More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1664 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1664  HflK protein  100 
 
 
385 aa  776    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3262  HflK protein  64.75 
 
 
383 aa  489  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.264682  normal  0.260183 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4005  HflK protein  64.77 
 
 
383 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.906349  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2728  HflK protein  61.01 
 
 
385 aa  476  1e-133  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3352  HflK protein  63.61 
 
 
389 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.154635 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2038  HflK protein  64.92 
 
 
390 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal  0.793303 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2349  HflK  61.15 
 
 
382 aa  431  1e-119  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6097  protease activity modulator HflK  65.34 
 
 
379 aa  427  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0604  HflK protein  56.53 
 
 
368 aa  363  2e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0450848 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0701  HflK protein  54.72 
 
 
389 aa  363  4e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.704502  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2203  HflK  53.04 
 
 
407 aa  358  7e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1730  HflK protein  51.93 
 
 
389 aa  353  2.9999999999999997e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000348315 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1089  HflK protein  53.89 
 
 
386 aa  348  1e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0604271 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2458  HflK protein  51.1 
 
 
398 aa  345  1e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0761893 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2780  HflK protein  53.3 
 
 
379 aa  335  1e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.224376 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4527  HflK protein  50 
 
 
394 aa  322  8e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2658  HflK protein  55.03 
 
 
382 aa  315  8e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2885  HflK protein  55.03 
 
 
382 aa  315  8e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0263  HflK protein  46.96 
 
 
360 aa  293  3e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3384  HflK protein  48.73 
 
 
359 aa  286  2.9999999999999996e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.16512  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1573  HflK protein  41.99 
 
 
367 aa  283  5.000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000427817  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2946  HflK protein  48.01 
 
 
359 aa  279  7e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0486  HflK protein  44.61 
 
 
361 aa  278  1e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.333714 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1749  HflK protein  45.21 
 
 
376 aa  276  3e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.254466  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2674  HflK protein  45.12 
 
 
388 aa  272  6e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0162976 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1353  band 7 protein:stomatin  42.23 
 
 
384 aa  271  1e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.792313  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1794  HflK protein  41.85 
 
 
383 aa  269  5e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.301305  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0885  HflK protein  40.53 
 
 
394 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.240559 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2736  Protein HflK  42.86 
 
 
382 aa  268  8e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.12799  normal  0.0330194 
 
 
-
 
NC_002978  WD0831  hflK protein  42.94 
 
 
344 aa  267  2e-70  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.604081  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1397  hflK protein  41.96 
 
 
382 aa  268  2e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2001  HflK protein  41.26 
 
 
393 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.610891  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0357  HflK protein  41.26 
 
 
393 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.24266  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2018  HflK protein  44.15 
 
 
362 aa  266  4e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2024  HflK protein  46.37 
 
 
379 aa  265  1e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3670  HflK protein  42.6 
 
 
399 aa  264  2e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119308  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1090  HflK protein  41.95 
 
 
405 aa  262  8.999999999999999e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2818  HFLK protein  42 
 
 
383 aa  259  4e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44638  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0866  HflK protein  45.64 
 
 
387 aa  258  9e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0134837  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1981  hflK protein  42 
 
 
403 aa  256  5e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.245892  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0899  HflK protein  41.14 
 
 
393 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0975444  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2541  HflK protein  42.23 
 
 
362 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0603  HflK  40.94 
 
 
395 aa  253  3e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2800  HflK protein  43.66 
 
 
360 aa  253  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182223  normal  0.400207 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0843  HflK  39.64 
 
 
355 aa  253  5.000000000000001e-66  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2279  HflK protein  43.41 
 
 
378 aa  247  2e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3383  HflK protein  36.39 
 
 
433 aa  247  3e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1050  hflK protein  40.24 
 
 
357 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3173  HflK protein  40.77 
 
 
394 aa  243  3.9999999999999997e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0445  HflK protein  38.61 
 
