More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3262 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3262  HflK protein  100 
 
 		 383 aa  770    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.264682  normal  0.260183 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3352  HflK protein  86.96 
 
 		 389 aa  649    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.154635 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4005  HflK protein  84.07 
 
 		 383 aa  663    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.906349  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2728  HflK protein  80 
 
 		 385 aa  634  1e-180  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2038  HflK protein  85.95 
 
 		 390 aa  622  1e-177  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal  0.793303 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2349  HflK  79.37 
 
 		 382 aa  596  1e-169  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6097  protease activity modulator HflK  78.69 
 
 		 379 aa  523  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1664  HflK protein  64.75 
 
 		 385 aa  490  1e-137  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0604  HflK protein  55.11 
 
 		 368 aa  375  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0450848 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2203  HflK  54.68 
 
 		 407 aa  370  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1730  HflK protein  50.4 
 
 		 389 aa  366  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000348315 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2458  HflK protein  52.56 
 
 		 398 aa  362  5.0000000000000005e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0761893 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0701  HflK protein  52.25 
 
 		 389 aa  353  4e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.704502  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1089  HflK protein  52.17 
 
 		 386 aa  347  2e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0604271 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2780  HflK protein  49.28 
 
 		 379 aa  325  9e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.224376 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4527  HflK protein  47.61 
 
 		 394 aa  312  6.999999999999999e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2658  HflK protein  49.26 
 
 		 382 aa  311  7.999999999999999e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2885  HflK protein  49.26 
 
 		 382 aa  311  7.999999999999999e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0263  HflK protein  45.35 
 
 		 360 aa  281  2e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1749  HflK protein  43.6 
 
 		 376 aa  276  4e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.254466  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2946  HflK protein  49.33 
 
 		 359 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2024  HflK protein  45.98 
 
 		 379 aa  275  1.0000000000000001e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3670  HflK protein  41.36 
 
 		 399 aa  273  5.000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2736  Protein HflK  42.13 
 
 		 382 aa  273  5.000000000000001e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.12799  normal  0.0330194 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2674  HflK protein  44.18 
 
 		 388 aa  262  8e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0162976 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0486  HflK protein  43.67 
 
 		 361 aa  262  8.999999999999999e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.333714 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1573  HflK protein  40.21 
 
 		 367 aa  260  4e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000427817  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1981  hflK protein  39.95 
 
 		 403 aa  259  6e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.245892  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0357  HflK protein  40.06 
 
 		 393 aa  258  1e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.24266  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1353  band 7 protein:stomatin  42.74 
 
 		 384 aa  258  1e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.792313  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2001  HflK protein  40.06 
 
 		 393 aa  258  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.610891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0885  HflK protein  39.95 
 
 		 394 aa  257  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.240559 
 
 
-
 
NC_004310  BR1397  hflK protein  42.46 
 
 		 382 aa  256  6e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1090  HflK protein  39.01 
 
 		 405 aa  255  8e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3384  HflK protein  41.55 
 
 		 359 aa  255  8e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.16512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2818  HFLK protein  42.69 
 
 		 383 aa  254  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44638  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1794  HflK protein  42.46 
 
 		 383 aa  252  7e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.301305  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1956  HflK protein  39.83 
 
 		 387 aa  252  8.000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.733622  normal  0.100531 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2018  HflK protein  43.07 
 
 		 362 aa  252  9.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0899  HflK protein  39.75 
 
 		 393 aa  251  2e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0975444  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0603  HflK  40.33 
 
 		 395 aa  249  4e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0866  HflK protein  44.08 
 
 		 387 aa  247  2e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0134837  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0831  hflK protein  39.6 
 
 		 344 aa  247  3e-64  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.604081  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3173  HflK protein  40.51 
 
 		 394 aa  247  3e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0843  HflK  40.16 
 
 		 355 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2588  HflK-like protein  39.04 
 
 		 413 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0268051  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3383  HflK protein  36.64 
 
 		 433 aa  238  1e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1050  hflK protein  39.84 
 
 		 357 aa  237  2e-61  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2279  HflK protein  44.26 
 
 		 378 aa  237  2e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3344  HflK protein  41.98 
 
