More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1561 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1561  HflK protein  100 
 
 		 397 aa  811    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.920628  hitchhiker  0.00000000145898 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1886  hflK protein  100 
 
 		 397 aa  811    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0603  HflK  37.7 
 
 		 395 aa  256  3e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2588  HflK-like protein  39.62 
 
 		 413 aa  257  3e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0268051  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1664  HflK protein  40.77 
 
 		 385 aa  254  1.0000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1090  HflK protein  40.78 
 
 		 405 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2203  HflK  38.81 
 
 		 407 aa  253  3e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0445  HflK protein  39.94 
 
 		 399 aa  250  4e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.713082  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2978  HflK  39.75 
 
 		 436 aa  245  9.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.750881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1573  HflK protein  37.8 
 
 		 367 aa  245  9.999999999999999e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000427817  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1981  hflK protein  35.88 
 
 		 403 aa  244  3e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.245892  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0263  HflK protein  43.29 
 
 		 360 aa  242  9e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0899  HflK protein  38.31 
 
 		 393 aa  241  2e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0975444  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4940  hflK protein  36.41 
 
 		 395 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1066  HflK protein  36.87 
 
 		 477 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1587  HflK protein  37.57 
 
 		 391 aa  236  4e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000287062 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1158  HflK protein  37.5 
 
 		 475 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3383  HflK protein  35.41 
 
 		 433 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0604  HflK protein  40.68 
 
 		 368 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0450848 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0574  HflK  37.19 
 
 		 400 aa  234  3e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2728  HflK protein  39.78 
 
 		 385 aa  233  5e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4683  HflK protein  36.75 
 
 		 393 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4005  HflK protein  37.95 
 
 		 383 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.906349  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3352  HflK protein  40.22 
 
 		 389 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.154635 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2194  HflK protein  40.18 
 
 		 456 aa  231  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0486  HflK protein  41.44 
 
 		 361 aa  231  2e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.333714 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0664  HflK protein  36.29 
 
 		 395 aa  229  5e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119349  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0866  HflK protein  42.81 
 
 		 387 aa  229  7e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0134837  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1942  HflK protein  36.44 
 
 		 406 aa  229  7e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4892  HflK protein  36.39 
 
 		 405 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.42676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4768  HflK protein  36.39 
 
 		 393 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1989  hypothetical protein  38.85 
 
 		 435 aa  228  1e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.757808  normal  0.0447269 
 
 
-
 
NC_002978  WD0831  hflK protein  35.63 
 
 		 344 aa  228  2e-58  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.604081  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1284  HflK protein  37.3 
 
 		 503 aa  228  2e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1097  HflK protein  39.01 
 
 		 451 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1177  HflK protein  39.01 
 
 		 451 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.621922 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1413  HflK protein  36.34 
 
 		 465 aa  226  8e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.843638  hitchhiker  0.0000076277 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1730  HflK protein  37.04 
 
 		 389 aa  224  2e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000348315 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5012  HflK protein  37.88 
 
 		 464 aa  224  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2349  HflK  43.36 
 
 		 382 aa  224  2e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2946  HflK protein  43.53 
 
 		 359 aa  224  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1879  HflK protein  34.42 
 
 		 471 aa  224  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6097  protease activity modulator HflK  43.73 
 
 		 379 aa  223  4e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0673  HflK protein  36.39 
 
 		 498 aa  223  4.9999999999999996e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4944  HflK protein  36.11 
 
 		 393 aa  223  7e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499727 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2674  HflK protein  41.87 
 
 		 388 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0162976 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2601  HflK protein  36.47 
 
 		 474 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.373557  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0073  HflK protein  34.61 
 
 		 452 aa  220  3.9999999999999997e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.715541  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1222  hypothetical protein  39.01 
 
 		 447 aa  219  5e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0015724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2038  HflK protein  43.55 
 
 		 390 aa  219  5e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal  0.793303 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1431  HflK protein  39.78 
 
 		 471 aa  219  7e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.936066 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5671  protease subunit HflK  35.81 
 
