More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1587 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_1587  HflK protein  100 
 
 
391 aa  798    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  0.000000287062 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0603  HflK  58.68 
 
 
395 aa  448  1e-125  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0445  HflK protein  57.71 
 
 
399 aa  442  1e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.713082  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2978  HflK  56.06 
 
 
436 aa  424  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.750881  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3383  HflK protein  59.62 
 
 
433 aa  410  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0673  HflK protein  41.55 
 
 
498 aa  363  2e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1989  hypothetical protein  51.41 
 
 
435 aa  359  4e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.757808  normal  0.0447269 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1284  HflK protein  40.73 
 
 
503 aa  358  9.999999999999999e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1066  HflK protein  45.33 
 
 
477 aa  347  3e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1158  HflK protein  45.31 
 
 
475 aa  344  1e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1222  hypothetical protein  45.93 
 
 
447 aa  342  9e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0015724  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1879  HflK protein  44.24 
 
 
471 aa  341  1e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239775  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2099  HflK protein  45.02 
 
 
447 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.080069 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1981  hflK protein  51.4 
 
 
403 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.245892  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2194  HflK protein  46.68 
 
 
456 aa  333  3e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0073  HflK protein  45.7 
 
 
452 aa  333  3e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.715541  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2601  HflK protein  42.79 
 
 
474 aa  332  6e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.373557  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2079  HflK  46.27 
 
 
457 aa  331  1e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0664  HflK protein  43.8 
 
 
395 aa  322  8e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119349  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2861  HflK protein  48.99 
 
 
393 aa  320  1.9999999999999998e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2300  HflK protein  47.91 
 
 
464 aa  319  6e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.194929  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5012  HflK protein  45.81 
 
 
464 aa  318  1e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2588  HflK-like protein  47.35 
 
 
413 aa  318  1e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0268051  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1431  HflK protein  47.34 
 
 
471 aa  318  1e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.936066 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1177  HflK protein  45.92 
 
 
451 aa  316  5e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.621922 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1097  HflK protein  45.92 
 
 
451 aa  316  5e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1090  HflK protein  45.22 
 
 
405 aa  308  8e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1942  HflK protein  46.27 
 
 
406 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0899  HflK protein  48 
 
 
393 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0975444  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0575  HflK protein  38.7 
 
 
459 aa  289  6e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.289879  hitchhiker  0.000000000363385 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1413  HflK protein  37.44 
 
 
465 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.843638  hitchhiker  0.0000076277 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2665  heat shock protein HslU  43.99 
 
 
386 aa  270  4e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.288159  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2011  HflK protein  39.44 
 
 
378 aa  268  8e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.166821  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2534  HflK protein  39.78 
 
 
466 aa  268  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0683686  hitchhiker  0.0000321559 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1601  FtsH protease activity modulator HflK  39.24 
 
 
460 aa  264  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.559516  normal  0.13244 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2775  HflK protein  38.87 
 
 
407 aa  263  3e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.631508  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3430  HflK protein  39.78 
 
 
381 aa  259  8e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0909026  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0600  HflK protein  39.78 
 
 
381 aa  258  9e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0138092  hitchhiker  0.00143389 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2347  ftsH protease activity modulator HflK  41.14 
 
 
442 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2182  HflK protein  41.14 
 
 
454 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2220  HflK protein  41.14 
 
 
454 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2241  ftsH protease activity modulator HflK  41.37 
 
 
445 aa  258  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.753349  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65280  protease subunit HflK  40 
 
 
400 aa  257  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1827  HflK protein  41.3 
 
 
437 aa  256  5e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1099  HflK protein  41.3 
 
 
437 aa  256  5e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1338  ftsH protease activity modulator HflK  41.3 
 
 
437 aa  256  5e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.123813  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0069  ftsH protease activity modulator HflK  41.3 
 
 
449 aa  256  5e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.255254  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2203  HflK  40.28 
 
 
407 aa  256  5e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002261  HflK protein  38.89 
 
 
401 aa  256  5e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0330443  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5671  protease subunit HflK  40.11 
 
