More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2978 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_2978  HflK  100 
 
 
436 aa  887    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.750881  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3383  HflK protein  64.22 
 
 
433 aa  514  1.0000000000000001e-145  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0445  HflK protein  63.57 
 
 
399 aa  479  1e-134  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.713082  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0603  HflK  61.03 
 
 
395 aa  467  9.999999999999999e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0673  HflK protein  46.95 
 
 
498 aa  427  1e-118  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1158  HflK protein  52.35 
 
 
475 aa  427  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1222  hypothetical protein  52.09 
 
 
447 aa  424  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0015724  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1066  HflK protein  52.13 
 
 
477 aa  422  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1284  HflK protein  49.77 
 
 
503 aa  423  1e-117  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2099  HflK protein  56.84 
 
 
447 aa  422  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.080069 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1587  HflK protein  56.29 
 
 
391 aa  419  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  0.000000287062 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1989  hypothetical protein  59.43 
 
 
435 aa  409  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.757808  normal  0.0447269 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2079  HflK  51.67 
 
 
457 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1879  HflK protein  47.19 
 
 
471 aa  395  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239775  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5012  HflK protein  49.65 
 
 
464 aa  390  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1431  HflK protein  53.49 
 
 
471 aa  386  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.936066 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2601  HflK protein  48.87 
 
 
474 aa  382  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.373557  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2194  HflK protein  46.84 
 
 
456 aa  381  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0073  HflK protein  46.1 
 
 
452 aa  379  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.715541  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1097  HflK protein  50.38 
 
 
451 aa  381  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1177  HflK protein  50.38 
 
 
451 aa  381  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.621922 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2861  HflK protein  51.59 
 
 
393 aa  373  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2300  HflK protein  50.74 
 
 
464 aa  373  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.194929  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1601  FtsH protease activity modulator HflK  49.08 
 
 
460 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.559516  normal  0.13244 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1413  HflK protein  47.91 
 
 
465 aa  359  7e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.843638  hitchhiker  0.0000076277 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2534  HflK protein  47.23 
 
 
466 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0683686  hitchhiker  0.0000321559 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2182  HflK protein  48.54 
 
 
454 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2220  HflK protein  48.54 
 
 
454 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2347  ftsH protease activity modulator HflK  48.54 
 
 
442 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1827  HflK protein  48.54 
 
 
437 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1099  HflK protein  48.54 
 
 
437 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1338  ftsH protease activity modulator HflK  48.54 
 
 
437 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.123813  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2241  ftsH protease activity modulator HflK  48.4 
 
 
445 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.753349  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0069  ftsH protease activity modulator HflK  48.54 
 
 
449 aa  336  5e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.255254  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0899  HflK protein  48.14 
 
 
393 aa  326  6e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0975444  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1090  HflK protein  45.29 
 
 
405 aa  322  8e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1981  hflK protein  42.13 
 
 
403 aa  317  2e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.245892  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5106  membrane protein, HflK  45.8 
 
 
434 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167659  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6274  HflK protein  45.91 
 
 
462 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.321519  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1805  HflK protein  45.91 
 
 
462 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.644359  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2588  HflK-like protein  47.63 
 
 
413 aa  311  2e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0268051  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0664  HflK protein  44 
 
 
395 aa  310  2e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119349  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1942  HflK protein  47.04 
 
 
406 aa  309  5e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1743  HflK protein  45.79 
 
 
453 aa  306  3e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1716  HflK protein  45.79 
 
 
441 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.40222  normal  0.183963 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0575  HflK protein  43.68 
 
 
459 aa  301  1e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.289879  hitchhiker  0.000000000363385 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1829  HflK protein  44.85 
 
 
436 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.51115  normal  0.182699 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2665  heat shock protein HslU  43.78 
 
 
386 aa  288  2e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.288159  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4940  hflK protein  40.4 
 
 
395 aa  280  4e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0574  HflK  41.33 
 
 
400 aa  280  5e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2203  HflK  39.74 
 
