More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2588 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2588  HflK-like protein  100 
 
 		 413 aa  837    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0268051  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1981  hflK protein  58.06 
 
 		 403 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.245892  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1090  HflK protein  52.39 
 
 		 405 aa  374  1e-102  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0603  HflK  50.13 
 
 		 395 aa  365  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0899  HflK protein  50.67 
 
 		 393 aa  332  6e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0975444  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0664  HflK protein  49.19 
 
 		 395 aa  332  8e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119349  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0445  HflK protein  48.47 
 
 		 399 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.713082  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1942  HflK protein  48.92 
 
 		 406 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3383  HflK protein  48.83 
 
 		 433 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0575  HflK protein  46.65 
 
 		 459 aa  320  3e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.289879  hitchhiker  0.000000000363385 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1284  HflK protein  41.16 
 
 		 503 aa  315  9e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1587  HflK protein  52.41 
 
 		 391 aa  308  8e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000287062 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0560  HflK protein  43.44 
 
 		 379 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000508673  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2978  HflK  47.37 
 
 		 436 aa  306  5.0000000000000004e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.750881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2665  heat shock protein HslU  45.61 
 
 		 386 aa  306  5.0000000000000004e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.288159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3430  HflK protein  42.55 
 
 		 381 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0909026  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0600  HflK protein  42.55 
 
 		 381 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0138092  hitchhiker  0.00143389 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0327  HflK protein  45.84 
 
 		 382 aa  301  2e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0673  HflK protein  41.27 
 
 		 498 aa  299  6e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3278  HflK protein  42.48 
 
 		 380 aa  297  2e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010392  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3891  HflK protein  42.96 
 
 		 379 aa  296  4e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000465537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3765  HflK protein  42.96 
 
 		 379 aa  296  4e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000022736  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3708  HflK protein  42.96 
 
 		 379 aa  296  4e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000788714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2630  HflK protein  44.39 
 
 		 414 aa  296  5e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.587706  unclonable  0.00000000000633953 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1989  hypothetical protein  45.6 
 
 		 435 aa  294  2e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.757808  normal  0.0447269 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65280  protease subunit HflK  44.3 
 
 		 400 aa  294  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2775  HflK protein  43.22 
 
 		 407 aa  293  4e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.631508  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0599  HflK protein  42.24 
 
 		 381 aa  292  6e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0263631  hitchhiker  0.00000131875 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2011  HflK protein  44.19 
 
 		 378 aa  291  1e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.166821  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0605  hflK protein  43.94 
 
 		 381 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3203  HflK protein  43.97 
 
 		 386 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.143701  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2099  HflK protein  43.2 
 
 		 447 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.080069 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3309  HflK protein  40 
 
 		 386 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0494  HflK protein  41.27 
 
 		 420 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0869387  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0537  HflK protein  42.97 
 
 		 418 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.141396  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0073  HflK protein  43.56 
 
 		 452 aa  283  5.000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.715541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0799  HflK protein  44.62 
 
 		 381 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223678  hitchhiker  0.00931868 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1222  hypothetical protein  46.69 
 
 		 447 aa  281  1e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0015724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5671  protease subunit HflK  44.3 
 
 		 399 aa  281  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1879  HflK protein  41.25 
 
 		 471 aa  281  2e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2760  hflK protein  42.62 
 
 		 395 aa  281  2e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.467094  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1066  HflK protein  43.86 
 
 		 477 aa  280  3e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0574  HflK  44.53 
 
 		 400 aa  278  9e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4892  HflK protein  44.56 
 
 		 405 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.42676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4683  HflK protein  44.39 
 
 		 393 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4940  hflK protein  44.39 
 
 		 395 aa  278  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4768  HflK protein  44.56 
 
 		 393 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2601  HflK protein  41.87 
 
 		 474 aa  277  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.373557  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0568  HflK protein  42.59 
 
 		 380 aa  277  3e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0118849  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1158  HflK protein  46.26 
 
 		 475 aa  277  3e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4168  HflK protein  43.57 
 
 		 379 aa  276  4e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000320742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1097  HflK protein  43.89 
 
 		 451 aa  276  4e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1177  HflK protein  43.89 
 
