More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0673 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010531  Pnec_0673  HflK protein  100 
 
 
498 aa  1016    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1284  HflK protein  81.31 
 
 
503 aa  799    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1158  HflK protein  51.01 
 
 
475 aa  465  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1066  HflK protein  51.01 
 
 
477 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1222  hypothetical protein  51.11 
 
 
447 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0015724  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2079  HflK  51.92 
 
 
457 aa  448  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2099  HflK protein  55.27 
 
 
447 aa  439  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.080069 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1989  hypothetical protein  56.76 
 
 
435 aa  432  1e-120  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.757808  normal  0.0447269 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1879  HflK protein  47.39 
 
 
471 aa  424  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239775  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2601  HflK protein  48.84 
 
 
474 aa  410  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.373557  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2978  HflK  46.26 
 
 
436 aa  404  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.750881  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1177  HflK protein  45.34 
 
 
451 aa  394  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.621922 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1097  HflK protein  45.34 
 
 
451 aa  394  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0603  HflK  53.83 
 
 
395 aa  391  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2861  HflK protein  55.65 
 
 
393 aa  392  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0073  HflK protein  43.4 
 
 
452 aa  386  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.715541  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0445  HflK protein  53.54 
 
 
399 aa  388  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.713082  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5012  HflK protein  44.81 
 
 
464 aa  386  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1431  HflK protein  47.66 
 
 
471 aa  382  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.936066 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3383  HflK protein  42.45 
 
 
433 aa  376  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1601  FtsH protease activity modulator HflK  43.97 
 
 
460 aa  361  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.559516  normal  0.13244 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2534  HflK protein  43.97 
 
 
466 aa  359  6e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0683686  hitchhiker  0.0000321559 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2300  HflK protein  58.8 
 
 
464 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.194929  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1413  HflK protein  43.6 
 
 
465 aa  355  2e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.843638  hitchhiker  0.0000076277 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2194  HflK protein  43.92 
 
 
456 aa  349  6e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0069  ftsH protease activity modulator HflK  44.24 
 
 
449 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.255254  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1827  HflK protein  44.52 
 
 
437 aa  342  8e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1338  ftsH protease activity modulator HflK  44.52 
 
 
437 aa  342  8e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.123813  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2241  ftsH protease activity modulator HflK  44.76 
 
 
445 aa  342  8e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.753349  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1099  HflK protein  44.52 
 
 
437 aa  342  8e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2182  HflK protein  44 
 
 
454 aa  341  2e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2220  HflK protein  44 
 
 
454 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2347  ftsH protease activity modulator HflK  44.29 
 
 
442 aa  339  5e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1587  HflK protein  40.33 
 
 
391 aa  331  2e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  0.000000287062 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1805  HflK protein  40.75 
 
 
462 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.644359  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6274  HflK protein  40.75 
 
 
462 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.321519  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5106  membrane protein, HflK  40.18 
 
 
434 aa  311  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167659  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1743  HflK protein  39.25 
 
 
453 aa  299  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1981  hflK protein  41.34 
 
 
403 aa  298  2e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.245892  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1716  HflK protein  39.48 
 
 
441 aa  296  4e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.40222  normal  0.183963 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1829  HflK protein  40.05 
 
 
436 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.51115  normal  0.182699 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0664  HflK protein  40.32 
 
 
395 aa  288  2e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119349  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0899  HflK protein  42.81 
 
 
393 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0975444  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1942  HflK protein  44.59 
 
 
406 aa  279  9e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2588  HflK-like protein  40.8 
 
 
413 aa  279  9e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0268051  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1470  HflK protein  45.6 
 
 
446 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.407344  normal  0.172273 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1090  HflK protein  39.43 
 
 
405 aa  265  1e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65280  protease subunit HflK  36.96 
 
 
400 aa  264  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5671  protease subunit HflK  37.06 
 
 
399 aa  263  6e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2665  heat shock protein HslU  38.48 
 
 
386 aa  263  8e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.288159  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2630  HflK protein  35.68 
 