 		 399 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3384  HflK protein  40.15 
 
 		 359 aa  218  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.16512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0575  HflK protein  33.69 
 
 		 459 aa  218  1e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.289879  hitchhiker  0.000000000363385 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65280  protease subunit HflK  35.71 
 
 		 400 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2458  HflK protein  42.11 
 
 		 398 aa  218  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0761893 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3262  HflK protein  43.73 
 
 		 383 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.264682  normal  0.260183 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0525  HflK  34.94 
 
 		 389 aa  216  4e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.325556  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1716  HflK protein  39.79 
 
 		 441 aa  216  8e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.40222  normal  0.183963 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1743  HflK protein  39.79 
 
 		 453 aa  216  8e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2241  ftsH protease activity modulator HflK  41.81 
 
 		 445 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.753349  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0701  HflK protein  42.31 
 
 		 389 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.704502  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2780  HflK protein  41.26 
 
 		 379 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.224376 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2279  HflK protein  42.86 
 
 		 378 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0560  HflK protein  33.87 
 
 		 379 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000508673  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1089  HflK protein  41.61 
 
 		 386 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0604271 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3430  HflK protein  35.57 
 
 		 381 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0909026  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2099  HflK protein  34.18 
 
 		 447 aa  212  7.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.080069 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0600  HflK protein  35.57 
 
 		 381 aa  212  9e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0138092  hitchhiker  0.00143389 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2182  HflK protein  40.77 
 
 		 454 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2011  HflK protein  36.46 
 
 		 378 aa  211  2e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.166821  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0069  ftsH protease activity modulator HflK  40.77 
 
 		 449 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.255254  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1338  ftsH protease activity modulator HflK  40.77 
 
 		 437 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.123813  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2347  ftsH protease activity modulator HflK  40.77 
 
 		 442 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2220  HflK protein  40.77 
 
 		 454 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1099  HflK protein  40.77 
 
 		 437 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1827  HflK protein  40.77 
 
 		 437 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0637  HflK protein  35.01 
 
 		 389 aa  210  3e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0128609 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2885  HflK protein  40.81 
 
 		 382 aa  210  4e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2658  HflK protein  40.81 
 
 		 382 aa  210  4e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3278  HflK protein  35.17 
 
 		 380 aa  209  7e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010392  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0843  HflK  37.61 
 
 		 355 aa  208  1e-52  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3891  HflK protein  33.6 
 
 		 379 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000465537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3708  HflK protein  33.6 
 
 		 379 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000788714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2861  HflK protein  39.37 
 
 		 393 aa  208  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3765  HflK protein  33.6 
 
 		 379 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000022736  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1353  band 7 protein:stomatin  36.28 
 
 		 384 aa  209  1e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.792313  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1601  FtsH protease activity modulator HflK  38.95 
 
 		 460 aa  208  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.559516  normal  0.13244 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2300  HflK protein  39.63 
 
 		 464 aa  207  3e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.194929  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07560  membrane bound protease regulator HflK  37.19 
 
 		 351 aa  207  4e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2079  HflK  36.74 
 
 		 457 aa  206  6e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0599  HflK protein  34.59 
 
 		 381 aa  206  8e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0263631  hitchhiker  0.00000131875 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1470  HflK protein  40.14 
 
 		 446 aa  205  9e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.407344  normal  0.172273 
 
 
-
 
NC_004310  BR1397  hflK protein  35.98 
 
 		 382 aa  205  1e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1050  hflK protein  37.5 
 
 		 357 aa  205  1e-51  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0537  HflK protein  31.88 
 
 		 418 aa  203  5e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.141396  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2534  HflK protein  38.6 
 
 		 466 aa  203  5e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0683686  hitchhiker  0.0000321559 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2767  HflK protein  34.38 
 
 		 394 aa  202  7e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.397323  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0164  HflK protein  34.72 
 
 		 347 aa  202  8e-51  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00000564548  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2665  heat shock protein HslU  35.19 
 
 		 386 aa  202  8e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.288159  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>