More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3352 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2038  HflK protein  94.4 
 
 		 390 aa  674    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal  0.793303 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3262  HflK protein  85.71 
 
 		 383 aa  652    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.264682  normal  0.260183 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3352  HflK protein  100 
 
 		 389 aa  780    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.154635 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4005  HflK protein  86.89 
 
 		 383 aa  680    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.906349  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2728  HflK protein  80.76 
 
 		 385 aa  618  1e-176  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2349  HflK  78.67 
 
 		 382 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6097  protease activity modulator HflK  75.84 
 
 		 379 aa  523  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1664  HflK protein  63.4 
 
 		 385 aa  473  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1730  HflK protein  52.8 
 
 		 389 aa  377  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000348315 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0604  HflK protein  54.59 
 
 		 368 aa  365  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0450848 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2458  HflK protein  52.49 
 
 		 398 aa  362  9e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0761893 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2203  HflK  52.91 
 
 		 407 aa  356  5e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1089  HflK protein  54.09 
 
 		 386 aa  354  1e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0604271 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0701  HflK protein  53.24 
 
 		 389 aa  354  2e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.704502  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4527  HflK protein  48.46 
 
 		 394 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2780  HflK protein  49.85 
 
 		 379 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.224376 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2658  HflK protein  48.96 
 
 		 382 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2885  HflK protein  48.96 
 
 		 382 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2946  HflK protein  50.16 
 
 		 359 aa  280  4e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2024  HflK protein  46.84 
 
 		 379 aa  277  2e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0263  HflK protein  45.29 
 
 		 360 aa  275  8e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1749  HflK protein  42.68 
 
 		 376 aa  271  1e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.254466  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3670  HflK protein  41.5 
 
 		 399 aa  271  1e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0486  HflK protein  45.97 
 
 		 361 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.333714 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2674  HflK protein  44.9 
 
 		 388 aa  268  8.999999999999999e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0162976 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1956  HflK protein  41.53 
 
 		 387 aa  268  2e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.733622  normal  0.100531 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2736  Protein HflK  43.18 
 
 		 382 aa  266  5e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.12799  normal  0.0330194 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1573  HflK protein  41.44 
 
 		 367 aa  265  8.999999999999999e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000427817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0357  HflK protein  41.34 
 
 		 393 aa  265  1e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.24266  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2001  HflK protein  41.34 
 
 		 393 aa  265  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.610891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0885  HflK protein  39.89 
 
 		 394 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.240559 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3384  HflK protein  41.57 
 
 		 359 aa  254  1.0000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.16512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3173  HflK protein  41.26 
 
 		 394 aa  253  5.000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2018  HflK protein  42.81 
 
 		 362 aa  253  6e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1090  HflK protein  37.33 
 
 		 405 aa  249  4e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0831  hflK protein  38.72 
 
 		 344 aa  246  4e-64  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.604081  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2588  HflK-like protein  40.52 
 
 		 413 aa  246  4e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0268051  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0843  HflK  38.95 
 
 		 355 aa  245  8e-64  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1981  hflK protein  39.12 
 
 		 403 aa  245  9e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.245892  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2818  HFLK protein  40.95 
 
 		 383 aa  244  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44638  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1353  band 7 protein:stomatin  40.44 
 
 		 384 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.792313  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1397  hflK protein  40.17 
 
 		 382 aa  241  1e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0603  HflK  39.45 
 
 		 395 aa  241  2e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1794  HflK protein  40 
 
 		 383 aa  239  4e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.301305  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0866  HflK protein  44.31 
 
 		 387 aa  240  4e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0134837  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2279  HflK protein  44.19 
 
 		 378 aa  239  5e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0899  HflK protein  38.93 
 
 		 393 aa  239  9e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0975444  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1050  hflK protein  42.86 
 
 		 357 aa  236  7e-61  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0445  HflK protein  38.12 
 
 		 399 aa  233  6e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.713082  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3383  HflK protein  35.44 
 
