More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_61642 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009046  PICST_61642  Stomatin-like protein 3  100 
 
 		 340 aa  706    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03163  stomatin family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G13440)  52.54 
 
 		 344 aa  293  2e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000111166  normal  0.837259 
 
 
-
 
NC_006681  CNL03990  stomatin-like protein, putative  44.93 
 
 		 379 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1624  band 7 protein  31.13 
 
 		 281 aa  141  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.602734 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1478  band 7 protein  31.2 
 
 		 290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.965054  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0014  band 7 protein  30.77 
 
 		 267 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1337  band 7 protein  30.11 
 
 		 281 aa  139  6e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.773345  normal  0.981005 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1279  band 7 protein  31.84 
 
 		 261 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0347  band 7 protein  31.39 
 
 		 254 aa  138  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315344  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06174  hypothetical protein  31.7 
 
 		 263 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000358  stomatin family protein  31.72 
 
 		 260 aa  136  6.0000000000000005e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1643  band 7 protein  32.72 
 
 		 256 aa  135  7.000000000000001e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.182156  normal  0.321181 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0865  band 7 protein  32.29 
 
 		 254 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.301749  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2410  band 7 protein  30.57 
 
 		 287 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183043  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0848  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.49 
 
 		 267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00115336  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0526  membrane protease family, stomatin/prohibitin homolog  31.31 
 
 		 249 aa  134  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.712597  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_752  SPFH domain/band 7 family domain protein  29.49 
 
 		 267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.293007  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1660  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  31.31 
 
 		 248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.242183  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0472  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  31 
 
 		 249 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2175  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  30.51 
 
 		 257 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275738  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0915  SPFH domain-containing protein  30.51 
 
 		 257 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.323341  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3200  band 7 protein  33.33 
 
 		 278 aa  134  3e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.173573  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0822  SPFH domain-containing protein  30.51 
 
 		 257 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645625  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0802  putative stomatin-like transmembrane protein  31.03 
 
 		 249 aa  133  5e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.798242 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1305  Band 7 protein  33.48 
 
 		 248 aa  133  5e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.316844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0767  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.03 
 
 		 267 aa  132  6e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.351425  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3637  band 7 protein  29.36 
 
 		 284 aa  132  6.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0675354  normal  0.0204914 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0695  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  30.32 
 
 		 270 aa  132  9e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.323887  hitchhiker  0.000167798 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1806  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  30.08 
 
 		 256 aa  132  9e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.175938  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2430  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  31.44 
 
 		 261 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.108458  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4520  band 7 protein  29.79 
 
 		 256 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.551636 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1660  Fis family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 270 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0804  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  31.31 
 
 		 251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.613806  normal  0.690424 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2559  band 7 protein  30.52 
 
 		 285 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000166484 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0942  band 7 protein  30.93 
 
 		 259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.69232  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3381  band 7 protein  29.91 
 
 		 252 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.889341  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0818  band 7 protein  30.45 
 
 		 252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.142501  normal  0.529014 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0852  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.07 
 
 		 257 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.198296  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1071  band 7 protein  32.2 
 
 		 303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.109986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0748  band 7 protein  30.45 
 
 		 252 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.421043 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0036  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  36.27 
 
 		 270 aa  130  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0311937  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1014  band 7 protein  29.18 
 
 		 265 aa  130  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.855115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1484  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  32.35 
 
 		 296 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.762715  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1506  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  32.35 
 
 		 296 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1482  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  30.97 
 
 		 310 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1635  Band 7 protein  31.88 
 
 		 256 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1164  band 7 protein  33.18 
 
 		 263 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00105644  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3399  band 7 protein  31.56 
 
 		 279 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3368  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.92 
 
 		 259 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1233  Band 7 protein  32.57 
 
 		 254 aa  129  7.000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1170  band 7 protein  31.88 
 
