More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3917 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_0537  HflK protein  79.15 
 
 		 418 aa  640    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.141396  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3917  FtsH protease regulator HflK  100 
 
 		 415 aa  846    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.357327  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0494  HflK protein  80.99 
 
 		 420 aa  664    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0869387  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3719  FtsH protease regulator HflK  93.57 
 
 		 420 aa  696    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0503077  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04041  modulator for HflB protease specific for phage lambda cII repressor  78.71 
 
 		 419 aa  601  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.298849  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4416  FtsH protease regulator HflK  78.71 
 
 		 419 aa  601  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.953832  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4732  FtsH protease regulator HflK  78.71 
 
 		 419 aa  601  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.938149  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04003  hypothetical protein  78.71 
 
 		 419 aa  601  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.317629  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4724  FtsH protease regulator HflK  79.9 
 
 		 419 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3839  FtsH protease regulator HflK  78.71 
 
 		 419 aa  601  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.910091  hitchhiker  0.000000232279 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4760  FtsH protease regulator HflK  79.9 
 
 		 419 aa  601  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4705  FtsH protease regulator HflK  78.71 
 
 		 419 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.714132  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4645  FtsH protease regulator HflK  78.71 
 
 		 419 aa  601  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.14387 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4631  FtsH protease regulator HflK  79.9 
 
 		 419 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.130009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4781  FtsH protease regulator HflK  79.9 
 
 		 419 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.932984  normal  0.393456 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5690  FtsH protease regulator HflK  78.71 
 
 		 419 aa  601  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.440871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4641  FtsH protease regulator HflK  79.9 
 
 		 419 aa  601  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.641221  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3819  HflK protein  78.47 
 
 		 419 aa  598  1e-170  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0613795  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0433  FtsH protease regulator HflK  82.34 
 
 		 419 aa  598  1e-170  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0562883  unclonable  0.0000000348967 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0357  FtsH protease regulator HflK  77.38 
 
 		 421 aa  592  1e-168  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398708  hitchhiker  0.00429034 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0697  FtsH protease regulator HflK  76.72 
 
 		 419 aa  559  1e-158  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3651  FtsH protease regulator HflK  76.3 
 
 		 420 aa  559  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3796  FtsH protease regulator HflK  76.3 
 
 		 420 aa  559  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0579  HflK protein  65.71 
 
 		 386 aa  511  1e-143  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0487  HflK protein  55.26 
 
 		 420 aa  412  1e-114  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2775  HflK protein  52.82 
 
 		 407 aa  402  1e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.631508  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002261  HflK protein  53.98 
 
 		 401 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0330443  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0560  HflK protein  50.96 
 
 		 379 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000508673  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3203  HflK protein  54.59 
 
 		 386 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.143701  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0600  HflK protein  50 
 
 		 381 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0138092  hitchhiker  0.00143389 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3430  HflK protein  50 
 
 		 381 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0909026  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3891  HflK protein  51.2 
 
 		 379 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000465537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3708  HflK protein  51.2 
 
 		 379 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000788714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3765  HflK protein  51.2 
 
 		 379 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000022736  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00092  serine protease  53.48 
 
 		 401 aa  393  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3278  HflK protein  49.52 
 
 		 380 aa  391  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010392  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0599  HflK protein  50 
 
 		 381 aa  390  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0263631  hitchhiker  0.00000131875 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2760  hflK protein  52.99 
 
 		 395 aa  387  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.467094  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3538  HflK protein  49.88 
 
 		 383 aa  385  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0107822  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3980  HflK protein  51.41 
 
 		 382 aa  386  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.758687  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0605  hflK protein  53.2 
 
 		 381 aa  383  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3023  hflK protein  54.32 
 
 		 377 aa  380  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000561401  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0327  HflK protein  49 
 
 		 382 aa  380  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0568  HflK protein  52.16 
 
 		 380 aa  380  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0118849  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3309  HflK protein  49.16 
 
 		 386 aa  379  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3236  HflK protein  49.48 
 
 		 390 aa  377  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0144208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0799  HflK protein  50.65 
 
 		 381 aa  372  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223678  hitchhiker  0.00931868 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00651  HflK complex with HflC  51.19 
 
