More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1829 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A5106  membrane protein, HflK  94.04 
 
 
434 aa  730    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167659  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1829  HflK protein  100 
 
 
436 aa  871    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.51115  normal  0.182699 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6274  HflK protein  95.78 
 
 
462 aa  744    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.321519  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1716  HflK protein  91.18 
 
 
441 aa  692    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.40222  normal  0.183963 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1743  HflK protein  90.5 
 
 
453 aa  686    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1805  HflK protein  95.78 
 
 
462 aa  744    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.644359  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1470  HflK protein  87.84 
 
 
446 aa  624  1e-177  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.407344  normal  0.172273 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2241  ftsH protease activity modulator HflK  72.22 
 
 
445 aa  566  1e-160  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.753349  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0069  ftsH protease activity modulator HflK  72.85 
 
 
449 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.255254  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1338  ftsH protease activity modulator HflK  72.85 
 
 
437 aa  559  1e-158  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.123813  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1827  HflK protein  72.85 
 
 
437 aa  559  1e-158  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2347  ftsH protease activity modulator HflK  72.04 
 
 
442 aa  559  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1099  HflK protein  72.85 
 
 
437 aa  559  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2220  HflK protein  72.04 
 
 
454 aa  558  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2182  HflK protein  71.81 
 
 
454 aa  557  1e-157  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1601  FtsH protease activity modulator HflK  63.86 
 
 
460 aa  548  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.559516  normal  0.13244 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2534  HflK protein  61.49 
 
 
466 aa  531  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0683686  hitchhiker  0.0000321559 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1413  HflK protein  61.57 
 
 
465 aa  530  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.843638  hitchhiker  0.0000076277 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1066  HflK protein  46.78 
 
 
477 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1158  HflK protein  47.77 
 
 
475 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1222  hypothetical protein  47.43 
 
 
447 aa  367  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0015724  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1879  HflK protein  43.1 
 
 
471 aa  365  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239775  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2099  HflK protein  43.97 
 
 
447 aa  363  4e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.080069 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0073  HflK protein  42.24 
 
 
452 aa  362  8e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.715541  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5012  HflK protein  42.96 
 
 
464 aa  354  2e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1097  HflK protein  43.9 
 
 
451 aa  351  2e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1177  HflK protein  43.9 
 
 
451 aa  351  2e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.621922 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1989  hypothetical protein  47.99 
 
 
435 aa  342  7e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.757808  normal  0.0447269 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2079  HflK  43.05 
 
 
457 aa  342  8e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2601  HflK protein  42.26 
 
 
474 aa  340  2.9999999999999998e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.373557  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0673  HflK protein  38.98 
 
 
498 aa  339  5e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1431  HflK protein  43.21 
 
 
471 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.936066 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2300  HflK protein  44.09 
 
 
464 aa  335  7e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.194929  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1284  HflK protein  39.47 
 
 
503 aa  335  1e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2861  HflK protein  44.12 
 
 
393 aa  320  3e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2978  HflK  43.64 
 
 
436 aa  319  6e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.750881  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2194  HflK protein  39.91 
 
 
456 aa  315  8e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0445  HflK protein  40.27 
 
 
399 aa  315  9.999999999999999e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.713082  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3383  HflK protein  40 
 
 
433 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0603  HflK  40.26 
 
 
395 aa  299  6e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1981  hflK protein  38.57 
 
 
403 aa  259  6e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.245892  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1587  HflK protein  36.6 
 
 
391 aa  252  9.000000000000001e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  0.000000287062 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1090  HflK protein  36.59 
 
 
405 aa  248  2e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2665  heat shock protein HslU  37.18 
 
 
386 aa  240  4e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.288159  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0574  HflK  37.36 
 
 
400 aa  236  9e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4940  hflK protein  36.93 
 
 
395 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0664  HflK protein  36.64 
 
 
395 aa  234  3e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119349  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4892  HflK protein  39.02 
 
 
405 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.42676  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4768  HflK protein  39.02 
 
 
393 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2588  HflK-like protein  39.57 
 
 
413 aa  233  7.000000000000001e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0268051  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4683  HflK protein  38.73 
 
