More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0603 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_0603  HflK  100 
 
 
395 aa  800    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0445  HflK protein  65.09 
 
 
399 aa  493  9.999999999999999e-139  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.713082  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3383  HflK protein  56.38 
 
 
433 aa  439  9.999999999999999e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2978  HflK  59.55 
 
 
436 aa  434  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.750881  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1587  HflK protein  59.9 
 
 
391 aa  424  1e-117  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  0.000000287062 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0673  HflK protein  47.85 
 
 
498 aa  390  1e-107  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1284  HflK protein  52.03 
 
 
503 aa  386  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1066  HflK protein  49.08 
 
 
477 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2099  HflK protein  48.12 
 
 
447 aa  382  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.080069 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1879  HflK protein  48.8 
 
 
471 aa  380  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239775  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1158  HflK protein  49.43 
 
 
475 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1989  hypothetical protein  53.76 
 
 
435 aa  378  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.757808  normal  0.0447269 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1222  hypothetical protein  48.62 
 
 
447 aa  370  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0015724  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1097  HflK protein  49.07 
 
 
451 aa  367  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0073  HflK protein  49.26 
 
 
452 aa  366  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.715541  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2079  HflK  48.01 
 
 
457 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1177  HflK protein  49.07 
 
 
451 aa  367  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.621922 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2194  HflK protein  49.13 
 
 
456 aa  364  1e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1981  hflK protein  50.26 
 
 
403 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.245892  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2601  HflK protein  50.55 
 
 
474 aa  361  1e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.373557  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1431  HflK protein  51.1 
 
 
471 aa  360  2e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.936066 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5012  HflK protein  50.13 
 
 
464 aa  359  4e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2300  HflK protein  53.37 
 
 
464 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.194929  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1090  HflK protein  48.04 
 
 
405 aa  350  3e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2588  HflK-like protein  52.01 
 
 
413 aa  346  4e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0268051  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2861  HflK protein  51.03 
 
 
393 aa  341  2e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0664  HflK protein  46.96 
 
 
395 aa  331  1e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119349  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0899  HflK protein  50.88 
 
 
393 aa  330  2e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0975444  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1413  HflK protein  44.99 
 
 
465 aa  320  3e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.843638  hitchhiker  0.0000076277 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1601  FtsH protease activity modulator HflK  45.38 
 
 
460 aa  318  9e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.559516  normal  0.13244 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2534  HflK protein  44.84 
 
 
466 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0683686  hitchhiker  0.0000321559 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0575  HflK protein  42.17 
 
 
459 aa  312  7.999999999999999e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.289879  hitchhiker  0.000000000363385 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1942  HflK protein  46.54 
 
 
406 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2241  ftsH protease activity modulator HflK  45.08 
 
 
445 aa  298  9e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.753349  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2347  ftsH protease activity modulator HflK  44.81 
 
 
442 aa  296  4e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2220  HflK protein  44.81 
 
 
454 aa  296  4e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2182  HflK protein  44.81 
 
 
454 aa  296  4e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1827  HflK protein  44.81 
 
 
437 aa  296  6e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1338  ftsH protease activity modulator HflK  44.81 
 
 
437 aa  296  6e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.123813  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1099  HflK protein  44.81 
 
 
437 aa  296  6e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0069  ftsH protease activity modulator HflK  44.81 
 
 
449 aa  295  7e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.255254  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2630  HflK protein  45.22 
 
 
414 aa  289  6e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.587706  unclonable  0.00000000000633953 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65280  protease subunit HflK  43.67 
 
 
400 aa  286  4e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5671  protease subunit HflK  44.05 
 
 
399 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4683  HflK protein  42.56 
 
 
393 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4768  HflK protein  42.82 
 
 
393 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4892  HflK protein  42.31 
 
 
405 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.42676  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4944  HflK protein  43.94 
 
 
393 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499727 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4940  hflK protein  42.61 
 
 
395 aa  280  4e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0637  HflK protein  45.45 
 
