122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3569 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3569  membrane protease subunit  100 
 
 		 258 aa  520  1e-146  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4360  band 7 protein  30.35 
 
 		 307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4422  band 7 protein  29.96 
 
 		 307 aa  139  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0850578 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4200  band 7 protein  30.22 
 
 		 268 aa  129  6e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.525075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0253  band 7 protein  30.77 
 
 		 310 aa  125  1e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0362  band 7 protein  27.6 
 
 		 321 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1830  band 7 protein  31.01 
 
 		 303 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08236  hypothetical protein  31.74 
 
 		 271 aa  118  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4917  band 7 protein  27.76 
 
 		 301 aa  116  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.149772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2032  band 7 protein  30.33 
 
 		 303 aa  115  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.953686 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1957  band 7 protein  25.74 
 
 		 360 aa  100  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0790596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1185  membrane protease  27.03 
 
 		 316 aa  94.7  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2467  band 7 protein  25 
 
 		 318 aa  80.1  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0849083 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1813  band 7 protein  25.11 
 
 		 263 aa  79  0.00000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2498  band 7 protein  28.11 
 
 		 316 aa  77.8  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0825  band 7 protein  25.19 
 
 		 287 aa  77  0.0000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0292375 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0815  band 7 protein  23.72 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000157152  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3709  hypothetical protein  26.02 
 
 		 436 aa  72  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2167  hypothetical protein  25.21 
 
 		 282 aa  72  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.772353  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0179  band 7 protein  26.84 
 
 		 363 aa  68.6  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0978  band 7 protein  25.76 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3236  band 7 protein  25.69 
 
 		 295 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00686  prohibitin complex subunit Phb1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13470)  22.53 
 
 		 280 aa  67.4  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3100  band 7 protein  23.72 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_54958  prohibitin-like protein  24.73 
 
 		 284 aa  65.9  0.0000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49447  predicted protein  24 
 
 		 275 aa  65.1  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0166572  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_54960  predicted protein  23.04 
 
 		 269 aa  65.1  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4401  band 7 protein  23.41 
 
 		 268 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06073  putative prohibitin (Eurofung)  22.77 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.453994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2728  hypothetical protein  24.88 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000677949 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3629  band 7 protein  25 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00841169  hitchhiker  0.00129487 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4464  band 7 protein  23.41 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0054233  normal  0.226289 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1182  membrane protease  24.16 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0854  cation-transporting ATPase, P-type  25 
 
 		 364 aa  62.8  0.000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_76983  predicted protein  21.3 
 
 		 302 aa  62  0.000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41824  predicted protein  23.12 
 
 		 282 aa  61.6  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.699109  normal  0.209561 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29372  predicted protein  28.57 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5185  band 7 protein  25.67 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.133466 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1708  SPFH domain-containing protein  24.89 
 
 		 362 aa  60.1  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5610  band 7 protein  21.72 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.606547  normal  0.386273 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2852  band 7 protein  22.22 
 
 		 284 aa  58.9  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0317  SPFH domain-containing protein  25.59 
 
 		 362 aa  58.5  0.00000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.134016  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0295  SPFH domain-containing protein  25.59 
 
 		 362 aa  58.5  0.00000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1448  SPFH domain-containing protein  25.32 
 
 		 359 aa  58.2  0.0000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.125445  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2108  SPFH domain-containing protein  24.31 
 
 		 370 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1405  conserved hypothetical transmembrane protein (SPFH domain / Band 7 family)  24 
 
 		 356 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12799  prohibitin-like protein  22.63 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.15456  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0564  band 7 protein  28.24 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.396207  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0061  band 7 protein  29.49 
 
 		 305 aa  57  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00313093  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0061  band 7 protein  29.49 
 
 		 305 aa  57  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0011407  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1730  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.35 
 
 		 437 aa  56.6  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1330  band 7 protein  28.71 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.373996  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00780  prohibitin PHB1, putative  17.29 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0303  SPFH domain-containing protein  24.64 
 