 
414 aa  256  6e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.587706  unclonable  0.00000000000633953 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4683  HflK protein  36.81 
 
 
393 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4892  HflK protein  36.54 
 
 
405 aa  253  6e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.42676  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4768  HflK protein  36.54 
 
 
393 aa  253  7e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0575  HflK protein  36.07 
 
 
459 aa  253  7e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.289879  hitchhiker  0.000000000363385 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4944  HflK protein  36.26 
 
 
393 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499727 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0574  HflK  36.08 
 
 
400 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07560  membrane bound protease regulator HflK  41.44 
 
 
351 aa  250  3e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2760  hflK protein  36.31 
 
 
395 aa  250  5e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.467094  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2011  HflK protein  42.45 
 
 
378 aa  249  1e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.166821  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0637  HflK protein  41.9 
 
 
389 aa  249  1e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0128609 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4940  hflK protein  33.1 
 
 
395 aa  248  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2775  HflK protein  34.81 
 
 
407 aa  245  1.9999999999999999e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.631508  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0600  HflK protein  34.43 
 
 
381 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0138092  hitchhiker  0.00143389 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3430  HflK protein  34.43 
 
 
381 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0909026  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3980  HflK protein  38.51 
 
 
382 aa  243  6e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.758687  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0537  HflK protein  32.88 
 
 
418 aa  239  5.999999999999999e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.141396  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0560  HflK protein  34.78 
 
 
379 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000508673  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0525  HflK  38.57 
 
 
389 aa  238  3e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.325556  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0327  HflK protein  35.32 
 
 
382 aa  237  4e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0494  HflK protein  33.96 
 
 
420 aa  236  7e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0869387  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3538  HflK protein  37.24 
 
 
383 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0107822  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3708  HflK protein  34.27 
 
 
379 aa  233  6e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000788714  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3765  HflK protein  34.27 
 
 
379 aa  233  6e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000022736  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3891  HflK protein  34.27 
 
 
379 aa  233  6e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000465537  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3309  HflK protein  33.25 
 
 
386 aa  230  5e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0599  HflK protein  33.78 
 
 
381 aa  229  6e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0263631  hitchhiker  0.00000131875 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0605  hflK protein  35.11 
 
 
381 aa  229  7e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2674  HflK protein  39.6 
 
 
388 aa  229  1e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0162976 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0579  HflK protein  37.21 
 
 
386 aa  228  1e-58  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2279  HflK protein  42.07 
 
 
378 aa  228  2e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2946  HflK protein  40.4 
 
 
359 aa  228  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1573  HflK protein  36.65 
 
 
367 aa  227  3e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000427817  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0487  HflK protein  31.18 
 
 
420 aa  226  5.0000000000000005e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3203  HflK protein  33.6 
 
 
386 aa  226  6e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.143701  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0866  HflK protein  37.67 
 
 
387 aa  226  1e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0134837  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2767  HflK protein  38.78 
 
 
394 aa  224  3e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.397323  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2728  HflK protein  37.92 
 
 
385 aa  224  3e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4168  HflK protein  37.54 
 
 
379 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000320742  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3278  HflK protein  32.66 
 
 
380 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010392  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4724  FtsH protease regulator HflK  36.99 
 
 
419 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4005  HflK protein  38.77 
 
 
383 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.906349  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4781  FtsH protease regulator HflK  36.99 
 
 
419 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.932984  normal  0.393456 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0357  FtsH protease regulator HflK  36.3 
 
 
421 aa  221  1.9999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398708  hitchhiker  0.00429034 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4631  FtsH protease regulator HflK  36.99 
 
 
419 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.130009  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1730  HflK protein  37.86 
 
 
389 aa  221  3e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000348315 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2458  HflK protein  38.59 
 
 
398 aa  221  3e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0761893 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4641  FtsH protease regulator HflK  36.99 
 
 
419 aa  221  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.641221  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0604  HflK protein  38.69 
 
 
368 aa  220  6e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0450848 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4760  FtsH protease regulator HflK  36.64 
 
 
419 aa  219  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>