 
399 aa  241  1e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.713082  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1956  HflK protein  39.39 
 
 
387 aa  242  1e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.733622  normal  0.100531 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2588  HflK-like protein  41.11 
 
 
413 aa  239  4e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0268051  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1587  HflK protein  41.41 
 
 
391 aa  240  4e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  0.000000287062 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1561  HflK protein  45.64 
 
 
397 aa  239  8e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.920628  hitchhiker  0.00000000145898 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1886  hflK protein  45.64 
 
 
397 aa  239  8e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3344  HflK protein  44.73 
 
 
370 aa  238  9e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.405881  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0164  HflK protein  40.3 
 
 
347 aa  238  2e-61  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00000564548  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2978  HflK  37.63 
 
 
436 aa  237  3e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.750881  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0575  HflK protein  36.89 
 
 
459 aa  229  5e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.289879  hitchhiker  0.000000000363385 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1942  HflK protein  37.6 
 
 
406 aa  228  1e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1284  HflK protein  39.04 
 
 
503 aa  223  4.9999999999999996e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5012  HflK protein  36.64 
 
 
464 aa  223  6e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2099  HflK protein  34.44 
 
 
447 aa  219  5e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.080069 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0073  HflK protein  35.77 
 
 
452 aa  219  7.999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.715541  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1879  HflK protein  36.91 
 
 
471 aa  218  1e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239775  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0664  HflK protein  36.77 
 
 
395 aa  218  1e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119349  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5671  protease subunit HflK  36.91 
 
 
399 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0673  HflK protein  38.01 
 
 
498 aa  218  2e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0560  HflK protein  34.61 
 
 
379 aa  216  4e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000508673  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1431  HflK protein  41.69 
 
 
471 aa  216  4e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.936066 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65280  protease subunit HflK  36.54 
 
 
400 aa  217  4e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2601  HflK protein  37.53 
 
 
474 aa  216  5e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.373557  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0525  HflK  36.41 
 
 
389 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.325556  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1989  hypothetical protein  36.53 
 
 
435 aa  215  9e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.757808  normal  0.0447269 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2775  HflK protein  34.35 
 
 
407 aa  215  9e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.631508  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1177  HflK protein  36.87 
 
 
451 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.621922 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1097  HflK protein  36.87 
 
 
451 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2767  HflK protein  35.08 
 
 
394 aa  214  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.397323  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2079  HflK  34.99 
 
 
457 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2262  HflK protein  37.94 
 
 
333 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015812  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0327  HflK protein  35.43 
 
 
382 aa  214  2.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2760  hflK protein  39.93 
 
 
395 aa  214  2.9999999999999995e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.467094  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2665  heat shock protein HslU  35.47 
 
 
386 aa  214  2.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.288159  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3430  HflK protein  32.91 
 
 
381 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0909026  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3891  HflK protein  34.16 
 
 
379 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000465537  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3765  HflK protein  34.16 
 
 
379 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000022736  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0600  HflK protein  32.91 
 
 
381 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0138092  hitchhiker  0.00143389 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3708  HflK protein  34.16 
 
 
379 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000788714  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1066  HflK protein  35.71 
 
 
477 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2861  HflK protein  41.55 
 
 
393 aa  213  4.9999999999999996e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1107  HflK protein  35.22 
 
 
308 aa  212  7.999999999999999e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0665  HflK protein  35.28 
 
 
322 aa  212  9e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2194  HflK protein  38.36 
 
 
456 aa  212  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4940  hflK protein  36.39 
 
 
395 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0999  HflK protein  35.22 
 
 
308 aa  211  1e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0568  HflK protein  33.88 
 
 
380 aa  211  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0118849  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1158  HflK protein  34.75 
 
 
475 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00092  serine protease  36.6 
 
 
401 aa  210  3e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002261  HflK protein  36.1 
 
 
401 aa  210  4e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0330443  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0637  HflK protein  35.67 
 
 
389 aa  210  4e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0128609 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>