More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2534 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2534  HflK protein  100 
 
 
466 aa  938    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0683686  hitchhiker  0.0000321559 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1413  HflK protein  74.09 
 
 
465 aa  647    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.843638  hitchhiker  0.0000076277 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1601  FtsH protease activity modulator HflK  91.63 
 
 
460 aa  764    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.559516  normal  0.13244 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2182  HflK protein  64.16 
 
 
454 aa  536  1e-151  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0069  ftsH protease activity modulator HflK  69.33 
 
 
449 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.255254  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6274  HflK protein  63.11 
 
 
462 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.321519  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2220  HflK protein  64.38 
 
 
454 aa  537  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1805  HflK protein  63.11 
 
 
462 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.644359  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2241  ftsH protease activity modulator HflK  64.32 
 
 
445 aa  525  1e-148  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.753349  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1743  HflK protein  61.83 
 
 
453 aa  521  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5106  membrane protein, HflK  62.14 
 
 
434 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167659  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1338  ftsH protease activity modulator HflK  68.88 
 
 
437 aa  513  1e-144  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.123813  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2347  ftsH protease activity modulator HflK  63.88 
 
 
442 aa  514  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1827  HflK protein  68.88 
 
 
437 aa  513  1e-144  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1099  HflK protein  68.88 
 
 
437 aa  513  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1716  HflK protein  61.93 
 
 
441 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.40222  normal  0.183963 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1829  HflK protein  61.71 
 
 
436 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.51115  normal  0.182699 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1470  HflK protein  61.41 
 
 
446 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.407344  normal  0.172273 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1158  HflK protein  46.62 
 
 
475 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1066  HflK protein  44.61 
 
 
477 aa  388  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1222  hypothetical protein  46.74 
 
 
447 aa  381  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0015724  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1284  HflK protein  44.02 
 
 
503 aa  378  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2099  HflK protein  46.94 
 
 
447 aa  377  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.080069 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0673  HflK protein  40.92 
 
 
498 aa  373  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5012  HflK protein  44.08 
 
 
464 aa  365  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1989  hypothetical protein  50.14 
 
 
435 aa  359  5e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.757808  normal  0.0447269 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1879  HflK protein  42.12 
 
 
471 aa  356  5e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239775  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2079  HflK  42.26 
 
 
457 aa  354  2e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2601  HflK protein  44.72 
 
 
474 aa  354  2e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.373557  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1097  HflK protein  43.88 
 
 
451 aa  351  1e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1177  HflK protein  43.88 
 
 
451 aa  351  1e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.621922 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0073  HflK protein  41.2 
 
 
452 aa  350  3e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.715541  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2300  HflK protein  46.3 
 
 
464 aa  345  7e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.194929  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1431  HflK protein  46.19 
 
 
471 aa  344  2e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.936066 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0445  HflK protein  42.51 
 
 
399 aa  338  1.9999999999999998e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.713082  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2978  HflK  43.76 
 
 
436 aa  336  5.999999999999999e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.750881  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2861  HflK protein  48.55 
 
 
393 aa  326  5e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0603  HflK  45.11 
 
 
395 aa  320  3e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3383  HflK protein  43.83 
 
 
433 aa  320  3e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2194  HflK protein  40.85 
 
 
456 aa  317  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1981  hflK protein  38.71 
 
 
403 aa  264  3e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.245892  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1090  HflK protein  37.87 
 
 
405 aa  262  8e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1587  HflK protein  35.35 
 
 
391 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  0.000000287062 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2588  HflK-like protein  41.46 
 
 
413 aa  249  7e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0268051  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0899  HflK protein  40.12 
 
 
393 aa  248  1e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0975444  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0664  HflK protein  36.41 
 
 
395 aa  235  1.0000000000000001e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119349  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2630  HflK protein  35.68 
 
 
414 aa  235  2.0000000000000002e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.587706  unclonable  0.00000000000633953 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2665  heat shock protein HslU  35.49 
 
 
386 aa  230  3e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.288159  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0494  HflK protein  33.16 
 
 
420 aa  230  5e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0869387  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4940  hflK protein  34.4 
 
