More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4645 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_04041  modulator for HflB protease specific for phage lambda cII repressor  99.76 
 
 
419 aa  851    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.298849  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3819  HflK protein  99.52 
 
 
419 aa  848    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0613795  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04003  hypothetical protein  99.76 
 
 
419 aa  851    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.317629  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4732  FtsH protease regulator HflK  99.76 
 
 
419 aa  851    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.938149  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5690  FtsH protease regulator HflK  99.76 
 
 
419 aa  851    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.440871  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4631  FtsH protease regulator HflK  93.79 
 
 
419 aa  709    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.130009  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0357  FtsH protease regulator HflK  86.02 
 
 
421 aa  656    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398708  hitchhiker  0.00429034 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4705  FtsH protease regulator HflK  99.76 
 
 
419 aa  851    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.714132  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4645  FtsH protease regulator HflK  100 
 
 
419 aa  853    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.14387 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4641  FtsH protease regulator HflK  93.56 
 
 
419 aa  707    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.641221  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4760  FtsH protease regulator HflK  93.56 
 
 
419 aa  707    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4781  FtsH protease regulator HflK  93.79 
 
 
419 aa  709    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.932984  normal  0.393456 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4724  FtsH protease regulator HflK  93.79 
 
 
419 aa  709    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3839  FtsH protease regulator HflK  99.76 
 
 
419 aa  851    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.910091  hitchhiker  0.000000232279 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4416  FtsH protease regulator HflK  99.76 
 
 
419 aa  851    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.953832  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0494  HflK protein  73.76 
 
 
420 aa  608  1e-173  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0869387  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0537  HflK protein  73.65 
 
 
418 aa  606  9.999999999999999e-173  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.141396  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3917  FtsH protease regulator HflK  78.71 
 
 
415 aa  589  1e-167  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.357327  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3719  FtsH protease regulator HflK  77.91 
 
 
420 aa  590  1e-167  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0503077  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0433  FtsH protease regulator HflK  78.47 
 
 
419 aa  582  1.0000000000000001e-165  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0562883  unclonable  0.0000000348967 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3796  FtsH protease regulator HflK  77.2 
 
 
420 aa  572  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0697  FtsH protease regulator HflK  77.62 
 
 
419 aa  572  1.0000000000000001e-162  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3651  FtsH protease regulator HflK  77.2 
 
 
420 aa  572  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0579  HflK protein  64.44 
 
 
386 aa  509  1e-143  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0487  HflK protein  56.57 
 
 
420 aa  411  1e-113  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3980  HflK protein  56.72 
 
 
382 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.758687  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0600  HflK protein  51.55 
 
 
381 aa  404  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0138092  hitchhiker  0.00143389 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3430  HflK protein  51.55 
 
 
381 aa  404  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0909026  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0560  HflK protein  54.02 
 
 
379 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000508673  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002261  HflK protein  54.32 
 
 
401 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0330443  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3538  HflK protein  53.42 
 
 
383 aa  397  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0107822  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3023  hflK protein  52.83 
 
 
377 aa  395  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000561401  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3203  HflK protein  54.95 
 
 
386 aa  396  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.143701  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2775  HflK protein  55.83 
 
 
407 aa  395  1e-109  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.631508  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2760  hflK protein  54.74 
 
 
395 aa  395  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.467094  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3765  HflK protein  54.02 
 
 
379 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000022736  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3891  HflK protein  54.02 
 
 
379 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000465537  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00092  serine protease  53.83 
 
 
401 aa  393  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3708  HflK protein  54.02 
 
 
379 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000788714  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3278  HflK protein  50.36 
 
 
380 aa  394  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010392  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0599  HflK protein  55.96 
 
 
381 aa  393  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0263631  hitchhiker  0.00000131875 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0568  HflK protein  51.79 
 
 
380 aa  389  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0118849  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0327  HflK protein  53.85 
 
 
382 aa  386  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0605  hflK protein  53.91 
 
 
381 aa  385  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3309  HflK protein  55.83 
 
 
386 aa  384  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0799  HflK protein  52.24 
 
 
381 aa  381  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223678  hitchhiker  0.00931868 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3236  HflK protein  52.79 
 
