More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0866 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0866  HflK protein  100 
 
 		 387 aa  791    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0134837  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2279  HflK protein  59.38 
 
 		 378 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2674  HflK protein  56.95 
 
 		 388 aa  403  1e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0162976 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2946  HflK protein  54.12 
 
 		 359 aa  383  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0263  HflK protein  51.71 
 
 		 360 aa  363  2e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0486  HflK protein  47.61 
 
 		 361 aa  322  6e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.333714 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1573  HflK protein  47.84 
 
 		 367 aa  283  3.0000000000000004e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000427817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2203  HflK  44.31 
 
 		 407 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1664  HflK protein  45.86 
 
 		 385 aa  258  9e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0664  HflK protein  42.21 
 
 		 395 aa  251  1e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119349  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1981  hflK protein  40.68 
 
 		 403 aa  250  3e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.245892  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1090  HflK protein  41.5 
 
 		 405 aa  250  3e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2458  HflK protein  42.81 
 
 		 398 aa  248  1e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0761893 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0843  HflK  45.24 
 
 		 355 aa  246  4e-64  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1050  hflK protein  46.44 
 
 		 357 aa  245  9e-64  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2588  HflK-like protein  44.67 
 
 		 413 aa  245  9.999999999999999e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0268051  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0603  HflK  43.45 
 
 		 395 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3262  HflK protein  45.54 
 
 		 383 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.264682  normal  0.260183 
 
 
-
 
NC_002978  WD0831  hflK protein  41.61 
 
 		 344 aa  238  1e-61  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.604081  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4005  HflK protein  41.94 
 
 		 383 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.906349  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2349  HflK  41.08 
 
 		 382 aa  236  6e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2728  HflK protein  41.28 
 
 		 385 aa  236  6e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3352  HflK protein  44.31 
 
 		 389 aa  236  7e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.154635 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6097  protease activity modulator HflK  43.1 
 
 		 379 aa  235  8e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2978  HflK  42.81 
 
 		 436 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.750881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0604  HflK protein  44.34 
 
 		 368 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0450848 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2038  HflK protein  42.94 
 
 		 390 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal  0.793303 
 
 
-
 
NC_004310  BR1397  hflK protein  38.84 
 
 		 382 aa  232  1e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0575  HflK protein  37.78 
 
 		 459 aa  231  2e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.289879  hitchhiker  0.000000000363385 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1353  band 7 protein:stomatin  38.57 
 
 		 384 aa  228  9e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.792313  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3383  HflK protein  40.2 
 
 		 433 aa  226  4e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2018  HflK protein  41.35 
 
 		 362 aa  226  4e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1749  HflK protein  37.75 
 
 		 376 aa  224  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.254466  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0673  HflK protein  39.94 
 
 		 498 aa  223  3e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0445  HflK protein  41.44 
 
 		 399 aa  224  3e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.713082  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1794  HflK protein  40.91 
 
 		 383 aa  224  3e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.301305  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1107  HflK protein  38.44 
 
 		 308 aa  223  3e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0899  HflK protein  40.27 
 
 		 393 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0975444  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0999  HflK protein  38.44 
 
 		 308 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0702  HflK protein  40.07 
 
 		 306 aa  220  3e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3384  HflK protein  39.34 
 
 		 359 aa  220  3e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.16512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0630  HflK protein  39.15 
 
 		 309 aa  219  5e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0701  HflK protein  38.71 
 
 		 389 aa  219  6e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.704502  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1942  HflK protein  40.27 
 
 		 406 aa  219  6e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1284  HflK protein  39.4 
 
 		 503 aa  219  7e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1886  hflK protein  42.81 
 
 		 397 aa  218  1e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1561  HflK protein  42.81 
 
 		 397 aa  218  1e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.920628  hitchhiker  0.00000000145898 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2262  HflK protein  39.63 
 
 		 333 aa  218  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015812  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1089  HflK protein  38.71 
 