 
395 aa  229  8e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0574  HflK  33.91 
 
 
400 aa  228  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4683  HflK protein  37.97 
 
 
393 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4892  HflK protein  36.39 
 
 
405 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.42676  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2775  HflK protein  37.46 
 
 
407 aa  227  3e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.631508  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1942  HflK protein  35.55 
 
 
406 aa  226  8e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4768  HflK protein  37.39 
 
 
393 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65280  protease subunit HflK  34.86 
 
 
400 aa  224  3e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4944  HflK protein  37.91 
 
 
393 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499727 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0560  HflK protein  33.7 
 
 
379 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000508673  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0537  HflK protein  32.24 
 
 
418 aa  222  9.999999999999999e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.141396  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0525  HflK  34.77 
 
 
389 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.325556  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3430  HflK protein  31.5 
 
 
381 aa  220  5e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0909026  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2760  hflK protein  37.09 
 
 
395 aa  219  6e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.467094  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5671  protease subunit HflK  36.5 
 
 
399 aa  219  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0600  HflK protein  31.25 
 
 
381 aa  218  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0138092  hitchhiker  0.00143389 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3708  HflK protein  33.15 
 
 
379 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000788714  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3765  HflK protein  33.15 
 
 
379 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000022736  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3891  HflK protein  33.15 
 
 
379 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000465537  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0487  HflK protein  31.19 
 
 
420 aa  217  2.9999999999999998e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00651  HflK complex with HflC  32.36 
 
 
383 aa  216  5e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.763897  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0575  HflK protein  33.07 
 
 
459 aa  215  9.999999999999999e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.289879  hitchhiker  0.000000000363385 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0637  HflK protein  35.26 
 
 
389 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0128609 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07560  membrane bound protease regulator HflK  36.14 
 
 
351 aa  211  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2011  HflK protein  36.62 
 
 
378 aa  211  2e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.166821  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002261  HflK protein  35.33 
 
 
401 aa  211  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0330443  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3278  HflK protein  32.6 
 
 
380 aa  210  3e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010392  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1573  HflK protein  34.81 
 
 
367 aa  210  5e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000427817  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0599  HflK protein  30.33 
 
 
381 aa  209  7e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0263631  hitchhiker  0.00000131875 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3203  HflK protein  30.43 
 
 
386 aa  209  8e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.143701  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00092  serine protease  35.91 
 
 
401 aa  209  9e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3309  HflK protein  32.01 
 
 
386 aa  208  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0327  HflK protein  30.88 
 
 
382 aa  208  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0605  hflK protein  30.68 
 
 
381 aa  208  2e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4168  HflK protein  32.45 
 
 
379 aa  207  4e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000320742  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0579  HflK protein  32.42 
 
 
386 aa  206  9e-52  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0568  HflK protein  32.1 
 
 
380 aa  204  2e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0118849  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0799  HflK protein  32.17 
 
 
381 aa  201  3e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223678  hitchhiker  0.00931868 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3980  HflK protein  31.77 
 
 
382 aa  201  3e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.758687  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1749  HflK protein  36.52 
 
 
376 aa  200  5e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.254466  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1561  HflK protein  35.26 
 
 
397 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.920628  hitchhiker  0.00000000145898 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1886  hflK protein  35.26 
 
 
397 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1397  hflK protein  34.19 
 
 
382 aa  195  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2946  HflK protein  38.81 
 
 
359 aa  195  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1353  band 7 protein:stomatin  34.19 
 
 
384 aa  195  2e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.792313  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3538  HflK protein  29.66 
 
 
383 aa  194  3e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0107822  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0263  HflK protein  35.53 
 
 
360 aa  194  4e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0357  FtsH protease regulator HflK  31.04 
 
 
421 aa  192  7e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398708  hitchhiker  0.00429034 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3236  HflK protein  31.69 
 
 
390 aa  192  1e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0144208  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3719  FtsH protease regulator HflK  32.17 
 
 
420 aa  192  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0503077  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4724  FtsH protease regulator HflK  32.1 
 
 
419 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>