 		 370 aa  235  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.405881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1587  HflK protein  39.06 
 
 		 391 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000287062 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0445  HflK protein  37.5 
 
 		 399 aa  233  3e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.713082  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2800  HflK protein  39.43 
 
 		 360 aa  233  6e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182223  normal  0.400207 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2541  HflK protein  38.64 
 
 		 362 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2978  HflK  39.37 
 
 		 436 aa  232  8.000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.750881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1942  HflK protein  37.66 
 
 		 406 aa  228  1e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0664  HflK protein  39.65 
 
 		 395 aa  224  1e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119349  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0525  HflK  35.54 
 
 		 389 aa  224  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.325556  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4940  hflK protein  36.01 
 
 		 395 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1284  HflK protein  39.42 
 
 		 503 aa  219  7.999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2099  HflK protein  37.57 
 
 		 447 aa  218  8.999999999999998e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.080069 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0574  HflK  35.66 
 
 		 400 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2665  heat shock protein HslU  34.61 
 
 		 386 aa  215  9e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.288159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2262  HflK protein  38.48 
 
 		 333 aa  215  9.999999999999999e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015812  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0164  HflK protein  37.69 
 
 		 347 aa  215  9.999999999999999e-55  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00000564548  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5012  HflK protein  36.46 
 
 		 464 aa  214  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0637  HflK protein  33.6 
 
 		 389 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0128609 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0673  HflK protein  39.41 
 
 		 498 aa  213  4.9999999999999996e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1989  hypothetical protein  36.54 
 
 		 435 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.757808  normal  0.0447269 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1561  HflK protein  43.06 
 
 		 397 aa  212  7e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.920628  hitchhiker  0.00000000145898 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1886  hflK protein  43.06 
 
 		 397 aa  212  7e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2767  HflK protein  33.86 
 
 		 394 aa  212  9e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.397323  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07560  membrane bound protease regulator HflK  39.06 
 
 		 351 aa  210  4e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1066  HflK protein  38.48 
 
 		 477 aa  209  5e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4768  HflK protein  34.62 
 
 		 393 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4892  HflK protein  34.62 
 
 		 405 aa  209  6e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.42676  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1158  HflK protein  38.32 
 
 		 475 aa  209  8e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4683  HflK protein  34.83 
 
 		 393 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2775  HflK protein  34.42 
 
 		 407 aa  208  1e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.631508  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0537  HflK protein  36.67 
 
 		 418 aa  207  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.141396  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0575  HflK protein  34.17 
 
 		 459 aa  207  3e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.289879  hitchhiker  0.000000000363385 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4944  HflK protein  34.56 
 
 		 393 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499727 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5671  protease subunit HflK  34.21 
 
 		 399 aa  206  6e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0494  HflK protein  34.97 
 
 		 420 aa  206  7e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0869387  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1222  hypothetical protein  41.43 
 
 		 447 aa  205  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0015724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0560  HflK protein  32.91 
 
 		 379 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000508673  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1097  HflK protein  35.13 
 
 		 451 aa  205  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1177  HflK protein  35.13 
 
 		 451 aa  205  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.621922 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65280  protease subunit HflK  34.12 
 
 		 400 aa  205  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1107  HflK protein  37.62 
 
 		 308 aa  204  2e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0999  HflK protein  37.62 
 
 		 308 aa  204  2e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2630  HflK protein  36.22 
 
 		 414 aa  202  6e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.587706  unclonable  0.00000000000633953 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3430  HflK protein  32.54 
 
 		 381 aa  202  9e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0909026  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2011  HflK protein  36.96 
 
 		 378 aa  201  9.999999999999999e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.166821  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1431  HflK protein  36.59 
 
 		 471 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.936066 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1879  HflK protein  34.87 
 
 		 471 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239775  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0605  hflK protein  33.33 
 
 		 381 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2601  HflK protein  36.05 
 
 		 474 aa  200  3.9999999999999996e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.373557  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0600  HflK protein  32.28 
 
 		 381 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0138092  hitchhiker  0.00143389 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2079  HflK  36.07 
 
 		 457 aa  199  6e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>