More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5012 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0073  HflK protein  77.12 
 
 
452 aa  671    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.715541  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1097  HflK protein  76.51 
 
 
451 aa  682    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1177  HflK protein  76.51 
 
 
451 aa  682    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.621922 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1431  HflK protein  75.64 
 
 
471 aa  654    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.936066 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5012  HflK protein  100 
 
 
464 aa  936    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1879  HflK protein  72.1 
 
 
471 aa  624  1e-178  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239775  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2601  HflK protein  69.28 
 
 
474 aa  625  1e-178  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.373557  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2300  HflK protein  72.79 
 
 
464 aa  596  1e-169  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.194929  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2194  HflK protein  68.78 
 
 
456 aa  571  1.0000000000000001e-162  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1989  hypothetical protein  56.86 
 
 
435 aa  442  1e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.757808  normal  0.0447269 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2099  HflK protein  51.19 
 
 
447 aa  427  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.080069 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2861  HflK protein  57.8 
 
 
393 aa  422  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2079  HflK  51.86 
 
 
457 aa  421  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1222  hypothetical protein  50.86 
 
 
447 aa  413  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0015724  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1158  HflK protein  49.36 
 
 
475 aa  412  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1066  HflK protein  49.89 
 
 
477 aa  409  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1284  HflK protein  47.45 
 
 
503 aa  403  1e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0673  HflK protein  43.33 
 
 
498 aa  403  1e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0445  HflK protein  48.61 
 
 
399 aa  369  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.713082  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3383  HflK protein  46.24 
 
 
433 aa  366  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1601  FtsH protease activity modulator HflK  46.4 
 
 
460 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.559516  normal  0.13244 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2978  HflK  48.48 
 
 
436 aa  364  1e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.750881  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0603  HflK  51.53 
 
 
395 aa  363  3e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2534  HflK protein  46.15 
 
 
466 aa  359  7e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0683686  hitchhiker  0.0000321559 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1413  HflK protein  44.91 
 
 
465 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.843638  hitchhiker  0.0000076277 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2182  HflK protein  44.94 
 
 
454 aa  341  1e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2220  HflK protein  44.94 
 
 
454 aa  341  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0069  ftsH protease activity modulator HflK  44.94 
 
 
449 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.255254  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2347  ftsH protease activity modulator HflK  44.91 
 
 
442 aa  340  4e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2241  ftsH protease activity modulator HflK  43.78 
 
 
445 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.753349  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1099  HflK protein  44.91 
 
 
437 aa  339  7e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1338  ftsH protease activity modulator HflK  44.91 
 
 
437 aa  339  7e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.123813  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1827  HflK protein  44.91 
 
 
437 aa  339  7e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1743  HflK protein  42.82 
 
 
453 aa  332  1e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6274  HflK protein  42.96 
 
 
462 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.321519  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1805  HflK protein  42.96 
 
 
462 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.644359  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1716  HflK protein  42.79 
 
 
441 aa  330  4e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.40222  normal  0.183963 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5106  membrane protein, HflK  41.87 
 
 
434 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167659  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1587  HflK protein  45.19 
 
 
391 aa  309  8e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  0.000000287062 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1829  HflK protein  42.54 
 
 
436 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.51115  normal  0.182699 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1470  HflK protein  41.34 
 
 
446 aa  296  4e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.407344  normal  0.172273 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1981  hflK protein  41.55 
 
 
403 aa  288  1e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.245892  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5671  protease subunit HflK  41.33 
 
 
399 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1090  HflK protein  43.4 
 
 
405 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0664  HflK protein  38.6 
 
 
395 aa  273  4.0000000000000004e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119349  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65280  protease subunit HflK  41.07 
 
 
400 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0899  HflK protein  41.25 
 
 
393 aa  272  1e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0975444  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4892  HflK protein  40.56 
 
 
405 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.42676  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4768  HflK protein  40.56 
 
 
393 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4940  hflK protein  39.64 
 
 
395 aa  268  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4683  HflK protein  40.28 
 
 
393 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4944  HflK protein  40.41 
 
 
393 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499727 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0574  HflK  39.23 
 
 
400 aa  265  1e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0637  HflK protein  42.03 
 
