More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2099 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A2079  HflK  82.28 
 
 
457 aa  704    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2099  HflK protein  100 
 
 
447 aa  907    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.080069 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1066  HflK protein  67.57 
 
 
477 aa  586  1e-166  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1158  HflK protein  68.11 
 
 
475 aa  586  1e-166  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1222  hypothetical protein  67.19 
 
 
447 aa  568  1e-161  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0015724  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1284  HflK protein  54.92 
 
 
503 aa  445  1.0000000000000001e-124  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0673  HflK protein  53.91 
 
 
498 aa  439  9.999999999999999e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1879  HflK protein  50.33 
 
 
471 aa  424  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239775  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5012  HflK protein  52.24 
 
 
464 aa  423  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2601  HflK protein  49.89 
 
 
474 aa  419  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.373557  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1989  hypothetical protein  55.75 
 
 
435 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.757808  normal  0.0447269 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1177  HflK protein  50.77 
 
 
451 aa  408  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.621922 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1097  HflK protein  50.77 
 
 
451 aa  408  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2300  HflK protein  53.46 
 
 
464 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.194929  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0073  HflK protein  48.57 
 
 
452 aa  407  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.715541  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2978  HflK  52.14 
 
 
436 aa  402  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.750881  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1431  HflK protein  51.76 
 
 
471 aa  404  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.936066 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1413  HflK protein  46.24 
 
 
465 aa  397  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.843638  hitchhiker  0.0000076277 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2194  HflK protein  46.87 
 
 
456 aa  388  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2861  HflK protein  54.59 
 
 
393 aa  382  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0445  HflK protein  49.52 
 
 
399 aa  384  1e-105  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.713082  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0603  HflK  49.88 
 
 
395 aa  379  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3383  HflK protein  48.98 
 
 
433 aa  376  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1601  FtsH protease activity modulator HflK  47.95 
 
 
460 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.559516  normal  0.13244 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0069  ftsH protease activity modulator HflK  49.34 
 
 
449 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.255254  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2182  HflK protein  49.34 
 
 
454 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2220  HflK protein  49.34 
 
 
454 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2241  ftsH protease activity modulator HflK  49.87 
 
 
445 aa  364  1e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.753349  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2534  HflK protein  46.41 
 
 
466 aa  364  2e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0683686  hitchhiker  0.0000321559 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2347  ftsH protease activity modulator HflK  49.21 
 
 
442 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1099  HflK protein  49.21 
 
 
437 aa  361  1e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1338  ftsH protease activity modulator HflK  49.21 
 
 
437 aa  361  1e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.123813  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1827  HflK protein  49.21 
 
 
437 aa  361  1e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6274  HflK protein  46.75 
 
 
462 aa  345  7e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.321519  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1805  HflK protein  46.75 
 
 
462 aa  345  7e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.644359  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5106  membrane protein, HflK  44 
 
 
434 aa  343  4e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167659  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1743  HflK protein  46.27 
 
 
453 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1716  HflK protein  46.11 
 
 
441 aa  323  3e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.40222  normal  0.183963 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1829  HflK protein  46.08 
 
 
436 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.51115  normal  0.182699 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1587  HflK protein  44.08 
 
 
391 aa  311  2e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  0.000000287062 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1470  HflK protein  44.73 
 
 
446 aa  301  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.407344  normal  0.172273 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1981  hflK protein  42.31 
 
 
403 aa  298  2e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.245892  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1090  HflK protein  39.64 
 
 
405 aa  281  2e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0664  HflK protein  39.22 
 
 
395 aa  280  3e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119349  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0899  HflK protein  42.34 
 
 
393 aa  277  2e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0975444  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2588  HflK-like protein  42.71 
 
 
413 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0268051  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2760  hflK protein  39.48 
 
 
395 aa  257  2e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.467094  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1942  HflK protein  42.69 
 
 
406 aa  257  3e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0494  HflK protein  37.47 
 
 
420 aa  256  6e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0869387  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2630  HflK protein  39 
 
