
 
 
286 aa  50.4  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.458205  normal  0.678014 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1845  band 7 protein  21.28 
 
 
280 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>