 		 433 aa  231  1e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2978  HflK  38.12 
 
 		 436 aa  230  3e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.750881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1942  HflK protein  38.74 
 
 		 406 aa  228  1e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1284  HflK protein  39.53 
 
 		 503 aa  228  1e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1587  HflK protein  40.43 
 
 		 391 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000287062 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3344  HflK protein  40.77 
 
 		 370 aa  225  9e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.405881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2541  HflK protein  38.6 
 
 		 362 aa  225  9e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2800  HflK protein  39.71 
 
 		 360 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182223  normal  0.400207 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1989  hypothetical protein  37.46 
 
 		 435 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.757808  normal  0.0447269 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2099  HflK protein  36.52 
 
 		 447 aa  219  5e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.080069 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2262  HflK protein  39.67 
 
 		 333 aa  219  6e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015812  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0673  HflK protein  37.98 
 
 		 498 aa  219  7e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0664  HflK protein  38.08 
 
 		 395 aa  219  7.999999999999999e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119349  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0164  HflK protein  38.84 
 
 		 347 aa  218  1e-55  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00000564548  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0525  HflK  34.3 
 
 		 389 aa  216  5e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.325556  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1222  hypothetical protein  42.12 
 
 		 447 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0015724  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4940  hflK protein  34.2 
 
 		 395 aa  213  7e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1886  hflK protein  41.98 
 
 		 397 aa  212  7.999999999999999e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1561  HflK protein  41.98 
 
 		 397 aa  212  7.999999999999999e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.920628  hitchhiker  0.00000000145898 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4683  HflK protein  38.12 
 
 		 393 aa  209  7e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0574  HflK  33.85 
 
 		 400 aa  208  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0637  HflK protein  32.1 
 
 		 389 aa  209  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0128609 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2665  heat shock protein HslU  33.25 
 
 		 386 aa  208  1e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.288159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2079  HflK  36.05 
 
 		 457 aa  206  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4892  HflK protein  36.88 
 
 		 405 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.42676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4768  HflK protein  36.88 
 
 		 393 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07560  membrane bound protease regulator HflK  37.85 
 
 		 351 aa  205  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2861  HflK protein  40.74 
 
 		 393 aa  204  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5012  HflK protein  35.89 
 
 		 464 aa  204  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1107  HflK protein  38.41 
 
 		 308 aa  204  2e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0999  HflK protein  38.41 
 
 		 308 aa  204  3e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1066  HflK protein  37.82 
 
 		 477 aa  204  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4944  HflK protein  37.83 
 
 		 393 aa  203  5e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499727 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1158  HflK protein  39.87 
 
 		 475 aa  202  8e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2630  HflK protein  38.67 
 
 		 414 aa  202  8e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.587706  unclonable  0.00000000000633953 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0630  HflK protein  38.85 
 
 		 309 aa  202  9e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5671  protease subunit HflK  33.59 
 
 		 399 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1097  HflK protein  34.69 
 
 		 451 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65280  protease subunit HflK  33.51 
 
 		 400 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1177  HflK protein  34.69 
 
 		 451 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.621922 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2011  HflK protein  36.61 
 
 		 378 aa  200  3e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.166821  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0575  HflK protein  33.64 
 
 		 459 aa  199  6e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.289879  hitchhiker  0.000000000363385 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1431  HflK protein  38.68 
 
 		 471 aa  199  9e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.936066 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0537  HflK protein  35.67 
 
 		 418 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.141396  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0524  protease subunit HflK  34.19 
 
 		 380 aa  197  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0494  HflK protein  34.36 
 
 		 420 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0869387  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1879  HflK protein  34.33 
 
 		 471 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239775  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0548  protease subunit HflK  34.19 
 
 		 380 aa  197  4.0000000000000005e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2775  HflK protein  32.64 
 
 		 407 aa  196  5.000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.631508  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2767  HflK protein  32.55 
 
 		 394 aa  196  7e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.397323  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2300  HflK protein  38.93 
 
 		 464 aa  195  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.194929  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>