26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_5247 on replicon NC_012849
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012849  Rpic12D_5247  band 7 protein  100 
 
 		 691 aa  1402    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1605  band 7 protein  100 
 
 		 691 aa  1402    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.608323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0317  band 7 protein  49.33 
 
 		 646 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1093  band 7 protein  46.31 
 
 		 650 aa  529  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.807858  normal  0.192088 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2133  band 7 protein  45 
 
 		 647 aa  457  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.938391 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2967  hypothetical protein  45.39 
 
 		 689 aa  452  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0083  Band 7 protein  31.2 
 
 		 830 aa  345  1e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.148744  hitchhiker  0.00195276 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5721  band 7 protein  33.33 
 
 		 681 aa  313  4.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0977085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2023  band 7 protein  33.56 
 
 		 658 aa  313  1e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0142  band 7 protein  33.69 
 
 		 673 aa  296  6e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7328  band 7 protein  32.05 
 
 		 660 aa  295  3e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.081025 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7215  hypothetical protein  32.73 
 
 		 659 aa  292  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1917  von Willebrand factor, type A  32.05 
 
 		 1204 aa  254  3e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.137165 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3347  band 7 protein  27.87 
 
 		 539 aa  154  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.953991  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2467  band 7 protein  21.01 
 
 		 318 aa  53.5  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0849083 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2366  band 7 protein  28.79 
 
 		 509 aa  52.4  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000111319  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2498  band 7 protein  22.03 
 
 		 316 aa  50.8  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2032  band 7 protein  20.46 
 
 		 303 aa  49.3  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.953686 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1132  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  31.75 
 
 		 316 aa  49.3  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1316  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  31.75 
 
 		 316 aa  49.3  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0215756  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0842  band 7 protein  25.27 
 
 		 290 aa  46.6  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.360301 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3100  band 7 protein  23.95 
 
 		 318 aa  45.4  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3018  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  22 
 
 		 261 aa  45.4  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.126407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1327  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  23.7 
 
 		 285 aa  45.1  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.7737 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4837  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.74 
 
 		 325 aa  44.7  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3569  membrane protease subunit  22.97 
 
 		 258 aa  44.3  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>