 		 451 aa  276  4e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.621922 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4944  HflK protein  44.2 
 
 		 393 aa  276  6e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499727 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00092  serine protease  43.4 
 
 		 401 aa  275  8e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2079  HflK  41.67 
 
 		 457 aa  275  9e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1413  HflK protein  41.73 
 
 		 465 aa  275  9e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.843638  hitchhiker  0.0000076277 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002261  HflK protein  43.53 
 
 		 401 aa  275  1.0000000000000001e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0330443  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0487  HflK protein  40.69 
 
 		 420 aa  275  1.0000000000000001e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2767  HflK protein  45.95 
 
 		 394 aa  275  1.0000000000000001e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.397323  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0525  HflK  43.82 
 
 		 389 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.325556  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5012  HflK protein  43.22 
 
 		 464 aa  273  6e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3023  hflK protein  42.97 
 
 		 377 aa  272  6e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000561401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00651  HflK complex with HflC  44.72 
 
 		 383 aa  272  7e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.763897  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1431  HflK protein  43.77 
 
 		 471 aa  271  1e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.936066 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1573  HflK protein  43.19 
 
 		 367 aa  271  2e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000427817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0357  FtsH protease regulator HflK  41.72 
 
 		 421 aa  270  2.9999999999999997e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398708  hitchhiker  0.00429034 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2300  HflK protein  42.04 
 
 		 464 aa  269  5e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.194929  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3538  HflK protein  42.28 
 
 		 383 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0107822  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3236  HflK protein  41.29 
 
 		 390 aa  269  5.9999999999999995e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0144208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0637  HflK protein  44.09 
 
 		 389 aa  268  1e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0128609 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0486  HflK protein  45.51 
 
 		 361 aa  268  2e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.333714 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3980  HflK protein  44.72 
 
 		 382 aa  268  2e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.758687  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2946  HflK protein  47.74 
 
 		 359 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2194  HflK protein  42.78 
 
 		 456 aa  266  5.999999999999999e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1601  FtsH protease activity modulator HflK  42.55 
 
 		 460 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.559516  normal  0.13244 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0579  HflK protein  36.9 
 
 		 386 aa  262  8e-69  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4005  HflK protein  40.83 
 
 		 383 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.906349  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0548  protease subunit HflK  40.31 
 
 		 380 aa  259  4e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2203  HflK  43.53 
 
 		 407 aa  259  4e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2674  HflK protein  46 
 
 		 388 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0162976 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3719  FtsH protease regulator HflK  41.04 
 
 		 420 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0503077  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0524  protease subunit HflK  43.02 
 
 		 380 aa  259  7e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2534  HflK protein  41.73 
 
 		 466 aa  258  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0683686  hitchhiker  0.0000321559 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2728  HflK protein  39.58 
 
 		 385 aa  258  2e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0263  HflK protein  44.74 
 
 		 360 aa  257  3e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4645  FtsH protease regulator HflK  44.3 
 
 		 419 aa  256  5e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.14387 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2279  HflK protein  46.39 
 
 		 378 aa  255  9e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2861  HflK protein  44.2 
 
 		 393 aa  255  1.0000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3917  FtsH protease regulator HflK  39.91 
 
 		 415 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.357327  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04041  modulator for HflB protease specific for phage lambda cII repressor  44.04 
 
 		 419 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.298849  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5690  FtsH protease regulator HflK  44.04 
 
 		 419 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.440871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4705  FtsH protease regulator HflK  44.04 
 
 		 419 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.714132  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04003  hypothetical protein  44.04 
 
 		 419 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.317629  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3839  FtsH protease regulator HflK  44.04 
 
 		 419 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.910091  hitchhiker  0.000000232279 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4416  FtsH protease regulator HflK  44.04 
 
 		 419 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.953832  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4641  FtsH protease regulator HflK  41.36 
 
 		 419 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.641221  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4732  FtsH protease regulator HflK  44.04 
 
 		 419 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.938149  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4760  FtsH protease regulator HflK  41.36 
 
 		 419 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2458  HflK protein  45.74 
 
 		 398 aa  253  4.0000000000000004e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0761893 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>