 
399 aa  255  7e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0494  HflK protein  39.78 
 
 
420 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0869387  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1573  HflK protein  40.49 
 
 
367 aa  255  1.0000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000427817  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2760  hflK protein  39.49 
 
 
395 aa  254  2.0000000000000002e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.467094  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0637  HflK protein  40.66 
 
 
389 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0128609 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0560  HflK protein  38.52 
 
 
379 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000508673  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3278  HflK protein  39.19 
 
 
380 aa  253  3e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010392  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0599  HflK protein  40.33 
 
 
381 aa  253  3e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0263631  hitchhiker  0.00000131875 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4683  HflK protein  38.48 
 
 
393 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00092  serine protease  39.65 
 
 
401 aa  252  7e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3765  HflK protein  38.01 
 
 
379 aa  252  8.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000022736  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3891  HflK protein  38.01 
 
 
379 aa  252  8.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000465537  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3708  HflK protein  38.01 
 
 
379 aa  252  8.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000788714  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0605  hflK protein  39.94 
 
 
381 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4940  hflK protein  37.16 
 
 
395 aa  252  9.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0537  HflK protein  39.94 
 
 
418 aa  252  9.000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.141396  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0525  HflK  38.25 
 
 
389 aa  251  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.325556  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2630  HflK protein  41.74 
 
 
414 aa  251  2e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.587706  unclonable  0.00000000000633953 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3023  hflK protein  38.6 
 
 
377 aa  249  8e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000561401  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5106  membrane protein, HflK  38.44 
 
 
434 aa  247  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167659  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2728  HflK protein  40.79 
 
 
385 aa  246  6e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0574  HflK  37.97 
 
 
400 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1664  HflK protein  40.49 
 
 
385 aa  244  9.999999999999999e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0486  HflK protein  43.69 
 
 
361 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.333714 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4944  HflK protein  38.11 
 
 
393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499727 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00651  HflK complex with HflC  40.52 
 
 
383 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.763897  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3309  HflK protein  37.66 
 
 
386 aa  243  3e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4892  HflK protein  37.17 
 
 
405 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.42676  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4768  HflK protein  36.76 
 
 
393 aa  243  5e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0579  HflK protein  38.55 
 
 
386 aa  242  7e-63  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6274  HflK protein  40.4 
 
 
462 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.321519  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1805  HflK protein  40.4 
 
 
462 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.644359  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07560  membrane bound protease regulator HflK  41.12 
 
 
351 aa  241  2e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4168  HflK protein  41.32 
 
 
379 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000320742  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4005  HflK protein  40.11 
 
 
383 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.906349  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3203  HflK protein  38.63 
 
 
386 aa  239  5e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.143701  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2349  HflK  38.87 
 
 
382 aa  237  2e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3262  HflK protein  39.56 
 
 
383 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.264682  normal  0.260183 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0568  HflK protein  37.28 
 
 
380 aa  237  2e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0118849  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3980  HflK protein  40.67 
 
 
382 aa  237  2e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.758687  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2946  HflK protein  42.36 
 
 
359 aa  236  4e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3538  HflK protein  36.95 
 
 
383 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0107822  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0799  HflK protein  38.58 
 
 
381 aa  236  8e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223678  hitchhiker  0.00931868 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2038  HflK protein  40.7 
 
 
390 aa  234  3e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal  0.793303 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3352  HflK protein  39.83 
 
 
389 aa  233  5e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.154635 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3917  FtsH protease regulator HflK  38.67 
 
 
415 aa  232  8.000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.357327  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3719  FtsH protease regulator HflK  39.6 
 
 
420 aa  231  1e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0503077  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1886  hflK protein  37.7 
 
 
397 aa  231  2e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1561  HflK protein  37.7 
 
 
397 aa  231  2e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.920628  hitchhiker  0.00000000145898 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2279  HflK protein  42.66 
 
 
378 aa  230  3e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2674  HflK protein  41.64 
 
 
388 aa  230  3e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0162976 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>