More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0525 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0525  HflK  100 
 
 		 389 aa  797    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.325556  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4940  hflK protein  82.91 
 
 		 395 aa  629  1e-179  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0574  HflK  82.84 
 
 		 400 aa  618  1e-176  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4892  HflK protein  81.79 
 
 		 405 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.42676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4768  HflK protein  81.35 
 
 		 393 aa  581  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4683  HflK protein  82.19 
 
 		 393 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0637  HflK protein  78.57 
 
 		 389 aa  578  1e-164  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0128609 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4944  HflK protein  83.75 
 
 		 393 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499727 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65280  protease subunit HflK  79.27 
 
 		 400 aa  556  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5671  protease subunit HflK  78.09 
 
 		 399 aa  546  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07560  membrane bound protease regulator HflK  77.26 
 
 		 351 aa  498  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2630  HflK protein  49.04 
 
 		 414 aa  357  1.9999999999999998e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.587706  unclonable  0.00000000000633953 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2665  heat shock protein HslU  49.06 
 
 		 386 aa  347  2e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.288159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2767  HflK protein  49.86 
 
 		 394 aa  325  1e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.397323  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1981  hflK protein  43.43 
 
 		 403 aa  310  2e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.245892  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2775  HflK protein  46.21 
 
 		 407 aa  304  2.0000000000000002e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.631508  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0494  HflK protein  45.5 
 
 		 420 aa  302  6.000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0869387  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0537  HflK protein  44.42 
 
 		 418 aa  300  2e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.141396  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1090  HflK protein  42.89 
 
 		 405 aa  296  5e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0560  HflK protein  44.54 
 
 		 379 aa  294  2e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000508673  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0603  HflK  43.92 
 
 		 395 aa  290  3e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3708  HflK protein  43.98 
 
 		 379 aa  289  7e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000788714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3891  HflK protein  43.98 
 
 		 379 aa  289  7e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000465537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3765  HflK protein  43.98 
 
 		 379 aa  289  7e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000022736  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0899  HflK protein  43.22 
 
 		 393 aa  288  1e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0975444  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3203  HflK protein  44.82 
 
 		 386 aa  288  1e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.143701  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3023  hflK protein  45.51 
 
 		 377 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000561401  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0548  protease subunit HflK  45.65 
 
 		 380 aa  286  5e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0524  protease subunit HflK  45.65 
 
 		 380 aa  286  5e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0600  HflK protein  44.07 
 
 		 381 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0138092  hitchhiker  0.00143389 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3430  HflK protein  44.07 
 
 		 381 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0909026  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0599  HflK protein  42.09 
 
 		 381 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0263631  hitchhiker  0.00000131875 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3278  HflK protein  43.98 
 
 		 380 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010392  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1942  HflK protein  43.44 
 
 		 406 aa  282  7.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0579  HflK protein  43.38 
 
 		 386 aa  281  1e-74  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1279  HflK protein  43.58 
 
 		 452 aa  280  2e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.583527  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0605  hflK protein  41.22 
 
 		 381 aa  280  3e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0799  HflK protein  43.94 
 
 		 381 aa  279  5e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223678  hitchhiker  0.00931868 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3980  HflK protein  42.98 
 
 		 382 aa  277  2e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.758687  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4168  HflK protein  44.13 
 
 		 379 aa  276  5e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000320742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00651  HflK complex with HflC  40.16 
 
 		 383 aa  276  5e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.763897  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3383  HflK protein  43.09 
 
 		 433 aa  276  5e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0327  HflK protein  40.32 
 
 		 382 aa  276  6e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3538  HflK protein  42.86 
 
 		 383 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0107822  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3309  HflK protein  42.37 
 
 		 386 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0664  HflK protein  41.28 
 
 		 395 aa  273  5.000000000000001e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119349  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00092  serine protease  44.97 
 
 		 401 aa  272  6e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2760  hflK protein  44.94 
 
 		 395 aa  271  2e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.467094  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0357  FtsH protease regulator HflK  42.25 
 
 		 421 aa  270  2e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398708  hitchhiker  0.00429034 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4724  FtsH protease regulator HflK  42.67 
 
 		 419 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4781  FtsH protease regulator HflK  42.67 
 
 		 419 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.932984  normal  0.393456 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4641  FtsH protease regulator HflK  42.67 
 
