274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1405 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_1405  conserved hypothetical transmembrane protein (SPFH domain / Band 7 family)  100 
 
 
356 aa  716    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1708  SPFH domain-containing protein  83.52 
 
 
362 aa  567  1e-161  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0317  SPFH domain-containing protein  84.08 
 
 
362 aa  557  1e-157  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.134016  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0295  SPFH domain-containing protein  83.52 
 
 
362 aa  555  1e-157  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0854  cation-transporting ATPase, P-type  68.78 
 
 
364 aa  461  1e-129  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2108  SPFH domain-containing protein  68.29 
 
 
370 aa  456  1e-127  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0179  band 7 protein  60.06 
 
 
363 aa  444  1.0000000000000001e-124  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0303  SPFH domain-containing protein  68.42 
 
 
364 aa  445  1.0000000000000001e-124  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.496264  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1448  SPFH domain-containing protein  67.04 
 
 
359 aa  434  1e-120  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.125445  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1876  Band 7 protein  52.73 
 
 
372 aa  345  6e-94  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.918584  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0253  band 7 protein  35.74 
 
 
310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2498  band 7 protein  28.24 
 
 
316 aa  97.4  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2467  band 7 protein  28.22 
 
 
318 aa  92.8  9e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0849083 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0815  band 7 protein  25.65 
 
 
278 aa  92  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000157152  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0362  band 7 protein  23.34 
 
 
321 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0978  band 7 protein  26.88 
 
 
312 aa  90.1  5e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4360  band 7 protein  26.74 
 
 
307 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3236  band 7 protein  25.76 
 
 
295 aa  87.4  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4917  band 7 protein  27.42 
 
 
301 aa  84.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.149772  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1185  membrane protease  29.01 
 
 
316 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2167  hypothetical protein  25.09 
 
 
282 aa  84.3  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.772353  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2987  band 7 protein  24.83 
 
 
315 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  hitchhiker  0.00027326 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3629  band 7 protein  25.98 
 
 
298 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00841169  hitchhiker  0.00129487 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2924  band 7 protein  24.83 
 
 
318 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.839077  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4422  band 7 protein  25.96 
 
 
307 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0850578 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41824  predicted protein  28.57 
 
 
282 aa  81.3  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.699109  normal  0.209561 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3100  band 7 protein  27.61 
 
 
318 aa  80.9  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1730  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.27 
 
 
437 aa  80.9  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.529495 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00686  prohibitin complex subunit Phb1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13470)  25.64 
 
 
280 aa  80.5  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5029  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.63 
 
 
267 aa  80.5  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.290689  normal  0.430447 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0235  band 7 protein  30 
 
 
331 aa  79.7  0.00000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.144192 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4200  band 7 protein  28.84 
 
 
268 aa  79.7  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.525075  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_76983  predicted protein  27.89 
 
 
302 aa  75.5  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0444  band 7 protein  22.81 
 
 
295 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29372  predicted protein  25.19 
 
 
278 aa  75.1  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0445  hflC protein, putative  23.31 
 
 
296 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1830  band 7 protein  29.88 
 
 
303 aa  73.9  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0749  band 7 protein  30.18 
 
 
340 aa  73.9  0.000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.810157  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0825  band 7 protein  29.24 
 
 
287 aa  73.6  0.000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0292375 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4401  band 7 protein  25.27 
 
 
268 aa  73.2  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4464  band 7 protein  25.27 
 
 
268 aa  73.2  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0054233  normal  0.226289 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2032  band 7 protein  29.55 
 
 
303 aa  73.2  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.953686 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00780  prohibitin PHB1, putative  26.41 
 
 
274 aa  72.8  0.000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1029  band 7 protein  29.67 
 
 
340 aa  72.8  0.000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.111274 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3397  band 7 protein  27.31 
 
 
279 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.149189 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0769  band 7 protein  25.61 
 
 
266 aa  72  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.953295  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1813  band 7 protein  25.3 
 
 
263 aa  70.1  0.00000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_54960  predicted protein  26.09 
 
