More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0003 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0003  HflK protein  100 
 
 
329 aa  660    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0263  HflK protein  43.38 
 
 
360 aa  235  8e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2262  HflK protein  40.4 
 
 
333 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015812  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1090  HflK protein  40 
 
 
405 aa  225  7e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0486  HflK protein  44.36 
 
 
361 aa  225  9e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.333714 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2946  HflK protein  42.7 
 
 
359 aa  219  5e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1107  HflK protein  36.96 
 
 
308 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0999  HflK protein  36.96 
 
 
308 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0702  HflK protein  41.28 
 
 
306 aa  210  3e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2674  HflK protein  37.11 
 
 
388 aa  209  4e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0162976 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0630  HflK protein  40.07 
 
 
309 aa  207  2e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3613  HflK protein  38.49 
 
 
350 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3678  HflK protein  38.49 
 
 
350 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2588  HflK-like protein  38.35 
 
 
413 aa  206  4e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0268051  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0866  HflK protein  37.42 
 
 
387 aa  206  4e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0134837  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0664  HflK protein  34.69 
 
 
395 aa  206  4e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119349  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3522  HflK protein  38.71 
 
 
378 aa  206  5e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1321  HflK protein  36.69 
 
 
331 aa  204  1e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2279  HflK protein  38.38 
 
 
378 aa  203  3e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2203  HflK  38.51 
 
 
407 aa  202  5e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1886  hflK protein  36.88 
 
 
397 aa  202  5e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1561  HflK protein  36.88 
 
 
397 aa  202  5e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.920628  hitchhiker  0.00000000145898 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0899  HflK protein  36.08 
 
 
393 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0975444  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1664  HflK protein  39.16 
 
 
385 aa  199  6e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0184  HflK protein  34.15 
 
 
350 aa  194  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464888  normal  0.739242 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0665  HflK protein  36.58 
 
 
322 aa  194  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1981  hflK protein  33.67 
 
 
403 aa  192  5e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.245892  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0579  HflK protein  33.9 
 
 
386 aa  191  1e-47  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0575  HflK protein  33.13 
 
 
459 aa  191  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.289879  hitchhiker  0.000000000363385 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2760  hflK protein  34.02 
 
 
395 aa  189  4e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.467094  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1573  HflK protein  36.12 
 
 
367 aa  190  4e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000427817  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0843  HflK  36.72 
 
 
355 aa  189  5e-47  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1942  HflK protein  35.31 
 
 
406 aa  189  5.999999999999999e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0603  HflK  33.66 
 
 
395 aa  189  7e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1089  HflK protein  35.19 
 
 
386 aa  187  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0604271 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0701  HflK protein  34.39 
 
 
389 aa  188  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.704502  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0831  hflK protein  37.02 
 
 
344 aa  187  2e-46  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.604081  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2775  HflK protein  33.22 
 
 
407 aa  187  2e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.631508  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0357  FtsH protease regulator HflK  34.43 
 
 
421 aa  187  3e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398708  hitchhiker  0.00429034 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0604  HflK protein  37.41 
 
 
368 aa  187  3e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0450848 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2099  HflK protein  32.88 
 
 
447 aa  186  4e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.080069 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2767  HflK protein  34.25 
 
 
394 aa  186  4e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.397323  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1050  hflK protein  37.12 
 
 
357 aa  185  7e-46  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1066  HflK protein  33.22 
 
 
477 aa  185  8e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4641  FtsH protease regulator HflK  34.42 
 
 
419 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.641221  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4724  FtsH protease regulator HflK  34.42 
 
 
419 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4781  FtsH protease regulator HflK  34.42 
 
 
419 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.932984  normal  0.393456 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4760  FtsH protease regulator HflK  34.42 
 
 
419 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4631  FtsH protease regulator HflK  34.42 
 
 
419 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.130009  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1158  HflK protein  33.91 
 
 
475 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2011  HflK protein  35 
 
 
378 aa  182  5.0000000000000004e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.166821  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0494  HflK protein  30.77 
 
 
420 aa  182  6e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0869387  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3383  HflK protein  29.9 
 
