More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3236 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_3236  band 7 protein  100 
 
 
295 aa  595  1e-169  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3629  band 7 protein  92.81 
 
 
298 aa  535  1e-151  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00841169  hitchhiker  0.00129487 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0978  band 7 protein  53.76 
 
 
312 aa  306  3e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3650  band 7 protein  33.78 
 
 
305 aa  159  4e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0210038  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3042  band 7 protein  31.65 
 
 
295 aa  149  4e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1062  band 7 protein  29.86 
 
 
299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3837  band 7 protein  32.32 
 
 
295 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.712498 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4033  band 7 protein  32.32 
 
 
295 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3910  band 7 protein  32.32 
 
 
295 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0423  band 7 protein  32.32 
 
 
295 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0445  hflC protein, putative  29.27 
 
 
296 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3398  band 7 protein  32.71 
 
 
295 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3076  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.97 
 
 
302 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00561985 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0444  band 7 protein  30.07 
 
 
295 aa  145  9e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0448  band 7 protein  30.45 
 
 
295 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3581  band 7 protein  30.45 
 
 
295 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2721  band 7 protein  27.54 
 
 
308 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000149129  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2636  SPFH/band 7 family protein  27.54 
 
 
308 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000156489  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1572  SPFH/band 7 family protein  28.52 
 
 
295 aa  136  5e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.915425  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4057  band 7 protein  33.09 
 
 
287 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0825  band 7 protein  34.47 
 
 
287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0292375 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2924  band 7 protein  30.74 
 
 
318 aa  115  8.999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.839077  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3604  band 7 protein  30.22 
 
 
312 aa  113  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10521 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2987  band 7 protein  29.93 
 
 
315 aa  113  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  hitchhiker  0.00027326 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0815  band 7 protein  29.93 
 
 
278 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000157152  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1813  band 7 protein  24.09 
 
 
263 aa  101  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4401  band 7 protein  27.4 
 
 
268 aa  99  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4464  band 7 protein  26.88 
 
 
268 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0054233  normal  0.226289 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5029  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.28 
 
 
267 aa  95.9  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.290689  normal  0.430447 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2852  band 7 protein  25.99 
 
 
284 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2167  hypothetical protein  28.57 
 
 
282 aa  92.4  8e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.772353  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0179  band 7 protein  27.8 
 
 
363 aa  89  8e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0253  band 7 protein  26.22 
 
 
310 aa  85.9  7e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1876  Band 7 protein  29.56 
 
 
372 aa  85.1  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.918584  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0728  band 7 protein  26.02 
 
 
276 aa  84.3  0.000000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2467  band 7 protein  27.12 
 
 
318 aa  83.6  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0849083 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1405  conserved hypothetical transmembrane protein (SPFH domain / Band 7 family)  25.76 
 
 
356 aa  81.3  0.00000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1708  SPFH domain-containing protein  27.27 
 
 
362 aa  79  0.00000000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2373  band 7 protein  27.37 
 
 
304 aa  78.6  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0303  SPFH domain-containing protein  26.05 
 
 
364 aa  77.4  0.0000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.496264  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3235  HflC protein  27.76 
 
 
288 aa  77.8  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000478035  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0235  band 7 protein  28.63 
 
 
331 aa  77.4  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.144192 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0666  HflC protein  27.2 
 
 
289 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2498  band 7 protein  23.97 
 
 
316 aa  77.4  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0317  SPFH domain-containing protein  27.6 
 
 
362 aa  76.6  0.0000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.134016  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0295  SPFH domain-containing protein  27.6 
 
 
362 aa  76.6  0.0000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1448  SPFH domain-containing protein  25.86 
 
 
359 aa  76.3  0.0000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.125445  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0578  FtsH protease regulator HflC  26.62 
 
 
333 aa  75.9  0.0000000000008  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3795  FtsH protease regulator HflC  26.12 
 
 
334 aa  75.9  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0696  FtsH protease regulator HflC  26.12 
 
 
334 aa  75.9  0.0000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3650  FtsH protease regulator HflC  26.12 
 