 		 248 aa  129  7.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.985704  decreased coverage  0.00325794 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2049  band 7 protein  33.17 
 
 		 249 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0323  band 7 protein  32.37 
 
 		 250 aa  129  9.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2886  hypothetical protein  29.6 
 
 		 251 aa  128  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4118  Membrane protease subunits stomatin/prohibitin  29.13 
 
 		 308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119159  normal  0.0618424 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1601  band 7 protein  29.57 
 
 		 252 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.829525  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5123  band 7 protein  30.92 
 
 		 259 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.345813 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3653  band 7 protein  30.3 
 
 		 257 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.467369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0814  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  32.37 
 
 		 257 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000120225  hitchhiker  0.0000000481478 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1741  SPFH domain, Band 7 family protein  28.38 
 
 		 291 aa  128  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.011683 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1024  band 7 protein  29.74 
 
 		 274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0872  band 7 protein  32.86 
 
 		 253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276466  normal  0.0470054 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1489  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.83 
 
 		 265 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.648158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4388  band 7 protein  31.4 
 
 		 257 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0220  band 7 protein  29.69 
 
 		 253 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.964901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2128  band 7 protein  29.44 
 
 		 251 aa  127  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.257106  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4950  band 7 protein  33.82 
 
 		 278 aa  127  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.493211  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0991  band 7 protein  32.87 
 
 		 257 aa  127  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.934291 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2530  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  33.18 
 
 		 257 aa  127  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.393667  normal  0.845056 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3401  band 7 protein  31.4 
 
 		 257 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4907  band 7 protein  31.4 
 
 		 257 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.551483  normal  0.286339 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05890  putative stomatin-like protein  31.67 
 
 		 264 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.774362  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1699  band 7 protein  28.82 
 
 		 258 aa  127  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000129402 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0199  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.69 
 
 		 248 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1785  band 7 protein  31.17 
 
 		 267 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0464  band 7 protein  30.86 
 
 		 261 aa  127  4.0000000000000003e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000381687  normal  0.0261811 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0554  putative stomatin-like protein  31.67 
 
 		 264 aa  126  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3547  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  31.08 
 
 		 261 aa  126  5e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.105292  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5320  band 7 protein  31.4 
 
 		 257 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0030442  normal  0.0109702 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0711  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  31.4 
 
 		 257 aa  126  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.948831  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05740  Integral membrane protein, band 7 family  28.82 
 
 		 252 aa  126  7e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.332679  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4966  band 7 protein  31.4 
 
 		 257 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.848801  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1958  membrane protease subunits, stomatin/prohibitin-like  31.8 
 
 		 249 aa  125  8.000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1081  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.81 
 
 		 257 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348982  decreased coverage  0.00598719 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5653  band 7 protein  28.81 
 
 		 257 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.592895  normal  0.980998 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3028  hypothetical protein  29.71 
 
 		 251 aa  125  9e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0786  band 7 protein  27.34 
 
 		 295 aa  125  9e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0490  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  30.81 
 
 		 252 aa  125  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0947  Band 7 protein  29.6 
 
 		 247 aa  125  1e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.13935  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1740  SPFH domain, Band 7 family protein  30.92 
 
 		 256 aa  125  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0109204 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0267  band 7 protein  30.88 
 
 		 250 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2228  band 7 protein  30.38 
 
 		 351 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157467  hitchhiker  0.000011879 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1514  band 7 protein  31.44 
 
 		 273 aa  124  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0223  band 7 protein  30.88 
 
 		 251 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0039  band 7 protein  30.4 
 
 		 251 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2912  band 7 protein  31.4 
 
 		 255 aa  124  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2685  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  30.37 
 
 		 261 aa  124  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238135  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0402  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  30.52 
 
 		 257 aa  123  4e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.674809  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2150  band 7 protein  30.08 
 
 		 259 aa  122  8e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0119  band 7 protein  27.8 
 
 		 263 aa  122  8e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>