 
393 aa  232  9e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0899  HflK protein  38.92 
 
 
393 aa  231  2e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0975444  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4944  HflK protein  38.99 
 
 
393 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499727 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0560  HflK protein  34.01 
 
 
379 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000508673  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0637  HflK protein  37.87 
 
 
389 aa  224  3e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0128609 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0525  HflK  36.34 
 
 
389 aa  224  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.325556  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3765  HflK protein  33.33 
 
 
379 aa  224  3e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000022736  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3891  HflK protein  33.33 
 
 
379 aa  224  3e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000465537  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3708  HflK protein  33.33 
 
 
379 aa  224  3e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000788714  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65280  protease subunit HflK  37.32 
 
 
400 aa  224  3e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2630  HflK protein  36.21 
 
 
414 aa  223  7e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.587706  unclonable  0.00000000000633953 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5671  protease subunit HflK  37.17 
 
 
399 aa  221  3e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2775  HflK protein  35.14 
 
 
407 aa  219  8.999999999999998e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.631508  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0600  HflK protein  33.24 
 
 
381 aa  216  5e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0138092  hitchhiker  0.00143389 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0575  HflK protein  31.76 
 
 
459 aa  216  7e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.289879  hitchhiker  0.000000000363385 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0605  hflK protein  31.75 
 
 
381 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0494  HflK protein  32.22 
 
 
420 aa  215  9.999999999999999e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0869387  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3430  HflK protein  31.3 
 
 
381 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0909026  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1942  HflK protein  35.18 
 
 
406 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0487  HflK protein  29.44 
 
 
420 aa  213  5.999999999999999e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0327  HflK protein  31.73 
 
 
382 aa  212  1e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3278  HflK protein  33.16 
 
 
380 aa  211  2e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010392  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0599  HflK protein  32.96 
 
 
381 aa  211  3e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0263631  hitchhiker  0.00000131875 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0537  HflK protein  31.5 
 
 
418 aa  207  4e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.141396  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1886  hflK protein  36.53 
 
 
397 aa  206  5e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1561  HflK protein  36.53 
 
 
397 aa  206  5e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.920628  hitchhiker  0.00000000145898 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3309  HflK protein  32.34 
 
 
386 aa  206  5e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3203  HflK protein  33.51 
 
 
386 aa  205  1e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.143701  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07560  membrane bound protease regulator HflK  37.74 
 
 
351 aa  205  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002261  HflK protein  34.7 
 
 
401 aa  204  3e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0330443  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2458  HflK protein  35.43 
 
 
398 aa  204  4e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0761893 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00092  serine protease  34.99 
 
 
401 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00651  HflK complex with HflC  31.09 
 
 
383 aa  200  3.9999999999999996e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.763897  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2760  hflK protein  33.82 
 
 
395 aa  199  9e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.467094  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0831  hflK protein  35.15 
 
 
344 aa  197  3e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.604081  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0486  HflK protein  36.08 
 
 
361 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.333714 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0568  HflK protein  33.24 
 
 
380 aa  196  6e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0118849  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1353  band 7 protein:stomatin  34.17 
 
 
384 aa  196  8.000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.792313  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3538  HflK protein  31.81 
 
 
383 aa  196  1e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0107822  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2946  HflK protein  38.81 
 
 
359 aa  195  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1397  hflK protein  33.89 
 
 
382 aa  194  2e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4005  HflK protein  33.24 
 
 
383 aa  193  4e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.906349  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3980  HflK protein  31.64 
 
 
382 aa  193  6e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.758687  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0799  HflK protein  32.43 
 
 
381 aa  192  7e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223678  hitchhiker  0.00931868 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4168  HflK protein  32.52 
 
 
379 aa  192  9e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000320742  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1573  HflK protein  34.4 
 
 
367 aa  191  1e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000427817  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2728  HflK protein  31.96 
 
 
385 aa  192  1e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0263  HflK protein  34.54 
 
 
360 aa  191  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2780  HflK protein  32.01 
 
 
379 aa  190  4e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.224376 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2203  HflK  31.43 
 
 
407 aa  190  4e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>