 
334 aa  75.9  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3545  band 7 protein  23.78 
 
 
291 aa  75.1  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.978436  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2811  band 7 protein  27.91 
 
 
276 aa  75.5  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.103679  hitchhiker  0.00246808 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3916  FtsH protease regulator HflC  25.17 
 
 
331 aa  75.5  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.32908  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04042  modulator for HflB protease specific for phage lambda cII repressor  27.76 
 
 
334 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.040502  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3818  HflC protein  27.76 
 
 
334 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.557877  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4733  FtsH protease regulator HflC  27.76 
 
 
334 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4646  FtsH protease regulator HflC  27.76 
 
 
334 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.175793 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0854  cation-transporting ATPase, P-type  27.72 
 
 
364 aa  74.3  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4706  FtsH protease regulator HflC  27.76 
 
 
334 aa  74.7  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3397  band 7 protein  22.97 
 
 
279 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.149189 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3718  FtsH protease regulator HflC  25.26 
 
 
331 aa  74.3  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0820553  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3838  FtsH protease regulator HflC  27.76 
 
 
334 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04004  hypothetical protein  27.76 
 
 
334 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.054912  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5691  FtsH protease regulator HflC  27.76 
 
 
334 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.187921  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4417  FtsH protease regulator HflC  27.76 
 
 
334 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04831  Band 7 protein  29.59 
 
 
267 aa  73.2  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.297877  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0600  HflC protein  24.33 
 
 
297 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00172359  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1017  bacteriophage/transposase fusion protein  23.63 
 
 
270 aa  72  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0310816  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0525  membrane protease subunit HflC  30.38 
 
 
304 aa  71.6  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0436  Band 7 protein  26.41 
 
 
249 aa  71.2  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.155422  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0434  FtsH protease regulator HflC  25.44 
 
 
335 aa  70.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.476328  unclonable  0.0000000374568 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12321  Band 7 protein  29.44 
 
 
266 aa  71.2  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0549  membrane protease subunit HflC  30.17 
 
 
304 aa  70.5  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4642  FtsH protease regulator HflC  26.69 
 
 
334 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4632  FtsH protease regulator HflC  26.69 
 
 
334 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4782  FtsH protease regulator HflC  26.69 
 
 
334 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220935  normal  0.242 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4761  FtsH protease regulator HflC  26.69 
 
 
334 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0538  FtsH protease regulator HflC  25.17 
 
 
331 aa  70.1  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.255691  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0601  HflC protein  24.24 
 
 
297 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974479  hitchhiker  0.00702769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3429  HflC protein  24.24 
 
 
297 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00841397  normal  0.0439963 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4725  FtsH protease regulator HflC  26.69 
 
 
334 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2108  SPFH domain-containing protein  26.14 
 
 
370 aa  70.1  0.00000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0749  band 7 protein  29.24 
 
 
340 aa  69.7  0.00000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.810157  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1663  hypothetical protein  24.55 
 
 
341 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0672559  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06073  putative prohibitin (Eurofung)  25.3 
 
 
307 aa  69.3  0.00000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.453994  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0512  band 7 protein  22.55 
 
 
282 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000338316 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0606  hflC protein  24.62 
 
 
297 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3100  band 7 protein  24.04 
 
 
318 aa  68.9  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0496  band 7 protein  22.55 
 
 
282 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29372  predicted protein  24.08 
 
 
278 aa  68.2  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0524  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.99 
 
 
264 aa  68.2  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.675016 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1091  HflC protein  26.91 
 
 
284 aa  67.8  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0362  band 7 protein  26.16 
 
 
321 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3569  membrane protease subunit  25.69 
 
 
258 aa  68.2  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0488  HflC protein  26.25 
 
 
295 aa  67.8  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0358  FtsH protease regulator HflC  27.05 
 
 
334 aa  67.4  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.470776  hitchhiker  0.00397927 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_54960  predicted protein  24.53 
 
 
269 aa  67.4  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0495  FtsH protease regulator HflC  25.45 
 
 
331 aa  67  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1945  bacteriophage/transposase fusion protein  24.14 
 
 
462 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>