 		 386 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0604271 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2818  HFLK protein  40.46 
 
 		 383 aa  217  2.9999999999999998e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44638  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1730  HflK protein  40.69 
 
 		 389 aa  216  7e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000348315 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3522  HflK protein  43.33 
 
 		 378 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1587  HflK protein  41.75 
 
 		 391 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000287062 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3678  HflK protein  41.32 
 
 		 350 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2798  HflK protein  37.54 
 
 		 357 aa  214  1.9999999999999998e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.786571  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4940  hflK protein  39.93 
 
 		 395 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3613  HflK protein  41.32 
 
 		 350 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0164  HflK protein  40.21 
 
 		 347 aa  213  3.9999999999999995e-54  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00000564548  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2099  HflK protein  36.56 
 
 		 447 aa  212  7.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.080069 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0574  HflK  39.93 
 
 		 400 aa  212  9e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1066  HflK protein  37.22 
 
 		 477 aa  212  9e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2024  HflK protein  39.61 
 
 		 379 aa  212  9e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07560  membrane bound protease regulator HflK  39.87 
 
 		 351 aa  211  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2736  Protein HflK  39.8 
 
 		 382 aa  211  2e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.12799  normal  0.0330194 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1158  HflK protein  39 
 
 		 475 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0665  HflK protein  40.07 
 
 		 322 aa  211  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4125  HflK protein  42.55 
 
 		 515 aa  211  2e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1097  HflK protein  38.98 
 
 		 451 aa  210  4e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1177  HflK protein  38.98 
 
 		 451 aa  210  4e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.621922 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2780  HflK protein  40.28 
 
 		 379 aa  209  5e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.224376 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5012  HflK protein  38.49 
 
 		 464 aa  208  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2079  HflK  38.59 
 
 		 457 aa  208  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2885  HflK protein  40.14 
 
 		 382 aa  208  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2658  HflK protein  40.14 
 
 		 382 aa  208  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1989  hypothetical protein  39.41 
 
 		 435 aa  208  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.757808  normal  0.0447269 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0637  HflK protein  37.88 
 
 		 389 aa  207  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0128609 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5671  protease subunit HflK  39.26 
 
 		 399 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65280  protease subunit HflK  39.26 
 
 		 400 aa  207  3e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0885  HflK protein  37.83 
 
 		 394 aa  206  5e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.240559 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2760  hflK protein  36.27 
 
 		 395 aa  205  1e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.467094  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3670  HflK protein  38.59 
 
 		 399 aa  204  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0525  HflK  38.44 
 
 		 389 aa  204  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.325556  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4527  HflK protein  37.17 
 
 		 394 aa  204  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4683  HflK protein  38.18 
 
 		 393 aa  202  6e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0357  HflK protein  37.7 
 
 		 393 aa  202  6e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.24266  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2001  HflK protein  37.7 
 
 		 393 aa  202  6e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.610891  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2194  HflK protein  36.69 
 
 		 456 aa  202  6e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1431  HflK protein  37.54 
 
 		 471 aa  202  7e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.936066 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2800  HflK protein  39.6 
 
 		 360 aa  202  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182223  normal  0.400207 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1222  hypothetical protein  38.91 
 
 		 447 aa  202  8e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0015724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2541  HflK protein  38.59 
 
 		 362 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2300  HflK protein  38.78 
 
 		 464 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.194929  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2011  HflK protein  37.46 
 
 		 378 aa  202  9.999999999999999e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.166821  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1879  HflK protein  37.34 
 
 		 471 aa  202  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00092  serine protease  36.74 
 
 		 401 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4892  HflK protein  37.5 
 
 		 405 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.42676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4768  HflK protein  37.5 
 
 		 393 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4944  HflK protein  37.5 
 
 		 393 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499727 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0073  HflK protein  36.69 
 
 		 452 aa  199  6e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.715541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2767  HflK protein  36.21 
 
 		 394 aa  199  6e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.397323  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>