 
389 aa  265  1e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0128609 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2588  HflK-like protein  43.79 
 
 
413 aa  264  3e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0268051  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0525  HflK  38.07 
 
 
389 aa  258  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.325556  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1942  HflK protein  38.35 
 
 
406 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0494  HflK protein  37.57 
 
 
420 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0869387  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2775  HflK protein  38.38 
 
 
407 aa  255  1.0000000000000001e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.631508  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07560  membrane bound protease regulator HflK  41.84 
 
 
351 aa  254  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0537  HflK protein  37.86 
 
 
418 aa  248  2e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.141396  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2760  hflK protein  38.18 
 
 
395 aa  247  3e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.467094  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0327  HflK protein  35.79 
 
 
382 aa  244  1.9999999999999999e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2665  heat shock protein HslU  38.69 
 
 
386 aa  243  3.9999999999999997e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.288159  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0575  HflK protein  35.7 
 
 
459 aa  243  5e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.289879  hitchhiker  0.000000000363385 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2630  HflK protein  37.13 
 
 
414 aa  242  9e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.587706  unclonable  0.00000000000633953 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0600  HflK protein  33.82 
 
 
381 aa  241  1e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0138092  hitchhiker  0.00143389 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3430  HflK protein  33.82 
 
 
381 aa  241  1e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0909026  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1573  HflK protein  40.59 
 
 
367 aa  239  6.999999999999999e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000427817  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0560  HflK protein  35.62 
 
 
379 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000508673  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00092  serine protease  39.23 
 
 
401 aa  233  4.0000000000000004e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00651  HflK complex with HflC  33.68 
 
 
383 aa  232  8.000000000000001e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.763897  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2011  HflK protein  39.02 
 
 
378 aa  233  8.000000000000001e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.166821  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0599  HflK protein  34.13 
 
 
381 aa  232  9e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0263631  hitchhiker  0.00000131875 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0605  hflK protein  33.75 
 
 
381 aa  231  2e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2203  HflK  36.39 
 
 
407 aa  231  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002261  HflK protein  37.24 
 
 
401 aa  231  2e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0330443  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3891  HflK protein  34.52 
 
 
379 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000465537  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3708  HflK protein  34.52 
 
 
379 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000788714  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3765  HflK protein  34.52 
 
 
379 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000022736  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2458  HflK protein  38.72 
 
 
398 aa  228  2e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0761893 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1664  HflK protein  38.08 
 
 
385 aa  225  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3980  HflK protein  37.17 
 
 
382 aa  224  2e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.758687  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3203  HflK protein  32.26 
 
 
386 aa  223  4e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.143701  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0487  HflK protein  31.69 
 
 
420 aa  223  4.9999999999999996e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3719  FtsH protease regulator HflK  37.08 
 
 
420 aa  223  6e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0503077  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3278  HflK protein  35.07 
 
 
380 aa  222  9e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010392  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4760  FtsH protease regulator HflK  35.8 
 
 
419 aa  220  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4645  FtsH protease regulator HflK  36.93 
 
 
419 aa  220  3e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.14387 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0263  HflK protein  40.52 
 
 
360 aa  220  5e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3917  FtsH protease regulator HflK  38.33 
 
 
415 aa  220  5e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.357327  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04041  modulator for HflB protease specific for phage lambda cII repressor  36.6 
 
 
419 aa  219  1e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.298849  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4416  FtsH protease regulator HflK  36.6 
 
 
419 aa  219  1e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.953832  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5690  FtsH protease regulator HflK  36.6 
 
 
419 aa  219  1e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.440871  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3236  HflK protein  33.68 
 
 
390 aa  218  1e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0144208  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3839  FtsH protease regulator HflK  36.6 
 
 
419 aa  219  1e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.910091  hitchhiker  0.000000232279 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4732  FtsH protease regulator HflK  36.6 
 
 
419 aa  219  1e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.938149  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4781  FtsH protease regulator HflK  35.49 
 
 
419 aa  219  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.932984  normal  0.393456 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4705  FtsH protease regulator HflK  36.6 
 
 
419 aa  219  1e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.714132  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4724  FtsH protease regulator HflK  35.49 
 
 
419 aa  219  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>