 		 364 aa  55.8  0.0000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.496264  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0729  band 7 protein  27.57 
 
 		 310 aa  55.5  0.0000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1091  band 7 protein  27.59 
 
 		 282 aa  55.5  0.0000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61642  Stomatin-like protein 3  23.67 
 
 		 340 aa  54.7  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5029  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  20.69 
 
 		 267 aa  52.8  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.290689  normal  0.430447 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3545  band 7 protein  22.83 
 
 		 291 aa  52.4  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.978436  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00070  proteolysis and peptidolysis-related protein, putative  22.58 
 
 		 318 aa  52  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0637663  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1620  band 7 protein  24.48 
 
 		 284 aa  51.6  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000904409  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0235  band 7 protein  26.83 
 
 		 331 aa  51.2  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.144192 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1327  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  23.66 
 
 		 285 aa  50.8  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.7737 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2924  band 7 protein  19.93 
 
 		 318 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.839077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3397  band 7 protein  24 
 
 		 279 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.149189 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2105  band 7 protein  24.51 
 
 		 275 aa  50.4  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.585176 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0691  band 7 protein  24.3 
 
 		 311 aa  50.1  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1873  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24 
 
 		 280 aa  49.7  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0154028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2987  band 7 protein  20.7 
 
 		 315 aa  48.9  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  hitchhiker  0.00027326 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0786  band 7 protein  28.11 
 
 		 295 aa  48.9  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0842  band 7 protein  25.13 
 
 		 290 aa  48.1  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.360301 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1845  band 7 protein  24.31 
 
 		 280 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0014  band 7 protein  24.14 
 
 		 267 aa  47.8  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2198  band 7 protein  30.12 
 
 		 333 aa  47.8  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5109  band 7 protein  23.63 
 
 		 326 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.000505876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2811  band 7 protein  25.64 
 
 		 276 aa  47.4  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.103679  hitchhiker  0.00246808 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14640  band 7 protein  29.82 
 
 		 326 aa  47.8  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000590764  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0436  Band 7 protein  20.65 
 
 		 249 aa  47.4  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.155422  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0430  band 7 protein  21.92 
 
 		 261 aa  47  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.617904  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3018  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  22.13 
 
 		 261 aa  46.6  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.126407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1876  Band 7 protein  23.14 
 
 		 372 aa  46.6  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.918584  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1017  bacteriophage/transposase fusion protein  21.76 
 
 		 270 aa  46.6  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0310816  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1863  stomatin like protein  24.89 
 
 		 312 aa  46.6  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.510549  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0534  bacteriophage/transposase fusion protein  22.18 
 
 		 399 aa  46.6  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03163  stomatin family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G13440)  21.22 
 
 		 344 aa  46.2  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000111166  normal  0.837259 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0145  putative transmembrane protein  19.49 
 
 		 302 aa  46.2  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.943019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3473  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  23.27 
 
 		 264 aa  46.2  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00917354 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1663  hypothetical protein  22.18 
 
 		 341 aa  46.2  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0672559  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12321  Band 7 protein  21.4 
 
 		 266 aa  45.4  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4118  Membrane protease subunits stomatin/prohibitin  20.78 
 
 		 308 aa  45.4  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119159  normal  0.0618424 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0038  band 7 protein  20 
 
 		 302 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2402  hypothetical protein  25.47 
 
 		 210 aa  45.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0727327  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0749  band 7 protein  25.93 
 
 		 340 aa  45.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.810157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3684  band 7 protein  22.81 
 
 		 327 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL03990  stomatin-like protein, putative  21.15 
 
 		 379 aa  44.3  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1337  band 7 protein  22.96 
 
 		 281 aa  43.9  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.773345  normal  0.981005 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3637  band 7 protein  22.53 
 
 		 284 aa  44.3  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0675354  normal  0.0204914 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5247  band 7 protein  22.97 
 
 		 691 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1605  band 7 protein  22.97 
 
 		 691 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.608323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0003  HflK protein  24.77 
 
 		 329 aa  44.7  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>