More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4057 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4057  band 7 protein  100 
 
 		 287 aa  577  1e-164  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3650  band 7 protein  58.82 
 
 		 305 aa  333  2e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0210038  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1062  band 7 protein  51.12 
 
 		 299 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0444  band 7 protein  48.59 
 
 		 295 aa  279  3e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0445  hflC protein, putative  48.24 
 
 		 296 aa  277  2e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3398  band 7 protein  51.74 
 
 		 295 aa  276  2e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3042  band 7 protein  50.74 
 
 		 295 aa  276  2e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0448  band 7 protein  51.74 
 
 		 295 aa  275  7e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3581  band 7 protein  51.74 
 
 		 295 aa  275  7e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3837  band 7 protein  50.19 
 
 		 295 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.712498 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0423  band 7 protein  50.19 
 
 		 295 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3910  band 7 protein  50.19 
 
 		 295 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4033  band 7 protein  50.19 
 
 		 295 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3076  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  46.76 
 
 		 302 aa  269  4e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561985 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2721  band 7 protein  36.99 
 
 		 308 aa  219  3.9999999999999997e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000149129  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2636  SPFH/band 7 family protein  36.99 
 
 		 308 aa  219  3.9999999999999997e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000156489  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1572  SPFH/band 7 family protein  37.77 
 
 		 295 aa  216  5e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.915425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0978  band 7 protein  33.33 
 
 		 312 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3236  band 7 protein  33.33 
 
 		 295 aa  143  3e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3629  band 7 protein  32.95 
 
 		 298 aa  139  7e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00841169  hitchhiker  0.00129487 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2373  band 7 protein  34.4 
 
 		 304 aa  118  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2987  band 7 protein  34.13 
 
 		 315 aa  108  8.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  hitchhiker  0.00027326 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2924  band 7 protein  32.87 
 
 		 318 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.839077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2811  band 7 protein  31.87 
 
 		 276 aa  104  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.103679  hitchhiker  0.00246808 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0815  band 7 protein  26.77 
 
 		 278 aa  102  9e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000157152  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3604  band 7 protein  33.45 
 
 		 312 aa  98.2  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10521 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0825  band 7 protein  30.31 
 
 		 287 aa  96.3  6e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0292375 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1813  band 7 protein  25.09 
 
 		 263 aa  81.6  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0051  hypothetical protein  26.79 
 
 		 276 aa  77.8  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.10901e-82  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2167  hypothetical protein  26.38 
 
 		 282 aa  76.3  0.0000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.772353  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2089  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.12 
 
 		 259 aa  73.9  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5029  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.62 
 
 		 267 aa  70.1  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.290689  normal  0.430447 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0728  band 7 protein  23.44 
 
 		 276 aa  69.3  0.00000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3795  FtsH protease regulator HflC  22.71 
 
 		 334 aa  68.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3650  FtsH protease regulator HflC  22.71 
 
 		 334 aa  68.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0696  FtsH protease regulator HflC  22.71 
 
 		 334 aa  68.2  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3100  band 7 protein  23.18 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2816  HFLC protein  28.32 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.273715  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4464  band 7 protein  23.14 
 
 		 268 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0054233  normal  0.226289 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02635  HflC protein  26.64 
 
 		 282 aa  66.6  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0998  HflC protein  29.29 
 
 		 283 aa  65.1  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1108  HflC protein  29.29 
 
 		 283 aa  65.1  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4401  band 7 protein  22.75 
 
 		 268 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3718  FtsH protease regulator HflC  22.95 
 
 		 331 aa  63.9  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0820553  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2852  band 7 protein  25.09 
 
 		 284 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2947  HflC protein  29.41 
 
 		 282 aa  63.5  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0179  band 7 protein  21.33 
 
 		 363 aa  63.2  0.000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04042  modulator for HflB protease specific for phage lambda cII repressor  22.22 
 
 		 334 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.040502  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3818  HflC protein  22.22 
 