 
433 aa  182  6e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1716  HflK protein  33 
 
 
441 aa  182  6e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.40222  normal  0.183963 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3309  HflK protein  32.25 
 
 
386 aa  182  7e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1743  HflK protein  33 
 
 
453 aa  182  7e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2780  HflK protein  37.1 
 
 
379 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.224376 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0445  HflK protein  34.16 
 
 
399 aa  182  9.000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.713082  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0313  hflK protein, putative  36.62 
 
 
329 aa  181  1e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1587  HflK protein  34.02 
 
 
391 aa  181  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  0.000000287062 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4645  FtsH protease regulator HflK  34.42 
 
 
419 aa  181  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.14387 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1332  hflK protein, putative  33.22 
 
 
318 aa  181  2e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.683912  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0545  HflK protein  36.3 
 
 
366 aa  181  2e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000873771  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2728  HflK protein  36.42 
 
 
385 aa  181  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4005  HflK protein  35.95 
 
 
383 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.906349  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2079  HflK  33.57 
 
 
457 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2665  heat shock protein HslU  33.11 
 
 
386 aa  180  2.9999999999999997e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.288159  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1730  HflK protein  36.69 
 
 
389 aa  180  2.9999999999999997e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000348315 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04041  modulator for HflB protease specific for phage lambda cII repressor  34.06 
 
 
419 aa  179  4e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.298849  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0673  HflK protein  31.72 
 
 
498 aa  180  4e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5690  FtsH protease regulator HflK  34.06 
 
 
419 aa  179  4e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.440871  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00092  serine protease  32.53 
 
 
401 aa  179  4e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4416  FtsH protease regulator HflK  34.06 
 
 
419 aa  179  4e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.953832  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3839  FtsH protease regulator HflK  34.06 
 
 
419 aa  179  4e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.910091  hitchhiker  0.000000232279 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4732  FtsH protease regulator HflK  34.06 
 
 
419 aa  179  4e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.938149  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04003  hypothetical protein  34.06 
 
 
419 aa  179  4e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.317629  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4705  FtsH protease regulator HflK  34.06 
 
 
419 aa  179  4e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.714132  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2458  HflK protein  34.8 
 
 
398 aa  179  4.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0761893 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0537  HflK protein  31.69 
 
 
418 aa  179  4.999999999999999e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.141396  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1284  HflK protein  33 
 
 
503 aa  179  5.999999999999999e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002261  HflK protein  32.18 
 
 
401 aa  179  7e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0330443  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1222  hypothetical protein  35.04 
 
 
447 aa  179  7e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0015724  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2798  HflK protein  34.95 
 
 
357 aa  179  8e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.786571  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3819  HflK protein  34.06 
 
 
419 aa  178  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0613795  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2978  HflK  33.45 
 
 
436 aa  178  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.750881  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0433  FtsH protease regulator HflK  31.19 
 
 
419 aa  178  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0562883  unclonable  0.0000000348967 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0600  HflK protein  32.09 
 
 
381 aa  177  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0138092  hitchhiker  0.00143389 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3430  HflK protein  32.09 
 
 
381 aa  177  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0909026  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3719  FtsH protease regulator HflK  32.25 
 
 
420 aa  177  3e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0503077  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2658  HflK protein  36.86 
 
 
382 aa  177  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2885  HflK protein  36.86 
 
 
382 aa  177  3e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6097  protease activity modulator HflK  36.81 
 
 
379 aa  176  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1431  HflK protein  32.99 
 
 
471 aa  176  5e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.936066 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0560  HflK protein  31.82 
 
 
379 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000508673  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2349  HflK  35.91 
 
 
382 aa  176  6e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3352  HflK protein  35.76 
 
 
389 aa  176  6e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.154635 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3917  FtsH protease regulator HflK  31.88 
 
 
415 aa  176  7e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.357327  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2024  HflK protein  34.13 
 
 
379 aa  175  7e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0599  HflK protein  32.5 
 
 
381 aa  176  7e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0263631  hitchhiker  0.00000131875 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3708  HflK protein  32.14 
 
 
379 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000788714  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>