82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1182 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1182  membrane protease  100 
 
 
299 aa  612  9.999999999999999e-175  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4917  band 7 protein  26.32 
 
 
301 aa  84.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.149772  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4360  band 7 protein  25.18 
 
 
307 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0253  band 7 protein  27.34 
 
 
310 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2032  band 7 protein  22.03 
 
 
303 aa  65.9  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.953686 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1185  membrane protease  25.89 
 
 
316 aa  65.1  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4422  band 7 protein  24.46 
 
 
307 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0850578 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3569  membrane protease subunit  24.16 
 
 
258 aa  63.2  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2467  band 7 protein  25.29 
 
 
318 aa  63.2  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0849083 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5029  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.34 
 
 
267 aa  63.2  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.290689  normal  0.430447 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5610  band 7 protein  26.22 
 
 
265 aa  62.8  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.606547  normal  0.386273 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1830  band 7 protein  22.4 
 
 
303 aa  62.4  0.000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0978  band 7 protein  22.35 
 
 
312 aa  62.4  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0038  band 7 protein  26.47 
 
 
302 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0044  band 7 protein  26.47 
 
 
302 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.179688 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1813  band 7 protein  23.02 
 
 
263 aa  60.1  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1730  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.45 
 
 
437 aa  59.3  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5185  band 7 protein  23.6 
 
 
277 aa  59.3  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.133466 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0145  putative transmembrane protein  26.47 
 
 
302 aa  59.3  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.943019  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2498  band 7 protein  25.88 
 
 
316 aa  58.9  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0179  band 7 protein  24.47 
 
 
363 aa  58.2  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3236  band 7 protein  23.24 
 
 
295 aa  57.4  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3016  HflK protein  27.53 
 
 
377 aa  56.6  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.579125  normal  0.214835 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04831  Band 7 protein  25.37 
 
 
267 aa  56.6  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.297877  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2852  band 7 protein  27.74 
 
 
284 aa  56.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00780  prohibitin PHB1, putative  23.75 
 
 
274 aa  56.2  0.0000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3604  band 7 protein  20.72 
 
 
312 aa  55.8  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10521 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2987  band 7 protein  21.17 
 
 
315 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  hitchhiker  0.00027326 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3629  band 7 protein  22.12 
 
 
298 aa  53.9  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00841169  hitchhiker  0.00129487 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3397  band 7 protein  24.33 
 
 
279 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.149189 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4464  band 7 protein  22.52 
 
 
268 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0054233  normal  0.226289 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2728  hypothetical protein  22.87 
 
 
293 aa  53.5  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000677949 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1448  SPFH domain-containing protein  25.58 
 
 
359 aa  53.1  0.000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.125445  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2924  band 7 protein  20.94 
 
 
318 aa  52.8  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.839077  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4401  band 7 protein  22.52 
 
 
268 aa  52.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08236  hypothetical protein  23.67 
 
 
271 aa  52.8  0.000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12321  Band 7 protein  24.43 
 
 
266 aa  52.8  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0815  band 7 protein  20.32 
 
 
278 aa  52.4  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000157152  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3650  band 7 protein  18.52 
 
 
305 aa  52  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0210038  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0362  band 7 protein  21.76 
 
 
321 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3042  band 7 protein  22.27 
 
 
295 aa  51.2  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3545  band 7 protein  22.18 
 
 
291 aa  50.8  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.978436  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1722  HflK protein  27.23 
 
 
379 aa  50.8  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1787  HflK protein  27.23 
 
 
379 aa  50.8  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3018  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.32 
 
 
261 aa  50.4  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.126407  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00686  prohibitin complex subunit Phb1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13470)  22.13 
 
 
280 aa  50.1  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1815  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  23.9 
 
 
267 aa  50.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.11992  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0854  cation-transporting ATPase, P-type  26.59 
 
 
364 aa  49.7  0.00005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05391  Band 7 protein  23.9 
 
 
267 aa  50.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.289277 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4200  band 7 protein  22.49 
 
 
268 aa  49.7  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.525075  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0303  SPFH domain-containing protein  25.61 
 
 
364 aa  49.3  0.00007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.496264  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0728  band 7 protein  23.01 
 
 
276 aa  49.3  0.00008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3100  band 7 protein  23.85 
 
 
318 aa  49.3  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1572  SPFH/band 7 family protein  19.3 
 
 
295 aa  48.1  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.915425  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0512  band 7 protein  23.6 
 
 
282 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000338316 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0496  band 7 protein  23.6 
 
 
282 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3076  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  22.08 
 
 
302 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00561985 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13107  hypothetical protein  24.9 
 
 
295 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.054707  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2636  SPFH/band 7 family protein  19.3 
 
 
308 aa  48.1  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000156489  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2721  band 7 protein  19.3 
 
 
308 aa  48.1  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000149129  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12799  prohibitin-like protein  24.48 
 
 
244 aa  47.4  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.15456  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0445  hflC protein, putative  21.74 
 
 
296 aa  47  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1810  Band 7 protein  25.2 
 
 
264 aa  47  0.0004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05381  Band 7 protein  25.7 
 
 
267 aa  47  0.0004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05091  Band 7 protein  25.7 
 
 
267 aa  47  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1845  band 7 protein  25.4 
 
 
280 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0444  band 7 protein  21.52 
 
 
295 aa  46.6  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41824  predicted protein  23.75 
 
 
282 aa  46.6  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.699109  normal  0.209561 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02636  integral membrane protease subunit  27.91 
 
 
375 aa  46.2  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1873  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.7 
 
 
280 aa  46.2  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0154028  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4057  band 7 protein  22.44 
 
 
287 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05461  Band 7 protein  25.3 
 
 
268 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.178963  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_76983  predicted protein  23.53 
 
 
302 aa  45.4  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0483  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.7 
 
 
267 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0524  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25 
 
 
264 aa  45.4  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.675016 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_54960  predicted protein  21.24 
 
 
269 aa  45.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3709  hypothetical protein  25.21 
 
 
436 aa  44.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731081  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1062  band 7 protein  21.23 
 
 
299 aa  44.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2108  SPFH domain-containing protein  25.17 
 
 
370 aa  43.9  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06073  putative prohibitin (Eurofung)  20.81 
 
 
307 aa  43.5  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.453994  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2167  hypothetical protein  22.36 
 
 
282 aa  43.1  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.772353  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1708  SPFH domain-containing protein  23.48 
 
 
362 aa  42.4  0.008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>