More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1132 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_1132  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  100 
 
 
316 aa  621  1e-177  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1316  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  99.68 
 
 
316 aa  620  1e-176  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0215756  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0691  band 7 protein  53.38 
 
 
311 aa  341  9e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1928  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  47.47 
 
 
321 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2075  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  47.47 
 
 
321 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1890  stomatin-like protein  47.47 
 
 
322 aa  288  6e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1880  stomatin-like protein  47.47 
 
 
322 aa  288  6e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3243  SPFH domain/Band 7 family protein  47.47 
 
 
322 aa  288  6e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000635475  normal  0.334624 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2174  SPFH domain/Band 7 family protein  47.47 
 
 
322 aa  288  6e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.268114  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2106  SPFH domain/Band 7 family protein  47.47 
 
 
321 aa  289  6e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2146  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  47.6 
 
 
322 aa  288  9e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1924  band 7 protein  47.92 
 
 
322 aa  287  1e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159861  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2064  SPFH domain/Band 7 family protein  47.15 
 
 
322 aa  287  2e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101789  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1560  band 7 protein  45.69 
 
 
322 aa  278  9e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.140523  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1863  stomatin like protein  45.31 
 
 
312 aa  253  2.0000000000000002e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.510549  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4843  band 7 protein  42.26 
 
 
336 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4541  band 7 protein  43.69 
 
 
329 aa  249  4e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0550  band 7 protein  41.77 
 
 
305 aa  248  9e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.531066  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0548  band 7 protein  41.77 
 
 
305 aa  248  9e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0565  band 7 protein  41.77 
 
 
305 aa  248  9e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0555  band 7 protein  41.77 
 
 
305 aa  248  9e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.857194  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0965  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  42.07 
 
 
304 aa  248  1e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.543775  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00440  predicted protease, membrane anchored  41.46 
 
 
305 aa  248  1e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3121  band 7 protein  41.46 
 
 
305 aa  248  1e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0538  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.46 
 
 
305 aa  248  1e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00445  hypothetical protein  41.46 
 
 
305 aa  248  1e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0568  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.46 
 
 
305 aa  248  1e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0593  SPFH domain/band 7 family protein  41.46 
 
 
305 aa  248  1e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.554445 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0424  SPFH domain/band 7 family protein  41.46 
 
 
305 aa  248  1e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3127  band 7 protein  41.46 
 
 
305 aa  248  1e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000985996 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3075  band 7 protein  40.45 
 
 
319 aa  247  2e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0686773 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0609  band 7 protein  41.46 
 
 
305 aa  246  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0061  band 7 protein  42.95 
 
 
305 aa  246  4e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00313093  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0528  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.14 
 
 
305 aa  246  4e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3112  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.73 
 
 
309 aa  245  6e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0944  band 7 protein  43.34 
 
 
331 aa  245  6e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.188485  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0061  band 7 protein  42.32 
 
 
305 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0011407  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1714  band 7 protein  44.11 
 
 
314 aa  242  7e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0862  band 7 protein  43.43 
 
 
336 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.464796 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2704  band 7 protein  44.22 
 
 
332 aa  239  5e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1429  band 7 protein  39.4 
 
 
394 aa  238  6.999999999999999e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0729  band 7 protein  43.87 
 
 
310 aa  238  8e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0416  band 7 protein  40.72 
 
 
304 aa  238  8e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1330  band 7 protein  43.96 
 
 
304 aa  238  1e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.373996  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1880  band 7 protein  41.69 
 
 
334 aa  236  3e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.126513  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3720  hypothetical protein  41.1 
 
 
344 aa  236  4e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3607  band 7 protein  44.86 
 
 
346 aa  235  7e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01652  inner membrane protein  43 
 
 
321 aa  235  7e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2315  band 7 protein  40.2 
 
 
345 aa  235  9e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2939  band 7 protein  43.6 
 
 
312 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0124635  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1359  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  40.07 
 
 
334 aa  232  7.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0198882 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0497  hypothetical protein  41.03 
 
