More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4005 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2038  HflK protein  88.5 
 
 		 390 aa  634    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal  0.793303 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3262  HflK protein  84.07 
 
 		 383 aa  646    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.264682  normal  0.260183 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3352  HflK protein  89.01 
 
 		 389 aa  660    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.154635 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4005  HflK protein  100 
 
 		 383 aa  775    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.906349  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2728  HflK protein  80.42 
 
 		 385 aa  629  1e-179  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2349  HflK  78.85 
 
 		 382 aa  590  1e-168  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6097  protease activity modulator HflK  76.92 
 
 		 379 aa  510  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1664  HflK protein  64.34 
 
 		 385 aa  479  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1730  HflK protein  52.99 
 
 		 389 aa  378  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000348315 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0604  HflK protein  54.57 
 
 		 368 aa  372  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0450848 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2458  HflK protein  53.24 
 
 		 398 aa  365  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0761893 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1089  HflK protein  55.92 
 
 		 386 aa  359  5e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0604271 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2203  HflK  52.33 
 
 		 407 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0701  HflK protein  53.6 
 
 		 389 aa  352  5e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.704502  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2780  HflK protein  50.43 
 
 		 379 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.224376 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4527  HflK protein  49.44 
 
 		 394 aa  318  1e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2885  HflK protein  50.14 
 
 		 382 aa  308  6.999999999999999e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2658  HflK protein  50.14 
 
 		 382 aa  308  9e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0486  HflK protein  47.45 
 
 		 361 aa  281  1e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.333714 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1749  HflK protein  43.39 
 
 		 376 aa  281  2e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.254466  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2736  Protein HflK  43.42 
 
 		 382 aa  278  2e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.12799  normal  0.0330194 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2024  HflK protein  47.25 
 
 		 379 aa  276  6e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2946  HflK protein  50 
 
 		 359 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0263  HflK protein  44.25 
 
 		 360 aa  270  2e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1573  HflK protein  42.13 
 
 		 367 aa  270  2.9999999999999997e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000427817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3670  HflK protein  40 
 
 		 399 aa  265  8e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1956  HflK protein  41.85 
 
 		 387 aa  263  4.999999999999999e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.733622  normal  0.100531 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2674  HflK protein  43.53 
 
 		 388 aa  262  8e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0162976 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1981  hflK protein  42.01 
 
 		 403 aa  260  3e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.245892  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0357  HflK protein  40.17 
 
 		 393 aa  259  4e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.24266  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2001  HflK protein  40.17 
 
 		 393 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.610891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2018  HflK protein  43.71 
 
 		 362 aa  257  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1090  HflK protein  39.18 
 
 		 405 aa  257  2e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1794  HflK protein  40.8 
 
 		 383 aa  257  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.301305  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0885  HflK protein  39.17 
 
 		 394 aa  256  5e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.240559 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3173  HflK protein  42 
 
 		 394 aa  255  1.0000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0603  HflK  40.48 
 
 		 395 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3384  HflK protein  41.26 
 
 		 359 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.16512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1353  band 7 protein:stomatin  41.29 
 
 		 384 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.792313  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2818  HFLK protein  41.4 
 
 		 383 aa  253  3e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44638  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2588  HflK-like protein  40.31 
 
 		 413 aa  251  1e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0268051  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1397  hflK protein  41.01 
 
 		 382 aa  251  2e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0831  hflK protein  40 
 
 		 344 aa  249  8e-65  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.604081  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0843  HflK  39.11 
 
 		 355 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3383  HflK protein  36.34 
 
 		 433 aa  241  1e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0445  HflK protein  39.14 
 
 		 399 aa  241  1e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.713082  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0899  HflK protein  38.17 
 
 		 393 aa  241  2e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0975444  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2279  HflK protein  44.15 
 
 		 378 aa  239  6.999999999999999e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2978  HflK  39.37 
 
 		 436 aa  238  1e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.750881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0866  HflK protein  41.94 
 
