More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2373 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2373  band 7 protein  100 
 
 		 304 aa  619  1e-176  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3650  band 7 protein  35.33 
 
 		 305 aa  159  8e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0210038  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0444  band 7 protein  31.35 
 
 		 295 aa  142  7e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1062  band 7 protein  32.86 
 
 		 299 aa  138  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3837  band 7 protein  31.65 
 
 		 295 aa  136  4e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.712498 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4033  band 7 protein  31.65 
 
 		 295 aa  136  4e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3910  band 7 protein  31.65 
 
 		 295 aa  136  4e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0423  band 7 protein  31.65 
 
 		 295 aa  136  4e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0445  hflC protein, putative  31.16 
 
 		 296 aa  136  5e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3398  band 7 protein  31.25 
 
 		 295 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0448  band 7 protein  30.88 
 
 		 295 aa  132  5e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3581  band 7 protein  30.88 
 
 		 295 aa  132  5e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3042  band 7 protein  32.99 
 
 		 295 aa  132  6e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3076  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  31.12 
 
 		 302 aa  124  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561985 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0978  band 7 protein  27.09 
 
 		 312 aa  122  5e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4057  band 7 protein  34.3 
 
 		 287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1572  SPFH/band 7 family protein  26.99 
 
 		 295 aa  120  3e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.915425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2636  SPFH/band 7 family protein  26.99 
 
 		 308 aa  120  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000156489  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2721  band 7 protein  26.99 
 
 		 308 aa  120  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000149129  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3236  band 7 protein  29.27 
 
 		 295 aa  99.4  6e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3629  band 7 protein  30.58 
 
 		 298 aa  99  9e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00841169  hitchhiker  0.00129487 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0604  hypothetical protein  30.72 
 
 		 293 aa  80.9  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.256149 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1088  HflC protein  26.77 
 
 		 328 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0769  band 7 protein  24.57 
 
 		 266 aa  80.5  0.00000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.953295  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0929  Band 7 protein  32.92 
 
 		 332 aa  80.5  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0815  band 7 protein  25.57 
 
 		 278 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000157152  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0487  HflC protein  28.24 
 
 		 283 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.426626 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1333  hflC protein, putative  24.92 
 
 		 354 aa  79.7  0.00000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.792666  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4528  HflC protein  27.44 
 
 		 325 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.788095 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1813  band 7 protein  26.67 
 
 		 263 aa  79  0.00000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0525  membrane protease subunit HflC  29.69 
 
 		 304 aa  78.6  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2987  band 7 protein  26.82 
 
 		 315 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  hitchhiker  0.00027326 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19780  SPFH domain, Band 7 family protein  28.29 
 
 		 456 aa  78.6  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.295891  hitchhiker  0.000474854 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0557  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.74 
 
 		 268 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0549  membrane protease subunit HflC  29.52 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0404  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.77 
 
 		 322 aa  77.8  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.188122 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0564  band 7 protein  25.61 
 
 		 309 aa  78.2  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.396207  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0290  band 7 protein  25.74 
 
 		 268 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0917443  normal  0.201175 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2766  HflC protein  26.55 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.147962  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0613  band 7 protein  28.45 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.953423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1623  band 7 protein  25.32 
 
 		 268 aa  77  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2078  hypothetical protein  26.81 
 
 		 303 aa  75.9  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2924  band 7 protein  26.58 
 
 		 318 aa  75.9  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.839077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0061  band 7 protein  26.13 
 
 		 305 aa  75.9  0.0000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0011407  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0359  band 7 protein  24.27 
 
 		 268 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.741854  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1955  HflC protein  28.04 
 
 		 294 aa  75.1  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.905613  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2280  HflC protein  27.21 
 
 		 283 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0061  band 7 protein  25.68 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00313093  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4401  band 7 protein  24.33 
 
 		 268 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0768  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.36 
 
 		 295 aa  75.1  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.441934 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0531  band 7 protein  24.44 
 
 		 317 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.768423 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0260  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.88 
 
 		 286 aa  73.9  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2146  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.15 
 
 		 322 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1928  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.15 
 
 		 321 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1890  stomatin-like protein  24.15 
 
 		 322 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1880  stomatin-like protein  24.15 
 
 		 322 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0436  Band 7 protein  30.1 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.155422  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2075  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.15 
 
 		 321 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2106  SPFH domain/Band 7 family protein  24.15 
 
 		 321 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4464  band 7 protein  24 
 
 		 268 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0054233  normal  0.226289 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0157  inner membrane protein  31.33 
 
 		 318 aa  73.6  0.000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.131876  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2174  SPFH domain/Band 7 family protein  24.15 
 
 		 322 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.268114  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0138  band 7 protein  31.33 
 
 		 318 aa  73.2  0.000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2189  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.58 
 
 		 328 aa  72.8  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0577591  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2977  hypothetical protein  28.28 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3243  SPFH domain/Band 7 family protein  23.73 
 
 		 322 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000635475  normal  0.334624 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2064  SPFH domain/Band 7 family protein  23.73 
 
 		 322 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101789  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1932  band 7 protein  26.54 
 
 		 315 aa  72.4  0.000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000138273 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0702  HflC protein  26.48 
 
 		 310 aa  72.4  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.999552  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1560  band 7 protein  24.18 
 
 		 322 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.140523  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2860  HflC protein  25.53 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4837  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.5 
 
 		 325 aa  71.6  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2665  heat shock protein HslU  27.27 
 
 		 386 aa  71.6  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.288159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1924  band 7 protein  24.15 
 
 		 322 aa  72  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159861  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3604  band 7 protein  27.17 
 
 		 312 aa  71.6  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10521 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0605  HflC protein  27.84 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0249897 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2947  HflC protein  25.57 
 
 		 282 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5341  band 7 protein  27.3 
 
 		 307 aa  70.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.207546  normal  0.117184 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3523  HflC protein  25.63 
 
 		 313 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0867  HflC protein  25.82 
 
 		 282 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00264104  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21690  SPFH domain, Band 7 family protein  28.08 
 
 		 429 aa  71.2  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.389538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1179  band 7 protein  26.76 
 
 		 403 aa  71.6  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.473377  decreased coverage  0.000901683 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2098  HflC protein  26.45 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0416  band 7 protein  28.15 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1219  membrane protease family stomatin/prohibitin-like protein  25.76 
 
 		 271 aa  71.2  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0532585  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3345  HflC protein  27.82 
 
 		 281 aa  71.2  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61642  Stomatin-like protein 3  25.6 
 
 		 340 aa  71.2  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1108  HflC protein  25.09 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0998  HflC protein  25.09 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3110  band 7 protein  27.27 
 
 		 282 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00709216  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3720  hypothetical protein  30.24 
 
 		 344 aa  70.9  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1429  band 7 protein  25.83 
 
 		 394 aa  70.9  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1446  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.09 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0162555  normal  0.124024 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0497  hypothetical protein  26.91 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.988378  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4843  band 7 protein  29.46 
 
 		 336 aa  70.1  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1060  membrane protease family stomatin/prohibitin-like protein  25.33 
 
 		 276 aa  70.5  0.00000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.457303  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3421  band 7 protein  26.29 
 
 		 402 aa  70.1  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2247  band 7 protein  26.15 
 
 		 324 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0154537 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1330  band 7 protein  24.89 
 
 		 304 aa  70.1  0.00000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.373996  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2779  HflC protein  26.67 
 
 		 320 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.312194 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>