 
414 aa  255  1.0000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.587706  unclonable  0.00000000000633953 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0560  HflK protein  35.97 
 
 
379 aa  254  3e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000508673  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2775  HflK protein  39.71 
 
 
407 aa  253  4.0000000000000004e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.631508  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4768  HflK protein  40.42 
 
 
393 aa  253  6e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4892  HflK protein  40.42 
 
 
405 aa  252  7e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.42676  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4683  HflK protein  39.28 
 
 
393 aa  252  9.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0537  HflK protein  36.91 
 
 
418 aa  250  3e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.141396  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65280  protease subunit HflK  41.86 
 
 
400 aa  249  7e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2665  heat shock protein HslU  37.4 
 
 
386 aa  249  9e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.288159  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0487  HflK protein  36.49 
 
 
420 aa  249  1e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0600  HflK protein  36.1 
 
 
381 aa  248  1e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0138092  hitchhiker  0.00143389 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3430  HflK protein  36.1 
 
 
381 aa  248  1e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0909026  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0575  HflK protein  37.47 
 
 
459 aa  248  1e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.289879  hitchhiker  0.000000000363385 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5671  protease subunit HflK  41.98 
 
 
399 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07560  membrane bound protease regulator HflK  41.35 
 
 
351 aa  248  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0525  HflK  37.84 
 
 
389 aa  246  4e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.325556  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4944  HflK protein  42.52 
 
 
393 aa  247  4e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499727 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3765  HflK protein  35.2 
 
 
379 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000022736  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3708  HflK protein  35.2 
 
 
379 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000788714  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3891  HflK protein  35.2 
 
 
379 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000465537  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4940  hflK protein  38.18 
 
 
395 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0637  HflK protein  38.57 
 
 
389 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0128609 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3203  HflK protein  35.23 
 
 
386 aa  242  7.999999999999999e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.143701  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0574  HflK  39.84 
 
 
400 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3278  HflK protein  36.7 
 
 
380 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010392  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1573  HflK protein  37.74 
 
 
367 aa  240  5e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000427817  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00092  serine protease  39.52 
 
 
401 aa  239  5e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002261  HflK protein  38.4 
 
 
401 aa  238  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0330443  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0599  HflK protein  34.75 
 
 
381 aa  236  6e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0263631  hitchhiker  0.00000131875 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1749  HflK protein  38.69 
 
 
376 aa  236  7e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.254466  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0605  hflK protein  35.64 
 
 
381 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3980  HflK protein  37.61 
 
 
382 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.758687  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0327  HflK protein  35.01 
 
 
382 aa  234  3e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00651  HflK complex with HflC  36.14 
 
 
383 aa  233  4.0000000000000004e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.763897  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0568  HflK protein  33.59 
 
 
380 aa  231  2e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0118849  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2203  HflK  35.6 
 
 
407 aa  231  3e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2011  HflK protein  38.97 
 
 
378 aa  228  2e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.166821  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1730  HflK protein  38.1 
 
 
389 aa  227  3e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000348315 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4168  HflK protein  35.05 
 
 
379 aa  224  3e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000320742  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4005  HflK protein  35.77 
 
 
383 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.906349  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1397  hflK protein  37.64 
 
 
382 aa  223  4.9999999999999996e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3309  HflK protein  34.23 
 
 
386 aa  223  6e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1664  HflK protein  34.04 
 
 
385 aa  222  8e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1353  band 7 protein:stomatin  37.57 
 
 
384 aa  222  9.999999999999999e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.792313  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3917  FtsH protease regulator HflK  36.03 
 
 
415 aa  221  9.999999999999999e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.357327  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0799  HflK protein  34.43 
 
 
381 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223678  hitchhiker  0.00931868 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3719  FtsH protease regulator HflK  36.44 
 
 
420 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0503077  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3670  HflK protein  38.99 
 
 
399 aa  221  3e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119308  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3023  hflK protein  32.66 
 
 
377 aa  221  3e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000561401  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2349  HflK  35.26 
 
 
382 aa  220  5e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3538  HflK protein  32.58 
 
 
383 aa  219  1e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0107822  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>