More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3670 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008687  Pden_3670  HflK protein  100 
 
 
399 aa  792    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119308  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2001  HflK protein  72.65 
 
 
393 aa  481  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.610891  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0357  HflK protein  72.08 
 
 
393 aa  480  1e-134  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.24266  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0885  HflK protein  70.95 
 
 
394 aa  478  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.240559 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2736  Protein HflK  61.92 
 
 
382 aa  411  1e-114  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.12799  normal  0.0330194 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1956  HflK protein  61.11 
 
 
387 aa  395  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.733622  normal  0.100531 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3173  HflK protein  56.13 
 
 
394 aa  371  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2018  HflK protein  46.29 
 
 
362 aa  289  7e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1353  band 7 protein:stomatin  47.13 
 
 
384 aa  286  2.9999999999999996e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.792313  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1397  hflK protein  46.84 
 
 
382 aa  283  3.0000000000000004e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1794  HflK protein  45.53 
 
 
383 aa  276  5e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.301305  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2818  HFLK protein  43.18 
 
 
383 aa  273  3e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44638  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4005  HflK protein  42.3 
 
 
383 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.906349  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0604  HflK protein  41.49 
 
 
368 aa  270  4e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0450848 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3262  HflK protein  43.38 
 
 
383 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.264682  normal  0.260183 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1730  HflK protein  38.9 
 
 
389 aa  266  4e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000348315 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3352  HflK protein  44.04 
 
 
389 aa  266  4e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.154635 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2728  HflK protein  40.61 
 
 
385 aa  265  8.999999999999999e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1664  HflK protein  42.11 
 
 
385 aa  263  4.999999999999999e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2038  HflK protein  42.97 
 
 
390 aa  258  9e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal  0.793303 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2349  HflK  40.43 
 
 
382 aa  257  2e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2203  HflK  40.78 
 
 
407 aa  251  2e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6097  protease activity modulator HflK  40.28 
 
 
379 aa  248  9e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2458  HflK protein  41.13 
 
 
398 aa  246  4.9999999999999997e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0761893 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2800  HflK protein  41.79 
 
 
360 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182223  normal  0.400207 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2024  HflK protein  44.98 
 
 
379 aa  240  4e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1981  hflK protein  39.84 
 
 
403 aa  239  8e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.245892  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1284  HflK protein  35.09 
 
 
503 aa  237  2e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1090  HflK protein  36.75 
 
 
405 aa  238  2e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1089  HflK protein  39.29 
 
 
386 aa  233  7.000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0604271 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0603  HflK  39.12 
 
 
395 aa  231  2e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4527  HflK protein  41.41 
 
 
394 aa  231  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1749  HflK protein  37.84 
 
 
376 aa  230  4e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.254466  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0701  HflK protein  39.45 
 
 
389 aa  229  6e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.704502  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0673  HflK protein  34.7 
 
 
498 aa  228  2e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2780  HflK protein  39.37 
 
 
379 aa  228  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.224376 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3383  HflK protein  39.74 
 
 
433 aa  228  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2541  HflK protein  40.35 
 
 
362 aa  227  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2099  HflK protein  39.89 
 
 
447 aa  226  4e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.080069 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0843  HflK  35.36 
 
 
355 aa  224  1e-57  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2978  HflK  39.51 
 
 
436 aa  222  9e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.750881  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0664  HflK protein  36.32 
 
 
395 aa  218  1e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119349  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2658  HflK protein  38.72 
 
 
382 aa  216  5e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2885  HflK protein  38.91 
 
 
382 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2665  heat shock protein HslU  38.27 
 
 
386 aa  216  5.9999999999999996e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.288159  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0899  HflK protein  41.36 
 
 
393 aa  216  7e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0975444  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2079  HflK  38.15 
 
 
457 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2767  HflK protein  36.46 
 
 
394 aa  214  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.397323  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1066  HflK protein  36.43 
 
 
477 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1050  hflK protein  35.08 
 
 
357 aa  213  5.999999999999999e-54  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2946  HflK protein  41.32 
 