 		 387 aa  236  4e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0134837  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1050  hflK protein  40.44 
 
 		 357 aa  236  4e-61  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1942  HflK protein  39.28 
 
 		 406 aa  231  2e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3344  HflK protein  41.67 
 
 		 370 aa  231  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.405881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1587  HflK protein  39.09 
 
 		 391 aa  230  4e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000287062 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2541  HflK protein  39.52 
 
 		 362 aa  229  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1284  HflK protein  39.09 
 
 		 503 aa  228  1e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2800  HflK protein  40.06 
 
 		 360 aa  227  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182223  normal  0.400207 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2099  HflK protein  35.77 
 
 		 447 aa  223  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.080069 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1989  hypothetical protein  37.68 
 
 		 435 aa  223  6e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.757808  normal  0.0447269 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0673  HflK protein  38.39 
 
 		 498 aa  221  9.999999999999999e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0664  HflK protein  38.04 
 
 		 395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119349  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0525  HflK  34.29 
 
 		 389 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.325556  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2665  heat shock protein HslU  34.95 
 
 		 386 aa  219  7.999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.288159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1561  HflK protein  41.12 
 
 		 397 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.920628  hitchhiker  0.00000000145898 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1886  hflK protein  41.12 
 
 		 397 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4940  hflK protein  32.99 
 
 		 395 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0164  HflK protein  38.37 
 
 		 347 aa  212  9e-54  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00000564548  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5012  HflK protein  35.71 
 
 		 464 aa  211  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0637  HflK protein  33.07 
 
 		 389 aa  210  3e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0128609 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2262  HflK protein  38.49 
 
 		 333 aa  209  5e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015812  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2767  HflK protein  33.86 
 
 		 394 aa  209  6e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.397323  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0574  HflK  32.65 
 
 		 400 aa  209  8e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1066  HflK protein  38.38 
 
 		 477 aa  208  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4683  HflK protein  34.53 
 
 		 393 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4892  HflK protein  34.27 
 
 		 405 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.42676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1107  HflK protein  37.97 
 
 		 308 aa  207  2e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1158  HflK protein  38.06 
 
 		 475 aa  208  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4768  HflK protein  34.27 
 
 		 393 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2861  HflK protein  38.85 
 
 		 393 aa  207  3e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1177  HflK protein  34.6 
 
 		 451 aa  207  3e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.621922 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1097  HflK protein  34.6 
 
 		 451 aa  207  3e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0999  HflK protein  37.97 
 
 		 308 aa  207  3e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1222  hypothetical protein  41.81 
 
 		 447 aa  206  4e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0015724  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0494  HflK protein  34.48 
 
 		 420 aa  206  4e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0869387  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0524  protease subunit HflK  36.07 
 
 		 380 aa  205  1e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0548  protease subunit HflK  36.07 
 
 		 380 aa  204  2e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1431  HflK protein  37.89 
 
 		 471 aa  203  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.936066 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0537  HflK protein  35.16 
 
 		 418 aa  202  8e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.141396  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0575  HflK protein  33.18 
 
 		 459 aa  202  8e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.289879  hitchhiker  0.000000000363385 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2194  HflK protein  37 
 
 		 456 aa  202  9e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4944  HflK protein  34.04 
 
 		 393 aa  202  9e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499727 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5671  protease subunit HflK  33.95 
 
 		 399 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2079  HflK  35.65 
 
 		 457 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1879  HflK protein  33.76 
 
 		 471 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2630  HflK protein  34.95 
 
 		 414 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.587706  unclonable  0.00000000000633953 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0073  HflK protein  33.6 
 
 		 452 aa  201  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.715541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65280  protease subunit HflK  33.86 
 
 		 400 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2011  HflK protein  37.36 
 
 		 378 aa  199  7.999999999999999e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.166821  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0630  HflK protein  37.11 
 
 		 309 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3430  HflK protein  32.23 
 
 		 381 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0909026  normal  0.0445873 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>