 
306 aa  232  7.000000000000001e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.988378  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2215  band 7 protein  41.81 
 
 
304 aa  231  8.000000000000001e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00993156  normal  0.0579 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1446  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.22 
 
 
305 aa  231  1e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0162555  normal  0.124024 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0564  band 7 protein  39.94 
 
 
309 aa  231  1e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.396207  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0571  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  42.23 
 
 
306 aa  231  2e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1100  band 7 protein  41.99 
 
 
304 aa  230  2e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01317  hypothetical protein  41.03 
 
 
304 aa  231  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0075  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  44.03 
 
 
328 aa  229  4e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3305  band 7 protein  43.84 
 
 
345 aa  229  6e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.366608  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1153  band 7 protein  41.35 
 
 
301 aa  228  8e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.294255  hitchhiker  0.000000366449 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3216  band 7 protein  40.94 
 
 
304 aa  228  8e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0070  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.69 
 
 
328 aa  228  1e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.255866  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0929  Band 7 protein  40.39 
 
 
332 aa  227  2e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6548  band 7 protein  37.54 
 
 
326 aa  227  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4419  band 7 protein  40.07 
 
 
319 aa  226  3e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1226  band 7 protein  40.91 
 
 
293 aa  226  3e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0280  integral membrane protein  41.89 
 
 
307 aa  226  4e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1632  band 7 protein  43.27 
 
 
315 aa  225  6e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0121873  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0138  band 7 protein  38.98 
 
 
318 aa  224  1e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1268  hypothetical protein  41.21 
 
 
304 aa  224  2e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.169836 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004150  stomatin family protein  39.94 
 
 
305 aa  224  2e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3162  band 7 protein  41.21 
 
 
304 aa  224  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3024  SPFH/band 7 family protein  41.21 
 
 
304 aa  224  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2051  band 7 protein  40.14 
 
 
439 aa  223  3e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.471473 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0157  inner membrane protein  38.66 
 
 
318 aa  223  4.9999999999999996e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.131876  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2111  band 7 protein  39.86 
 
 
395 aa  222  6e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3421  band 7 protein  40.59 
 
 
402 aa  222  7e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14640  band 7 protein  38.58 
 
 
326 aa  222  7e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000590764  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4267  band 7 protein  41.98 
 
 
329 aa  221  9.999999999999999e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.692153  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21690  SPFH domain, Band 7 family protein  38.61 
 
 
429 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.389538  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19780  SPFH domain, Band 7 family protein  40.59 
 
 
456 aa  221  1.9999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.295891  hitchhiker  0.000474854 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5109  band 7 protein  38.28 
 
 
326 aa  219  3e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.000505876  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2091  band 7 protein  36.79 
 
 
401 aa  220  3e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0259831  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3018  band 7 protein  37.94 
 
 
369 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.506434  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1179  band 7 protein  38.03 
 
 
403 aa  219  3.9999999999999997e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.473377  decreased coverage  0.000901683 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2313  band 7 protein  36.51 
 
 
398 aa  219  3.9999999999999997e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1034  band 7 protein  41.81 
 
 
307 aa  219  6e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.679836  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2414  band 7 protein  40.29 
 
 
446 aa  219  7e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3684  band 7 protein  35.33 
 
 
327 aa  218  8.999999999999998e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3024  band 7 protein  41.47 
 
 
304 aa  218  1e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2501  band 7 protein  39.08 
 
 
406 aa  218  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50523  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1352  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  40.79 
 
 
314 aa  216  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3653  band 7 protein  38.21 
 
 
403 aa  216  4e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3244  band 7 protein  38.51 
 
 
369 aa  216  4e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3087  band 7 protein  39.58 
 
 
360 aa  215  9e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.681726  hitchhiker  0.00992897 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2312  band 7 protein  39.08 
 
 
473 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00180673  hitchhiker  0.000141748 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3137  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.6 
 
 
392 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3126  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.6 
 
 
392 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3187  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.6 
 
 
392 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.20897 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>