 		 334 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.557877  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5691  FtsH protease regulator HflC  22.22 
 
 		 334 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.187921  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04004  hypothetical protein  22.22 
 
 		 334 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.054912  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4706  FtsH protease regulator HflC  22.22 
 
 		 334 aa  62.8  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4733  FtsH protease regulator HflC  22.22 
 
 		 334 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3838  FtsH protease regulator HflC  22.22 
 
 		 334 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1574  HflC protein  26.41 
 
 		 300 aa  62.8  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000132487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4646  FtsH protease regulator HflC  22.22 
 
 		 334 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.175793 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4417  FtsH protease regulator HflC  22.22 
 
 		 334 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2348  hypothetical protein  29.96 
 
 		 298 aa  62.8  0.000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3015  HflC protein  28.85 
 
 		 287 aa  62.8  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.698845  normal  0.140863 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2587  HflC-like protein  26.17 
 
 		 304 aa  62.4  0.000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0635076  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3916  FtsH protease regulator HflC  22.3 
 
 		 331 aa  62  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.32908  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6096  protease activity modulator HflK  29.32 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4712  band 7 protein  27.05 
 
 		 284 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.21194 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4834  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.05 
 
 		 284 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.220458  normal  0.54169 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0564  band 7 protein  25.44 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.396207  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2727  HflC protein  30.99 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772067  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0487  HflC protein  25.2 
 
 		 283 aa  60.1  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.426626 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0358  FtsH protease regulator HflC  21.53 
 
 		 334 aa  59.3  0.00000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.470776  hitchhiker  0.00397927 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4004  HflC protein  29.76 
 
 		 308 aa  59.3  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781168  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4782  FtsH protease regulator HflC  21.88 
 
 		 334 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220935  normal  0.242 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4725  FtsH protease regulator HflC  21.88 
 
 		 334 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4761  FtsH protease regulator HflC  21.88 
 
 		 334 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4632  FtsH protease regulator HflC  21.88 
 
 		 334 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1955  HflC protein  30.13 
 
 		 294 aa  58.9  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.905613  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4642  FtsH protease regulator HflC  21.88 
 
 		 334 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1663  HflC protein  26.57 
 
 		 300 aa  58.9  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.107349 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0538  FtsH protease regulator HflC  22.11 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.255691  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0436  Band 7 protein  22.16 
 
 		 249 aa  58.2  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.155422  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0600  HflC protein  25.57 
 
 		 297 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00172359  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19780  SPFH domain, Band 7 family protein  25.85 
 
 		 456 aa  57.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.295891  hitchhiker  0.000474854 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2767  HflK protein  28.02 
 
 		 394 aa  57.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.397323  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2467  band 7 protein  29.32 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0849083 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0434  FtsH protease regulator HflC  22.22 
 
 		 335 aa  57.4  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.476328  unclonable  0.0000000374568 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1320  HflC protein  27.2 
 
 		 286 aa  57  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.422043  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4890  band 7 protein  26.07 
 
 		 284 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.152851  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0606  hflC protein  25.1 
 
 		 297 aa  57  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1786  integral membrane proteinase  24.51 
 
 		 287 aa  57  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1721  HflC protein  24.51 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3351  HflC protein  28.08 
 
 		 311 aa  57  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.713706  normal  0.149829 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0601  HflC protein  25.95 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974479  hitchhiker  0.00702769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3429  HflC protein  25.95 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00841397  normal  0.0439963 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1182  membrane protease  23.96 
 
 		 299 aa  57  0.0000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3345  HflC protein  29.13 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0629  HflC protein  26.45 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0613  band 7 protein  28.51 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.953423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04831  Band 7 protein  25.39 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.297877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1708  SPFH domain-containing protein  22.8 
 
 		 362 aa  56.2  0.0000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2675  HflC protein  27.91 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0148023 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3261  HflC protein  28.35 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.103141  normal  0.242798 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0578  FtsH protease regulator HflC  21 
 
 		 333 aa  55.8  0.0000007  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>