 		 383 aa  365  1e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.763897  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4168  HflK protein  52.09 
 
 		 379 aa  363  3e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000320742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2630  HflK protein  43.59 
 
 		 414 aa  290  2e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.587706  unclonable  0.00000000000633953 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65280  protease subunit HflK  46.03 
 
 		 400 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1090  HflK protein  40.45 
 
 		 405 aa  285  8e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0899  HflK protein  43.32 
 
 		 393 aa  285  9e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0975444  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1981  hflK protein  40.92 
 
 		 403 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.245892  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2665  heat shock protein HslU  40.81 
 
 		 386 aa  285  1.0000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.288159  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4940  hflK protein  42.42 
 
 		 395 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5671  protease subunit HflK  45.6 
 
 		 399 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2588  HflK-like protein  42.89 
 
 		 413 aa  281  1e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0268051  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0525  HflK  43.19 
 
 		 389 aa  281  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.325556  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0637  HflK protein  43.73 
 
 		 389 aa  281  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0128609 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0574  HflK  43.01 
 
 		 400 aa  279  8e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1942  HflK protein  41.87 
 
 		 406 aa  276  6e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4892  HflK protein  42.67 
 
 		 405 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.42676  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0548  protease subunit HflK  41.55 
 
 		 380 aa  270  2.9999999999999997e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4768  HflK protein  42.67 
 
 		 393 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0524  protease subunit HflK  41.26 
 
 		 380 aa  269  7e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2767  HflK protein  43.33 
 
 		 394 aa  269  7e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.397323  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4683  HflK protein  42.13 
 
 		 393 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4944  HflK protein  42.82 
 
 		 393 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499727 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1279  HflK protein  38.12 
 
 		 452 aa  261  2e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.583527  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0664  HflK protein  36.61 
 
 		 395 aa  259  5.0000000000000005e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119349  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0603  HflK  37.8 
 
 		 395 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1989  hypothetical protein  39.94 
 
 		 435 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.757808  normal  0.0447269 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3383  HflK protein  37.06 
 
 		 433 aa  253  6e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1066  HflK protein  35.51 
 
 		 477 aa  249  9e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1879  HflK protein  36.25 
 
 		 471 aa  247  2e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239775  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1158  HflK protein  36.64 
 
 		 475 aa  246  4e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2978  HflK  39.02 
 
 		 436 aa  246  6.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.750881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5012  HflK protein  37.22 
 
 		 464 aa  245  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0073  HflK protein  35.56 
 
 		 452 aa  244  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.715541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2099  HflK protein  37.74 
 
 		 447 aa  244  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.080069 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07560  membrane bound protease regulator HflK  44.22 
 
 		 351 aa  243  3.9999999999999997e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0445  HflK protein  38.72 
 
 		 399 aa  240  4e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.713082  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1284  HflK protein  33.5 
 
 		 503 aa  239  8e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1097  HflK protein  36.39 
 
 		 451 aa  239  9e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1177  HflK protein  36.39 
 
 		 451 aa  239  9e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.621922 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2601  HflK protein  36.69 
 
 		 474 aa  236  5.0000000000000005e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.373557  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0575  HflK protein  37.82 
 
 		 459 aa  236  6e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.289879  hitchhiker  0.000000000363385 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0673  HflK protein  31.07 
 
 		 498 aa  236  8e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2079  HflK  35.97 
 
 		 457 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2011  HflK protein  36.25 
 
 		 378 aa  235  1.0000000000000001e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.166821  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1222  hypothetical protein  37.24 
 
 		 447 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0015724  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2194  HflK protein  36.63 
 
 		 456 aa  231  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1587  HflK protein  38.73 
 
 		 391 aa  231  2e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000287062 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1431  HflK protein  38.1 
 
 		 471 aa  228  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.936066 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2300  HflK protein  36.86 
 
 		 464 aa  223  6e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.194929  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1413  HflK protein  34.25 
 
 		 465 aa  218  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.843638  hitchhiker  0.0000076277 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1601  FtsH protease activity modulator HflK  33.06 
 
 		 460 aa  211  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.559516  normal  0.13244 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1664  HflK protein  33.5 
 
 		 385 aa  210  3e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2182  HflK protein  35.08 
 
 		 454 aa  210  4e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>