 
407 aa  279  8e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2630  HflK protein  41.58 
 
 
414 aa  279  8e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.587706  unclonable  0.00000000000633953 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4683  HflK protein  42.22 
 
 
393 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0637  HflK protein  41.71 
 
 
389 aa  273  3e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0128609 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65280  protease subunit HflK  41.57 
 
 
400 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0525  HflK  39.57 
 
 
389 aa  273  6e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.325556  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4892  HflK protein  40.83 
 
 
405 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.42676  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5671  protease subunit HflK  41.4 
 
 
399 aa  271  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4768  HflK protein  40.83 
 
 
393 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1470  HflK protein  42.89 
 
 
446 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.407344  normal  0.172273 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0560  HflK protein  38.4 
 
 
379 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000508673  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4944  HflK protein  41.69 
 
 
393 aa  270  5e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499727 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0537  HflK protein  37.2 
 
 
418 aa  270  5e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.141396  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2775  HflK protein  40.21 
 
 
407 aa  267  2e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.631508  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2760  hflK protein  38.83 
 
 
395 aa  267  2e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.467094  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07560  membrane bound protease regulator HflK  42.48 
 
 
351 aa  263  3e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3891  HflK protein  38.15 
 
 
379 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000465537  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3708  HflK protein  38.15 
 
 
379 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000788714  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3765  HflK protein  38.15 
 
 
379 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000022736  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002261  HflK protein  38.05 
 
 
401 aa  261  2e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0330443  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0494  HflK protein  38.2 
 
 
420 aa  261  2e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0869387  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00092  serine protease  38.52 
 
 
401 aa  259  5.0000000000000005e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3980  HflK protein  43.15 
 
 
382 aa  258  1e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.758687  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0487  HflK protein  35.35 
 
 
420 aa  257  2e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3430  HflK protein  37.1 
 
 
381 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0909026  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0600  HflK protein  37.1 
 
 
381 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0138092  hitchhiker  0.00143389 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2011  HflK protein  43.88 
 
 
378 aa  254  3e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.166821  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00651  HflK complex with HflC  39.94 
 
 
383 aa  254  3e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.763897  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0599  HflK protein  38.37 
 
 
381 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0263631  hitchhiker  0.00000131875 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3278  HflK protein  38.06 
 
 
380 aa  252  1e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010392  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0486  HflK protein  39.57 
 
 
361 aa  251  2e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.333714 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3203  HflK protein  36.24 
 
 
386 aa  250  3e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.143701  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1664  HflK protein  38.67 
 
 
385 aa  249  6e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4005  HflK protein  38.78 
 
 
383 aa  249  9e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.906349  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0327  HflK protein  34.43 
 
 
382 aa  247  4e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1561  HflK protein  38.53 
 
 
397 aa  247  4e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.920628  hitchhiker  0.00000000145898 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1886  hflK protein  38.53 
 
 
397 aa  247  4e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1573  HflK protein  37.91 
 
 
367 aa  246  4.9999999999999997e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000427817  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0605  hflK protein  36.32 
 
 
381 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0568  HflK protein  37.8 
 
 
380 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0118849  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0866  HflK protein  42.45 
 
 
387 aa  242  7.999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0134837  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0799  HflK protein  38.5 
 
 
381 aa  242  7.999999999999999e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223678  hitchhiker  0.00931868 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2946  HflK protein  41.96 
 
 
359 aa  240  4e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0579  HflK protein  35.73 
 
 
386 aa  239  5.999999999999999e-62  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2767  HflK protein  39.3 
 
 
394 aa  239  6.999999999999999e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.397323  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3023  hflK protein  35.68 
 
 
377 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000561401  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4168  HflK protein  38.07 
 
 
379 aa  239  9e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000320742  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3309  HflK protein  34.99 
 
 
386 aa  238  2e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2674  HflK protein  40.4 
 
 
388 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0162976 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2279  HflK protein  41.28 
 
 
378 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>