 
389 aa  279  6e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0128609 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5106  membrane protein, HflK  41.13 
 
 
434 aa  279  7e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167659  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2665  heat shock protein HslU  43.61 
 
 
386 aa  278  9e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.288159  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0574  HflK  44.57 
 
 
400 aa  278  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0525  HflK  43 
 
 
389 aa  275  7e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.325556  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2203  HflK  41.71 
 
 
407 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0537  HflK protein  40.8 
 
 
418 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.141396  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6274  HflK protein  41.24 
 
 
462 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.321519  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1805  HflK protein  41.24 
 
 
462 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.644359  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2775  HflK protein  41.62 
 
 
407 aa  272  7e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.631508  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2011  HflK protein  40.2 
 
 
378 aa  270  4e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.166821  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1743  HflK protein  39.35 
 
 
453 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1716  HflK protein  39.35 
 
 
441 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.40222  normal  0.183963 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1573  HflK protein  41.18 
 
 
367 aa  265  1e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000427817  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07560  membrane bound protease regulator HflK  44.16 
 
 
351 aa  263  4.999999999999999e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00651  HflK complex with HflC  40.72 
 
 
383 aa  262  6e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.763897  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2946  HflK protein  46.5 
 
 
359 aa  262  8e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1829  HflK protein  39.62 
 
 
436 aa  259  7e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.51115  normal  0.182699 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0494  HflK protein  36.36 
 
 
420 aa  257  2e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0869387  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0560  HflK protein  40.06 
 
 
379 aa  256  7e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000508673  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4005  HflK protein  40.48 
 
 
383 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.906349  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1664  HflK protein  40.94 
 
 
385 aa  253  4.0000000000000004e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3430  HflK protein  36.76 
 
 
381 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0909026  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0600  HflK protein  36.76 
 
 
381 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0138092  hitchhiker  0.00143389 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2760  hflK protein  40.38 
 
 
395 aa  252  6e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.467094  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3236  HflK protein  37.99 
 
 
390 aa  252  1e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0144208  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2728  HflK protein  40.92 
 
 
385 aa  249  4e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0568  HflK protein  36.97 
 
 
380 aa  249  4e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0118849  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3708  HflK protein  38.78 
 
 
379 aa  249  6e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000788714  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3891  HflK protein  38.78 
 
 
379 aa  249  6e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000465537  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3765  HflK protein  38.78 
 
 
379 aa  249  6e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000022736  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3278  HflK protein  36.83 
 
 
380 aa  249  7e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010392  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0486  HflK protein  41.35 
 
 
361 aa  249  8e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.333714 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002261  HflK protein  39.9 
 
 
401 aa  248  1e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0330443  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2349  HflK  42.24 
 
 
382 aa  248  2e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00092  serine protease  40.58 
 
 
401 aa  247  2e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6097  protease activity modulator HflK  42.69 
 
 
379 aa  248  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4168  HflK protein  40.17 
 
 
379 aa  246  3e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000320742  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0548  protease subunit HflK  40.12 
 
 
380 aa  246  4e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0599  HflK protein  38.78 
 
 
381 aa  246  4e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0263631  hitchhiker  0.00000131875 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0524  protease subunit HflK  40.12 
 
 
380 aa  246  4.9999999999999997e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3980  HflK protein  40.39 
 
 
382 aa  246  6e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.758687  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0866  HflK protein  42.09 
 
 
387 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0134837  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2674  HflK protein  41.18 
 
 
388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0162976 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1886  hflK protein  40.19 
 
 
397 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1470  HflK protein  40.91 
 
 
446 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.407344  normal  0.172273 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1561  HflK protein  40.19 
 
 
397 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.920628  hitchhiker  0.00000000145898 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0579  HflK protein  35.16 
 
 
386 aa  243  3e-63  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0604  HflK protein  41.85 
 
 
368 aa  243  5e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0450848 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3023  hflK protein  37.2 
 
 
377 aa  243  5e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000561401  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0327  HflK protein  37.8 
 
 
382 aa  242  7e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>