More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1573 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1573  HflK protein  100 
 
 
367 aa  745    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000427817  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2674  HflK protein  47.54 
 
 
388 aa  296  3e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0162976 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0263  HflK protein  47.13 
 
 
360 aa  294  2e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1090  HflK protein  42.63 
 
 
405 aa  293  4e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2203  HflK  46.78 
 
 
407 aa  289  6e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0486  HflK protein  47.19 
 
 
361 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.333714 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0866  HflK protein  47.84 
 
 
387 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0134837  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2279  HflK protein  44.77 
 
 
378 aa  281  1e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1664  HflK protein  42.78 
 
 
385 aa  279  5e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2946  HflK protein  48.32 
 
 
359 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4005  HflK protein  42.13 
 
 
383 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.906349  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0603  HflK  41.18 
 
 
395 aa  266  5.999999999999999e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2728  HflK protein  41.55 
 
 
385 aa  266  5.999999999999999e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1981  hflK protein  40.69 
 
 
403 aa  258  8e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.245892  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0604  HflK protein  40.38 
 
 
368 aa  258  1e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0450848 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2349  HflK  41.76 
 
 
382 aa  256  3e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3352  HflK protein  41.44 
 
 
389 aa  257  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.154635 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2588  HflK-like protein  40.97 
 
 
413 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0268051  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2458  HflK protein  40.83 
 
 
398 aa  254  2.0000000000000002e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0761893 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3262  HflK protein  40.21 
 
 
383 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.264682  normal  0.260183 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2038  HflK protein  41.53 
 
 
390 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal  0.793303 
 
 
-
 
NC_002978  WD0831  hflK protein  38.97 
 
 
344 aa  251  2e-65  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.604081  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0445  HflK protein  44.7 
 
 
399 aa  249  5e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.713082  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6097  protease activity modulator HflK  42.24 
 
 
379 aa  247  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0899  HflK protein  42.77 
 
 
393 aa  243  3e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0975444  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3383  HflK protein  37.97 
 
 
433 aa  241  1e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5012  HflK protein  40.59 
 
 
464 aa  240  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65280  protease subunit HflK  36.08 
 
 
400 aa  239  5e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5671  protease subunit HflK  35.92 
 
 
399 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1730  HflK protein  39.48 
 
 
389 aa  237  3e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000348315 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1587  HflK protein  40.12 
 
 
391 aa  235  7e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  0.000000287062 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2978  HflK  42.47 
 
 
436 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.750881  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2099  HflK protein  37.33 
 
 
447 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.080069 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0073  HflK protein  37.73 
 
 
452 aa  233  3e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.715541  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4892  HflK protein  35.84 
 
 
405 aa  232  9e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.42676  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4768  HflK protein  35.84 
 
 
393 aa  232  9e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3384  HflK protein  42.26 
 
 
359 aa  231  1e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.16512  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2079  HflK  40.45 
 
 
457 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4683  HflK protein  35.86 
 
 
393 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2665  heat shock protein HslU  38.38 
 
 
386 aa  231  2e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.288159  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0637  HflK protein  37.23 
 
 
389 aa  230  3e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0128609 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0560  HflK protein  38.4 
 
 
379 aa  230  3e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000508673  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4944  HflK protein  35.77 
 
 
393 aa  230  4e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499727 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07560  membrane bound protease regulator HflK  38.11 
 
 
351 aa  229  6e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0574  HflK  35.84 
 
 
400 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1097  HflK protein  36.55 
 
 
451 aa  227  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1177  HflK protein  36.55 
 
 
451 aa  227  2e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.621922 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1089  HflK protein  39.94 
 
 
386 aa  227  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0604271 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1353  band 7 protein:stomatin  39.14 
 
 
384 aa  227  3e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.792313  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1942  HflK protein  40.37 
 
 
406 aa  226  4e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0701  HflK protein  38.95 
 