 
390 aa  381  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0144208  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00651  HflK complex with HflC  48.63 
 
 
383 aa  378  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.763897  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4168  HflK protein  53.74 
 
 
379 aa  374  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000320742  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2630  HflK protein  44.15 
 
 
414 aa  296  4e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.587706  unclonable  0.00000000000633953 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4940  hflK protein  42.12 
 
 
395 aa  296  5e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65280  protease subunit HflK  46.32 
 
 
400 aa  296  5e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1090  HflK protein  42.01 
 
 
405 aa  293  3e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5671  protease subunit HflK  46.05 
 
 
399 aa  293  5e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0574  HflK  43.42 
 
 
400 aa  292  6e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0525  HflK  44.09 
 
 
389 aa  291  1e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.325556  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0637  HflK protein  46.96 
 
 
389 aa  290  3e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0128609 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0899  HflK protein  44.54 
 
 
393 aa  286  4e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0975444  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1981  hflK protein  41.27 
 
 
403 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.245892  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2665  heat shock protein HslU  42.7 
 
 
386 aa  284  2.0000000000000002e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.288159  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4892  HflK protein  42.67 
 
 
405 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.42676  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4768  HflK protein  42.67 
 
 
393 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4683  HflK protein  44.62 
 
 
393 aa  279  6e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2767  HflK protein  45.96 
 
 
394 aa  279  6e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.397323  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0603  HflK  40.48 
 
 
395 aa  275  8e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2588  HflK-like protein  40.89 
 
 
413 aa  275  9e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0268051  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4944  HflK protein  43.13 
 
 
393 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499727 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1942  HflK protein  44.63 
 
 
406 aa  272  7e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0548  protease subunit HflK  42.12 
 
 
380 aa  270  2.9999999999999997e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1279  HflK protein  38.05 
 
 
452 aa  270  4e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.583527  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0524  protease subunit HflK  41.83 
 
 
380 aa  269  8.999999999999999e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0664  HflK protein  40.82 
 
 
395 aa  264  2e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119349  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1989  hypothetical protein  39.08 
 
 
435 aa  256  5e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.757808  normal  0.0447269 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1066  HflK protein  35.02 
 
 
477 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3383  HflK protein  37.06 
 
 
433 aa  253  3e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07560  membrane bound protease regulator HflK  46.9 
 
 
351 aa  253  5.000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1158  HflK protein  35.98 
 
 
475 aa  251  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2978  HflK  39.19 
 
 
436 aa  248  1e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.750881  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1879  HflK protein  35.73 
 
 
471 aa  247  2e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239775  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0445  HflK protein  37.37 
 
 
399 aa  247  3e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.713082  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1284  HflK protein  34.32 
 
 
503 aa  246  4.9999999999999997e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2099  HflK protein  36.66 
 
 
447 aa  246  6e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.080069 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5012  HflK protein  37.74 
 
 
464 aa  245  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0575  HflK protein  37.16 
 
 
459 aa  245  9.999999999999999e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.289879  hitchhiker  0.000000000363385 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2011  HflK protein  38.69 
 
 
378 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.166821  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1177  HflK protein  37.17 
 
 
451 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.621922 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1097  HflK protein  37.17 
 
 
451 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0073  HflK protein  34.6 
 
 
452 aa  243  3.9999999999999997e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.715541  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0673  HflK protein  31.25 
 
 
498 aa  242  9e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1222  hypothetical protein  36.09 
 
 
447 aa  238  1e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0015724  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2601  HflK protein  35.71 
 
 
474 aa  237  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.373557  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2079  HflK  36.29 
 
 
457 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2194  HflK protein  36.94 
 
 
456 aa  233  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1431  HflK protein  36.96 
 
 
471 aa  230  3e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.936066 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2300  HflK protein  35.52 
 
 
464 aa  230  5e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.194929  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1587  HflK protein  37.79 
 
 
391 aa  224  2e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  0.000000287062 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3670  HflK protein  37.9 
 
 
399 aa  219  7e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119308  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4005  HflK protein  34.75 
 
 
383 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.906349  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1664  HflK protein  32.92 
 
 
385 aa  209  6e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2861  HflK protein  36.21 
 
 
393 aa  208  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>