21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5721 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_7215  hypothetical protein  58.9 
 
 
659 aa  735    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2023  band 7 protein  50 
 
 
658 aa  643    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0142  band 7 protein  56.43 
 
 
673 aa  687    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7328  band 7 protein  53.38 
 
 
660 aa  687    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.081025 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5721  band 7 protein  100 
 
 
681 aa  1384    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0977085  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1093  band 7 protein  34.4 
 
 
650 aa  367  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.807858  normal  0.192088 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0317  band 7 protein  33.08 
 
 
646 aa  350  6e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5247  band 7 protein  32.82 
 
 
691 aa  333  6e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1605  band 7 protein  32.82 
 
 
691 aa  333  6e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.608323  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2133  band 7 protein  35.17 
 
 
647 aa  327  7e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.938391 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2967  hypothetical protein  34.58 
 
 
689 aa  323  7e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0083  Band 7 protein  29.43 
 
 
830 aa  241  5e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.148744  hitchhiker  0.00195276 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1917  von Willebrand factor, type A  30.73 
 
 
1204 aa  190  5.999999999999999e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.137165 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3347  band 7 protein  25.3 
 
 
539 aa  104  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.953991  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1223  band 7 protein  36.76 
 
 
507 aa  48.9  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3314  band 7 protein  41.35 
 
 
495 aa  45.8  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.018778  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0334  band 7 protein  36.18 
 
 
507 aa  46.6  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000207972  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0583  cobaltochelatase, CobN subunit  26.42 
 
 
1206 aa  45.4  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.773066  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1572  SPFH/band 7 family protein  24.49 
 
 
295 aa  44.7  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.915425  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2721  band 7 protein  24.49 
 
 
308 aa  44.3  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000149129  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2636  SPFH/band 7 family protein  24.49 
 
 
308 aa  44.3  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000156489  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>