 
389 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.704502  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1749  HflK protein  38.35 
 
 
376 aa  226  6e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.254466  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3765  HflK protein  38.4 
 
 
379 aa  226  7e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000022736  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3891  HflK protein  38.4 
 
 
379 aa  226  7e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000465537  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3708  HflK protein  38.4 
 
 
379 aa  226  7e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000788714  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1397  hflK protein  39.14 
 
 
382 aa  225  8e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2300  HflK protein  40.45 
 
 
464 aa  225  9e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.194929  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4940  hflK protein  35.4 
 
 
395 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1284  HflK protein  38.58 
 
 
503 aa  225  1e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1050  hflK protein  38.89 
 
 
357 aa  224  1e-57  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0568  HflK protein  36.9 
 
 
380 aa  224  2e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0118849  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2601  HflK protein  40.32 
 
 
474 aa  224  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.373557  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0673  HflK protein  37.89 
 
 
498 aa  224  2e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1879  HflK protein  39.81 
 
 
471 aa  223  4e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239775  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0843  HflK  37.15 
 
 
355 aa  223  4e-57  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3309  HflK protein  36.27 
 
 
386 aa  223  4e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2780  HflK protein  39.72 
 
 
379 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.224376 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0600  HflK protein  36.74 
 
 
381 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0138092  hitchhiker  0.00143389 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3430  HflK protein  36.74 
 
 
381 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0909026  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0664  HflK protein  35.71 
 
 
395 aa  221  9.999999999999999e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119349  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1794  HflK protein  39.03 
 
 
383 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.301305  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0525  HflK  34.73 
 
 
389 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.325556  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1431  HflK protein  39.68 
 
 
471 aa  219  5e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.936066 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1886  hflK protein  36.69 
 
 
397 aa  217  2e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4527  HflK protein  41.21 
 
 
394 aa  217  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1561  HflK protein  36.69 
 
 
397 aa  217  2e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.920628  hitchhiker  0.00000000145898 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0599  HflK protein  36.46 
 
 
381 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0263631  hitchhiker  0.00000131875 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1107  HflK protein  39.25 
 
 
308 aa  216  4e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0605  hflK protein  37.47 
 
 
381 aa  216  4e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2194  HflK protein  37.72 
 
 
456 aa  216  4e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0164  HflK protein  40.57 
 
 
347 aa  216  4e-55  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00000564548  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2818  HFLK protein  38.21 
 
 
383 aa  215  8e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44638  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1066  HflK protein  39.41 
 
 
477 aa  215  9e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0999  HflK protein  38.91 
 
 
308 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0630  HflK protein  41.18 
 
 
309 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3023  hflK protein  36.24 
 
 
377 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000561401  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3203  HflK protein  36.73 
 
 
386 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.143701  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1158  HflK protein  39.47 
 
 
475 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0575  HflK protein  33.41 
 
 
459 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.289879  hitchhiker  0.000000000363385 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3278  HflK protein  36.8 
 
 
380 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010392  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2024  HflK protein  39.68 
 
 
379 aa  213  3.9999999999999995e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0184  HflK protein  36.26 
 
 
350 aa  213  3.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464888  normal  0.739242 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1222  hypothetical protein  39.94 
 
 
447 aa  212  7e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0015724  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1601  FtsH protease activity modulator HflK  34.25 
 
 
460 aa  210  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.559516  normal  0.13244 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4168  HflK protein  37.07 
 
 
379 aa  209  6e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000320742  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0665  HflK protein  38.77 
 
 
322 aa  208  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1321  HflK protein  39.37 
 
 
331 aa  207  2e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1413  HflK protein  33.24 
 
 
465 aa  206  6e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.843638  hitchhiker  0.0000076277 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0799  HflK protein  35.95 
 
 
381 aa  206  6e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223678  hitchhiker  0.00931868 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0702  HflK protein  36.48 
 
 
306 aa  206  8e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>