 
269 aa  70.1  0.00000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_54958  prohibitin-like protein  25.52 
 
 
284 aa  69.7  0.00000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49447  predicted protein  22.9 
 
 
275 aa  69.3  0.00000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0166572  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3604  band 7 protein  25.81 
 
 
312 aa  69.3  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10521 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2089  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.44 
 
 
259 aa  69.3  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1062  band 7 protein  22.06 
 
 
299 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06073  putative prohibitin (Eurofung)  24.23 
 
 
307 aa  67  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.453994  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0448  band 7 protein  22.95 
 
 
295 aa  67  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3581  band 7 protein  22.95 
 
 
295 aa  67  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2852  band 7 protein  25.6 
 
 
284 aa  66.2  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08236  hypothetical protein  25.55 
 
 
271 aa  66.2  0.0000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0436  Band 7 protein  24.45 
 
 
249 aa  65.9  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.155422  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04831  Band 7 protein  27.83 
 
 
267 aa  65.1  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.297877  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3042  band 7 protein  23.19 
 
 
295 aa  65.5  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3910  band 7 protein  22.35 
 
 
295 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4033  band 7 protein  22.35 
 
 
295 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3569  membrane protease subunit  24 
 
 
258 aa  64.3  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3837  band 7 protein  22.35 
 
 
295 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.712498 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3398  band 7 protein  21.89 
 
 
295 aa  64.3  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0423  band 7 protein  22.35 
 
 
295 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12799  prohibitin-like protein  26.18 
 
 
244 aa  63.9  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.15456  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05461  Band 7 protein  24.8 
 
 
268 aa  63.2  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.178963  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00070  proteolysis and peptidolysis-related protein, putative  25.17 
 
 
318 aa  62.4  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0637663  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05091  Band 7 protein  24.28 
 
 
267 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0360  band 7 protein  25.71 
 
 
327 aa  62  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.259397 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05381  Band 7 protein  24.28 
 
 
267 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2198  band 7 protein  28.49 
 
 
333 aa  62  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3650  band 7 protein  21.21 
 
 
305 aa  60.8  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0210038  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1089  HflK protein  28.15 
 
 
386 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0604271 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4005  HflK protein  26.21 
 
 
383 aa  60.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.906349  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2349  HflK  23.08 
 
 
382 aa  60.1  0.00000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0483  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  23.87 
 
 
267 aa  59.7  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1572  SPFH/band 7 family protein  23.32 
 
 
295 aa  58.5  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.915425  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0701  HflK protein  26.69 
 
 
389 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.704502  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0359  band 7 protein  25.26 
 
 
268 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.741854  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2636  SPFH/band 7 family protein  23.32 
 
 
308 aa  58.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000156489  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2721  band 7 protein  23.32 
 
 
308 aa  58.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000149129  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0691  band 7 protein  23.69 
 
 
311 aa  58.5  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3545  band 7 protein  23.08 
 
 
291 aa  57.8  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.978436  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1815  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.64 
 
 
267 aa  57.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.11992  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22550  band 7 protein  25.38 
 
 
330 aa  57.8  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1957  band 7 protein  23.5 
 
 
360 aa  57.8  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0790596  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05391  Band 7 protein  25.64 
 
 
267 aa  57.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.289277 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1749  HflK protein  23.77 
 
 
376 aa  57  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.254466  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1924  band 7 protein  23.82 
 
 
322 aa  57.4  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159861  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3308  HflC protein  25.1 
 
 
292 aa  57  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3537  HflC protein  25.37 
 
 
292 aa  57  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000127879  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0564  band 7 protein  25.89 
 
 
309 aa  56.6  0.0000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.396207  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1890  stomatin-like protein  24.28 
 
 
322 aa  56.2  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1880  stomatin-like protein  24.28 
 
 
322 aa  56.2  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2146  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.28 
 
 
322 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2106  SPFH domain/Band 7 family protein  24.28 
 
 
321 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2315  band 7 protein  23.22 
 
 
345 aa  56.2  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>