 
359 aa  211  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0831  hflK protein  34.1 
 
 
344 aa  209  5e-53  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.604081  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2674  HflK protein  38.69 
 
 
388 aa  209  5e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0162976 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1158  HflK protein  37.61 
 
 
475 aa  209  6e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1573  HflK protein  37.01 
 
 
367 aa  208  1e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000427817  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1222  hypothetical protein  39.11 
 
 
447 aa  207  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0015724  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0574  HflK  36.8 
 
 
400 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0263  HflK protein  36.7 
 
 
360 aa  207  2e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0494  HflK protein  35.71 
 
 
420 aa  206  5e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0869387  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0866  HflK protein  36.22 
 
 
387 aa  204  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0134837  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4940  hflK protein  36.1 
 
 
395 aa  204  3e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0537  HflK protein  34.18 
 
 
418 aa  204  3e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.141396  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0575  HflK protein  36.81 
 
 
459 aa  204  3e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.289879  hitchhiker  0.000000000363385 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0445  HflK protein  39.36 
 
 
399 aa  202  6e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.713082  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2588  HflK-like protein  37.11 
 
 
413 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0268051  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0164  HflK protein  38.46 
 
 
347 aa  202  9.999999999999999e-51  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00000564548  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65280  protease subunit HflK  36.02 
 
 
400 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5671  protease subunit HflK  36.04 
 
 
399 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4645  FtsH protease regulator HflK  39.45 
 
 
419 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.14387 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4683  HflK protein  36.76 
 
 
393 aa  199  6e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2630  HflK protein  35.31 
 
 
414 aa  199  7e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.587706  unclonable  0.00000000000633953 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04041  modulator for HflB protease specific for phage lambda cII repressor  39.1 
 
 
419 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.298849  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4416  FtsH protease regulator HflK  39.1 
 
 
419 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.953832  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04003  hypothetical protein  39.1 
 
 
419 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.317629  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4732  FtsH protease regulator HflK  39.1 
 
 
419 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.938149  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3839  FtsH protease regulator HflK  39.1 
 
 
419 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.910091  hitchhiker  0.000000232279 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5690  FtsH protease regulator HflK  39.1 
 
 
419 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.440871  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4705  FtsH protease regulator HflK  39.1 
 
 
419 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.714132  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4892  HflK protein  36.8 
 
 
405 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.42676  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4944  HflK protein  36.8 
 
 
393 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499727 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4768  HflK protein  36.8 
 
 
393 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07560  membrane bound protease regulator HflK  38.57 
 
 
351 aa  197  3e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1942  HflK protein  38.73 
 
 
406 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3384  HflK protein  39.46 
 
 
359 aa  196  5.000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.16512  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0073  HflK protein  34.16 
 
 
452 aa  196  7e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.715541  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4781  FtsH protease regulator HflK  35.87 
 
 
419 aa  196  8.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.932984  normal  0.393456 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4724  FtsH protease regulator HflK  35.87 
 
 
419 aa  196  8.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4631  FtsH protease regulator HflK  35.87 
 
 
419 aa  196  8.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.130009  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4641  FtsH protease regulator HflK  35.87 
 
 
419 aa  196  8.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.641221  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3819  HflK protein  38.75 
 
 
419 aa  196  9e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0613795  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4760  FtsH protease regulator HflK  35.87 
 
 
419 aa  195  9e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0487  HflK protein  31.9 
 
 
420 aa  196  9e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1989  hypothetical protein  37.6 
 
 
435 aa  194  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.757808  normal  0.0447269 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1431  HflK protein  36.01 
 
 
471 aa  195  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.936066 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2249  HflK protein  39.38 
 
 
386 aa  194  3e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2861  HflK protein  40.21 
 
 
393 aa  193  5e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0560  HflK protein  36.16 
 
 
379 aa  193  5e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000508673  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0525  HflK  35.68 
 
 
389 aa  192  9e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.325556  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3333  HflK protein  36 
 
 
374 aa  192  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1097  HflK protein  34.27 
 
 
451 aa  191  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>