 		 419 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.641221  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4631  FtsH protease regulator HflK  42.67 
 
 		 419 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.130009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0568  HflK protein  44.03 
 
 		 380 aa  270  4e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0118849  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002261  HflK protein  44.13 
 
 		 401 aa  270  4e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0330443  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04041  modulator for HflB protease specific for phage lambda cII repressor  44.62 
 
 		 419 aa  269  5e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.298849  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4416  FtsH protease regulator HflK  44.62 
 
 		 419 aa  269  5e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.953832  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04003  hypothetical protein  44.62 
 
 		 419 aa  269  5e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.317629  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5690  FtsH protease regulator HflK  44.62 
 
 		 419 aa  269  5e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.440871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3839  FtsH protease regulator HflK  44.62 
 
 		 419 aa  269  5e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.910091  hitchhiker  0.000000232279 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4705  FtsH protease regulator HflK  44.62 
 
 		 419 aa  269  5e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.714132  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4732  FtsH protease regulator HflK  44.62 
 
 		 419 aa  269  5e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.938149  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4760  FtsH protease regulator HflK  42.42 
 
 		 419 aa  269  7e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0433  FtsH protease regulator HflK  45.95 
 
 		 419 aa  269  8e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0562883  unclonable  0.0000000348967 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3236  HflK protein  44.54 
 
 		 390 aa  267  2e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0144208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4645  FtsH protease regulator HflK  44.09 
 
 		 419 aa  267  2e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.14387 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3819  HflK protein  44.36 
 
 		 419 aa  266  4e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0613795  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1879  HflK protein  38.1 
 
 		 471 aa  266  4e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239775  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3719  FtsH protease regulator HflK  42.49 
 
 		 420 aa  266  5e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0503077  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2588  HflK-like protein  43.97 
 
 		 413 aa  266  5.999999999999999e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0268051  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0445  HflK protein  39.25 
 
 		 399 aa  264  2e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.713082  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5012  HflK protein  40.54 
 
 		 464 aa  264  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3917  FtsH protease regulator HflK  42.78 
 
 		 415 aa  261  1e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.357327  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1284  HflK protein  34.78 
 
 		 503 aa  259  8e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0487  HflK protein  38.2 
 
 		 420 aa  258  9e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2601  HflK protein  39.61 
 
 		 474 aa  257  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.373557  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2978  HflK  40.62 
 
 		 436 aa  256  3e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.750881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1989  hypothetical protein  40.96 
 
 		 435 aa  256  6e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.757808  normal  0.0447269 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0073  HflK protein  37.11 
 
 		 452 aa  253  3e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.715541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2099  HflK protein  38.93 
 
 		 447 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.080069 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0697  FtsH protease regulator HflK  43.36 
 
 		 419 aa  253  6e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3796  FtsH protease regulator HflK  43.24 
 
 		 420 aa  252  8.000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3651  FtsH protease regulator HflK  43.24 
 
 		 420 aa  252  8.000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1066  HflK protein  37.21 
 
 		 477 aa  251  1e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0673  HflK protein  34.52 
 
 		 498 aa  250  3e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2194  HflK protein  39.5 
 
 		 456 aa  250  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1158  HflK protein  37.2 
 
 		 475 aa  247  3e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1413  HflK protein  38.04 
 
 		 465 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.843638  hitchhiker  0.0000076277 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0575  HflK protein  38.52 
 
 		 459 aa  243  3e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.289879  hitchhiker  0.000000000363385 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1222  hypothetical protein  37.53 
 
 		 447 aa  242  7.999999999999999e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0015724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2300  HflK protein  38.95 
 
 		 464 aa  242  1e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.194929  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2011  HflK protein  39.83 
 
 		 378 aa  239  4e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.166821  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2079  HflK  37.53 
 
 		 457 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1097  HflK protein  37.47 
 
 		 451 aa  238  2e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1177  HflK protein  37.47 
 
 		 451 aa  238  2e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.621922 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1431  HflK protein  38.77 
 
 		 471 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.936066 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4005  HflK protein  34.9 
 
 		 383 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.906349  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1601  FtsH protease activity modulator HflK  36.24 
 
 		 460 aa  233  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.559516  normal  0.13244 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1573  HflK protein  35.34 
 
 		 367 aa  233  4.0000000000000004e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000427817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2861  HflK protein  41.74 
 
 		 393 aa  231  1e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>